Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467859
• Subject: XM_017019775.2
• Aligned Length: 1224
• Identities: 1159
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGCTGCTATCCGTGACTTCCAGGCCCGGGATTTCGACTTTTGGCTACAATAGAAACAACAAGA---AGCCATA  71
                                                                        |.||   |||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------ATGATTCAGCCATA  14

Query   72  TGTGTCACTGGCTCAGCAGATGGCACCACCTAGCCCAAGCAACAGTACACCTAACAGCAGTAGTGGAAGCAATG  145
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   15  TGTGTCATTGGCTCAGCAGATGGCACCACCTAGCCCAAGCAACAGTACACCTAACAGCAGTAGTGGAAGCAATG  88

Query  146  GAAATGACCAGCTGAGCAAAACCAACCTATACATCCGAGGATTGCAACCAGGCACTACTGACCAAGATCTTGTC  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   89  GAAATGACCAGCTGAGCAAAACCAACCTATACATCCGAGGATTGCAACCAGGCACTACTGACCAAGATCTTGTC  162

Query  220  AAGCTGTGTCAGCCATATGGCAAGATTGTTTCCACTAAGGCCATACTGGACAAGACCACAAACAAATGTAAAGG  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  163  AAGCTGTGTCAGCCATATGGCAAGATTGTTTCCACTAAGGCCATACTGGACAAGACCACAAACAAATGTAAAGG  236

Query  294  CTATGGCTTTGTAGATTTTGACAGCCCTTCAGCAGCACAGAAAGCTGTAACAGCACTGAAGGCCAGCGGTGTAC  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  237  CTATGGCTTTGTAGATTTTGACAGCCCTTCAGCAGCACAGAAAGCTGTAACAGCACTGAAGGCCAGCGGTGTAC  310

Query  368  AGGCACAGATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGAT  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  311  AGGCACAGATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGAT  384

Query  442  GAGCAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGG  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  385  GAGCAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGG  458

Query  516  GACCAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATG  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  459  GACCAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATG  532

Query  590  GAAAATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  533  GAAAATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGG  606

Query  664  CCAAAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGT  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  607  CCAAAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGT  680

Query  738  CATGGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCA  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  681  CATGGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCA  754

Query  812  ACAGGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAG  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  755  ACAGGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAG  828

Query  886  ACATCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGT  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  829  ACATCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGT  902

Query  960  TCTGACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  903  TCTGACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGG  976

Query 1034  GCCATCTCTCCCTCAGCAGCACAGGCACGTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  977  GCCATCTCTCCCTCAGCAGCACAGGCACGTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAG  1050

Query 1108  TACACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGAGAGCAGCGGCCAACAGAACCAAGTGGCAGTGGACGC  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051  TACACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGAGAGCAGCGGCCAACAGAACCAAGTGGCAGTGGACGC  1124

Query 1182  ACCCTCAGAGCATGGGGTCTATTCTTTCCAGTTCAACAAG  1221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125  ACCCTCAGAGCATGGGGTCTATTCTTTCCAGTTCAACAAG  1164