Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465921
- Subject:
- XR_001751188.2
- Aligned Length:
- 1713
- Identities:
- 1080
- Gaps:
- 633
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 CTGGTCTCTGATAACGGGATGGGTGGTGCTGGACCTCGGGCGGGGCCGGGCCTCGTGGCGGGAGGAGGCAGGGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGGGCCTCTGGGACGGGGCTGGACGGCTTGTTGACGGAAACGAGCCCTTGACGCTGTGGCCCGGAAGTGGAGCG 148
Query 1 --------------------------------------------------------------------ATGGCG 6
||||||
Sbjct 149 GCTGTCGCAGTGCGGCTCCGGCAGTGGCAGCGGAGGCCTGTGTTTGCGGCCTTCGGCAAGCGACTGAGATGGCG 222
Query 7 AGCGCAACTGCACCTGCAGCCGCAGTCCCCACCCTGGCTTCGCCTTTGGAGCAGCTCCGGCACTTGGCGGAGGA 80
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGCGCAACTGCACCTGCAGCCGCAGTCCCCACCCTGGCTTCGCCTTTGGAGCAGCTCCGGCACTTGGCGGAGGA 296
Query 81 GCTGCGGTTGCTCCTGCCTCGAGTGCGGGTCGGCGAAGCCCAGGAGACCACCGAGGAGTTTAATCGAGAGATGT 154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCTGCGGTTGCTCCTGCCTCGAGTGCGGGTCGGCGAAGCCCAGGAGACCACCGAGGAGTTTAATCGAGAGATGT 370
Query 155 TCTGGAGAAGACTCAATGAGGCAGCTGTGACTGTGTCAAGGGAAGCCACGACTCTGACCATAGTCTTCTCTCAG 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTGGAGAAGACTCAATGAGGCAGCTGTGACTGTGTCAAGGGAAGCCACGACTCTGACCATAGTCTTCTCTCAG 444
Query 229 CTTCCACTGCCGTCTCCACAGGAAACCCAGAAGTTCTGTGAACAAGTCCATGCTGCCATCAAGGCATTTATTGC 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTTCCACTGCCGTCTCCACAGGAAACCCAGAAGTTCTGTGAACAAGTCCATGCTGCCATCAAGGCATTTATTGC 518
Query 303 AGTGTACTATTTGCTTCCAAAGGATCAGGGGATCACCCTGAGAAAGCTGGTACGGGGCGCCACCCTGGACATCG 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGTGTACTATTTGCTTCCAAAGGATCAGGGGATCACCCTGAGAAAGCTGGTACGGGGCGCCACCCTGGACATCG 592
Query 377 TGGATGGCATGGCTCAGCTCATGGAAGTACTTTCCGTCACTCCAACTCAGAGCCCTGAGAACAATGACCTTATT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGATGGCATGGCTCAGCTCATGGAAGTACTTTCCGTCACTCCAACTCAGAGCCCTGAGAACAATGACCTTATT 666
Query 451 TCCTACAACAGTGTCTGGGTTGCGTGCCAGCAGATGCCTCAGATACCAAGAGATAACAAAGCTGCAGCTCTTTT 524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCCTACAACAGTGTCTGGGTTGCGTGCCAGCAGATGCCTCAGATACCAAGAGATAACAAAGCTGCAGCTCTTTT 740
Query 525 GATGCTGACCAAGAATGTGGATTTTGTGAAGGATGCACATGAAGAAATGGAGCAGGCTGTGGAAGAATGTGACC 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GATGCTGACCAAGAATGTGGATTTTGTGAAGGATGCACATGAAGAAATGGAGCAGGCTGTGGAAGAATGTGACC 814
Query 599 CTTACTCTGGCCTCTTGAATGATACTGAGGAGAACAACTCTGACAACCACAATCATGAGGATGATGTGTTGGGG 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTTACTCTGGCCTCTTGAATGATACTGAGGAGAACAACTCTGACAACCACAATCATGAGGATGATGTGTTGGGG 888
Query 673 TTTCCCAGCAATCAGGACTTGTATTGGTCAGAGGACGATCAAGAGCTCATAATCCCATGCCTTGCGCTGGTGAG 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTCCCAGCAATCAGGACTTGTATTGGTCAGAGGACGATCAAGAGCTCATAATCCCATGCCTTGCGCTGGTGAG 962
Query 747 AGCATCCAAAGCCTGCCTGAAGAAAATTCGGATGTTAGTGGCAGAGAATGGGAAGAAGGATCAGGTGGCACAGC 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGCATCCAAAGCCTGCCTGAAGAAAATTCGGATGTTAGTGGCAGAGAATGGGAAGAAGGATCAGGTGGCACAGC 1036
Query 821 TGGATGACATTGTGGATATTTCTGATGAAATCAGCCCTAGTGTGGATGATTTGGCTCTGAGCATATATCCACCT 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGATGACATTGTGGATATTTCTGATGAAATCAGCCCTAGTGTGGATGATTTGGCTCTGAGCATATATCCACCT 1110
Query 895 ATGTGTCACCTGACCGTGCGAATCAAT----------------------------------------------- 921
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATGTGTCACCTGACCGTGCGAATCAATGAACCTTAGTCATTTCTGCTTTATATTTTGAGCTATCAGCATTTGGG 1184
Query 922 ----------TCTGCGAAACTTGTATCTGTTTTAAAGAAGGCACTTGAAATTACAAAAGCAAGTCATGTGACCC 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACCAATTCAGTCTGCGAAACTTGTATCTGTTTTAAAGAAGGCACTTGAAATTACAAAAGCAAGTCATGTGACCC 1258
Query 986 CTCAGCCAGAAGATAGTTGGATCCCTTTACTTATTAATGCCATTGATCATTGCATGAATAGAATCAAGGAGCTC 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTCAGCCAGAAGATAGTTGGATCCCTTTACTTATTAATGCCATTGATCATTGCATGAATAGAATCAAGGAGCTC 1332
Query 1060 ACTCAGAGTGAACTTGAATTA----------------------------------------------------- 1080
|||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTCAGAGTGAACTTGAATTATGACTTTTCAGGCTCATTTGTACTCTCTTCCCCTCTCATCGTCATGGTCAGGC 1406
Query 1081 -------------------------------------------------------------------------- 1080
Sbjct 1407 TCTGATACCTGCTTTTAAAATGGAGCTAGAATGCTTGCTGGATTGAAAGGGAGTGCCTATCTATATTTAGCAAG 1480
Query 1081 -------------------------------------------------------------------------- 1080
Sbjct 1481 AGACACTATTACCAAAGATTGTTGGTTAGGCCAGATTGACACCTATTTATAAACCATATGCGTATATTTTTCTG 1554
Query 1081 -------------------------------------------------------------------------- 1080
Sbjct 1555 TGCTATATATGAAAAATAATTGCATGATTTCTCATTCCTGAGTCATTTCTCAGAGATTCCTAGGAAAGCTGCCT 1628
Query 1081 -------------------------------------------------------------------------- 1080
Sbjct 1629 TATTCTCTTTTTGCAGTAAAGTATGTTGTTTTCATTGTAAAGATGTTGATGGTCTCAATAAAATGCTAACTTGC 1702
Query 1081 ----------- 1080
Sbjct 1703 CAGTGATTAAA 1713