Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467871
• Subject: XM_005247463.5
• Aligned Length: 1239
• Identities: 1110
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGGCTGTTAGTGTCACACCAATTCGGGACACAAAATGGCTAACACTGGAAGTATGTAGAGAGTTCCAGAGGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGTTAGTGTCACACCAATTCGGGACACAAAATGGCTAACACTGGAAGTATGTAGAGAGTTCCAGAGGGG  74

Query   75  GACTTGCTCACGGCCAGACACGGAATGTAAATTTGCACATCCTTCGAAAAGCTGCCAAGTTGAAAATGGACGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACTTGCTCACGGCCAGACACGGAATGTAAATTTGCACATCCTTCGAAAAGCTGCCAAGTTGAAAATGGACGAG  148

Query  149  TAATCGCCTGCTTTGATTCATTGAAA------------------------------------------------  174
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct  149  TAATCGCCTGCTTTGATTCATTGAAAGCCAGAGCCACGCATTTTATGGAAAATGTAACTAGAAGTAAGGTGCTG  222

Query  175  ---------------------------------------------GGCCGTTGCTCCAGGGAGAACTGCAAATA  203
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACTGCTGCTACAGCACCTTACCTGAGGCACAAACTTTGTTGCATGGCCGTTGCTCCAGGGAGAACTGCAAATA  296

Query  204  TCTTCATCCACCCCCACATTTAAAAACGCAGTTGGAGATAAATGGACGCAATAACTTGATTCAGCAGAAGAACA  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTTCATCCACCCCCACATTTAAAAACGCAGTTGGAGATAAATGGACGCAATAACTTGATTCAGCAGAAGAACA  370

Query  278  TGGCCATGTTGGCCCAGCAAATGCAACTAGCCAATGCCATGATGCCTGGTGCCCCATTACAACCCGTGCCAATG  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGCCATGTTGGCCCAGCAAATGCAACTAGCCAATGCCATGATGCCTGGTGCCCCATTACAACCCGTGCCAATG  444

Query  352  TTTTCAGTTGCACCAAGCTTAGCCACCAATGCATCAGCAGCCGCCTTTAATCCCTATCTGGGACCTGTTTCTCC  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTTCAGTTGCACCAAGCTTAGCCACCAATGCATCAGCAGCCGCCTTTAATCCCTATCTGGGACCTGTTTCTCC  518

Query  426  AAGCCTGGTCCCGGCAGAGATCTTGCCGACTGCACCAATGTTGGTTACAGGGAATCCGGGTGTCCCTGTACCTG  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGCCTGGTCCCGGCAGAGATCTTGCCGACTGCACCAATGTTGGTTACAGGGAATCCGGGTGTCCCTGTACCTG  592

Query  500  CAGCTGCTGCAGCTGCTGCACAGAAATTAATGCGAACAGACAGACTTGAGGTATGTCGAGAGTACCAACGTGGC  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGCTGCTGCAGCTGCTGCACAGAAATTAATGCGAACAGACAGACTTGAGGTATGTCGAGAGTACCAACGTGGC  666

Query  574  AATTGCAACCGAGGAGAAAATGATTGTCGGTTTGCTCATCCTGCTGACAGCACAATGATTGACACCAATGACAA  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATTGCAACCGAGGAGAAAATGATTGTCGGTTTGCTCATCCTGCTGACAGCACAATGATTGACACCAATGACAA  740

Query  648  CACAGTCACTGTGTGTATGGATTACATCAAAGGGAGATGCTCTCGGGAAAAGTGCAAATACTTTCATCCCCCTG  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACAGTCACTGTGTGTATGGATTACATCAAAGGGAGATGCTCTCGGGAAAAGTGCAAATACTTTCATCCCCCTG  814

Query  722  CACATTTGCAAGCCAAGATCAAGGCTGCCCAATACCAGGTCAACCAGGCTGCAGCTGCACAGGCTGCAGCCACC  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CACATTTGCAAGCCAAGATCAAGGCTGCCCAATACCAGGTCAACCAGGCTGCAGCTGCACAGGCTGCAGCCACC  888

Query  796  GCAGCTGCCATGGGAATTCCTCAAGCTGTACTTCCCCCATTACCAAAGAGGCCTGCTCTTGAAAAAACCAACGG  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCAGCTGCCATGGGAATTCCTCAAGCTGTACTTCCCCCATTACCAAAGAGGCCTGCTCTTGAAAAAACCAACGG  962

Query  870  TGCCACCGCAGTCTTTAACACTGGTATTTTCCAATACCAACAGGCTCTAGCCAACATGCAGTTACAACAGCATA  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCCACCGCAGTCTTTAACACTGGTATTTTCCAATACCAACAGGCTCTAGCCAACATGCAGTTACAACAGCATA  1036

Query  944  CAGCATTTCTCCCACCAGGCTCAATATTGTGCATGACACCCGCTACAAGTGTTGTTCCCATGGTGCACGGTGCT  1017
            |||||||||||||||||                                    |||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGCATTTCTCCCACCA------------------------------------GTTCCCATGGTGCACGGTGCT  1074

Query 1018  ACGCCAGCCACTGTGTCCGCAGCAACAACATCTGCCACAAGTGTTCCCTTCGCTGCAACAGCCACAGCCAACCA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075  ACGCCAGCCACTGTGTCCGCAGCAACAACATCTGCCACAAGTGTTCCCTTCGCTGCAACAGCCACAGCCAACCA  1148

Query 1092  GATACCCATAATATCTGCCGAACATCTGACTAGCCACAAGTATGTTACCCAGATG  1146
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149  GATACCCATAATATCTGCCGAACATCTGACTAGCCACAAGTATGTTACCCAGATG  1203