Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467903
• Subject: XM_011514072.2
• Aligned Length: 2057
• Identities: 1958
• Gaps: 82

Alignment

Query    1  ATGTCGGGGGTCCGGGGCCTGTCGCGGCTGCTGAGCGCTCGGCGCCTGGCGCTGGCCAAGGCGTGGCCAACAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGGGGTCCGGGGCCTGTCGCGGCTGCTGAGCGCTCGGCGCCTGGCGCTGGCCAAGGCGTGGCCAACAGT  74

Query   75  GTTGCAAACAGGAACCCGAGGTTTTCACTTCACTGTTGATGGGAACAAGAGGGCATCTGCTAAAGTTTCAGATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTGCAAACAGGAACCCGAGGTTTTCACTTCACTGTTGATGGGAACAAGAGGGCATCTGCTAAAGTTTCAGATT  148

Query  149  CCATTTCTGCTCAGTATCCAGTAGTGGATCATGAATTTGATGCAGTGGTGGTAGGCGCTGGAGGGGCAGGCTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATTTCTGCTCAGTATCCAGTAGTGGATCATGAATTTGATGCAGTGGTGGTAGGCGCTGGAGGGGCAGGCTTG  222

Query  223  CGAGCTGCATTTGGCCTTTCTGAGGCAGGGTTTAATACAGCATGTGTTACCAAGCTGTTTCCTACCAGGTCACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAGCTGCATTTGGCCTTTCTGAGGCAGGGTTTAATACAGCATGTGTTACCAAGCTGTTTCCTACCAGGTCACA  296

Query  297  CACTGTTGCAGCACAGGGAGGAATCAATGCTGCTCTGGGGAACATGGAGGAGGACAACTGGAGGTGGCATTTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACTGTTGCAGCACAGGGAGGAATCAATGCTGCTCTGGGGAACATGGAGGAGGACAACTGGAGGTGGCATTTCT  370

Query  371  ACGACACCGTGAAGGGCTCCGACTGGCTGGGGGACCAGGATGCCATCCACTACATGACGGAGCAGGCCCCCGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGACACCGTGAAGGGCTCCGACTGGCTGGGGGACCAGGATGCCATCCACTACATGACGGAGCAGGCCCCCGCC  444

Query  445  GCCGTGGTCGAGCTAGAAAATTATGGCATGCCGTTTAGCAGAACTGAAGATGGGAAGATTTATCAGCGTGCATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCGTGGTCGAGCTAGAAAATTATGGCATGCCGTTTAGCAGAACTGAAGATGGGAAGATTTATCAGCGTGCATT  518

Query  519  TGGTGGACAGAGCCTCAAGTTTGGAAAGGGCGGGCAGGCCCATCGGTGCTGCTGTGTGGCTGATCGGACTGGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGTGGACAGAGCCTCAAGTTTGGAAAGGGCGGGCAGGCCCATCGGTGCTGCTGTGTGGCTGATCGGACTGGCC  592

Query  593  ACTCGCTATTGCACACCTTATATGGAAGGTCTCTGCGATATGATACCAGCTATTTTGTGGAGTATTTTGCCTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTCGCTATTGCACACCTTATATGGAAGGTCTCTGCGATATGATACCAGCTATTTTGTGGAGTATTTTGCCTTG  666

Query  667  GATCTCCTGATGGAGAATGGGGAGTGCCGTGGTGTCATCGCACTGTGCATAGAGGACGGGTCCATCCATCGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATCTCCTGATGGAGAATGGGGAGTGCCGTGGTGTCATCGCACTGTGCATAGAGGACGGGTCCATCCATCGCAT  740

Query  741  AAGAGCAAAGAACACTGTTGTTGCCACAGGAGGCTACGGGCGCACCTACTTCAGCTGCACGTCTGCCCACACCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGAGCAAAGAACACTGTTGTTGCCACAGGAGGCTACGGGCGCACCTACTTCAGCTGCACGTCTGCCCACACCA  814

Query  815  GCACTGGCGACGGCACGGCCATGATCACCAGGGCAGGCCTTCCTTGCCAGGACCTAGAGTTTGTTCAGTTCCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCACTGGCGACGGCACGGCCATGATCACCAGGGCAGGCCTTCCTTGCCAGGACCTAGAGTTTGTTCAGTTCCAC  888

Query  889  CCCACAGGCATATATGGTGCTGGTTGTCTCATTACGGAAGGATGTCGTGGAGAGGGAGGCATTCTCATTAACAG  962
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTACAGGCATATATGGTGCTGGTTGTCTCATTACGGAAGGATGTCGTGGAGAGGGAGGCATTCTCATTAACAG  962

Query  963  TCAAGGCGAAAGGTTTATGGAGCGATACGCCCCTGTCGCGAAGGACCTGGCGTCTAGAGATGTGGTGTCTCGGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAAGGCGAAAGGTTTATGGAGCGATACGCCCCTGTCGCGAAGGACCTGGCGTCTAGAGATGTGGTGTCTCGGT  1036

Query 1037  CCATGACTCTGGAGATCCGAGAAGGAAGAGGCTGTGGCCCTGAGAAAGATCACGTCTACCTGCAGCTGCACCAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCATGACTCTGGAGATCCGAGAAGGAAGAGGCTGTGGCCCTGAGAAAGATCACGTCTACCTGCAGCTGCACCAC  1110

Query 1111  CTACCTCCAGAGCAGCTGGCCACGCGCCTGCCTGGCATTTCAGAGACAGCCATGATCTTCGCTGGCGTGGACGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTACCTCCAGAGCAGCTGGCCACGCGCCTGCCTGGCATTTCAGAGACAGCCATGATCTTCGCTGGCGTGGACGT  1184

Query 1185  CACGAAGGAGCCGATCCCTGTCCTCCCCACCGTGCATTATAACATGGGCGGCATTCCCACCAACTACAAGGGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACGAAGGAGCCGATCCCTGTCCTCCCCACCGTGCATTATAACATGGGCGGCATTCCCACCAACTACAAGGGGC  1258

Query 1259  AGGTCCTGAGGCACGTGAATGGCCAGGATCAGATTGTGCCCGGCCTGTACGCCTGTGGGGAGGCCGCCTGTGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGTCCTGAGGCACGTGAATGGCCAGGATCAGATTGTGCCCGGCCTGTACGCCTGTGGGGAGGCCGCCTGTGCC  1332

Query 1333  TCGGTACATGGTGCCAACCGCCTCGGGGCAAACTCGCTCTTGGACCTGGTTGTCTTTGGTCGGGCATGTGCCCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCGGTACATGGTGCCAACCGCCTCGGGGCAAACTCGCTCTTGGACCTGGTTGTCTTTGGTCGGGCATGTGCCCT  1406

Query 1407  GAGCATCGAAGAGTCATGCAGGCCTGGAGATAAAGTCCCTCCAATTAAACCAAACGCTGGGGAAGAATCTGTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGCATCGAAGAGTCATGCAGGCCTGGAGATAAAGTCCCTCCAATTAAACCAAACGCTGGGGAAGAATCTGTCA  1480

Query 1481  TGAATCTTGACAAATTGAGATTTGCTGATGGAAGCATAAGAACATCGGAACTGCGACTCAGCATGCAGAAGTCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAATCTTGACAAATTGAGATTTGCTGATGGAAGCATAAGAACATCGGAACTGCGACTCAGCATGCAGAAGTCA  1554

Query 1555  ATGCAAAATCATGCTGCCGTGTTCCGTGTGGGAAGCGTGTTGCAAGAAGGTTGTGGGAAAATCAGCAAGCTCTA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATGCAAAATCATGCTGCCGTGTTCCGTGTGGGAAGCGTGTTGCAAGAAGGTTGTGGGAAAATCAGCAAGCTCTA  1628

Query 1629  TGGAGACCTAAAGCACCTGAAGACGTTCGACCGGGGAATGGTCTGGAACACGGACCTGGTGGAGACCCTGGAGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGAGACCTAAAGCACCTGAAGACGTTCGACCGGGGAATGGTCTGGAACACGGACCTGGTGGAGACCCTGGAGC  1702

Query 1703  TGCAGAACCTGATGCTGTGTGCGCTGCAGACCATCTACGGAGCAGAGGCACGGAAGGAGTCACGGGGCGCGCAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGCAGAACCTGATGCTGTGTGCGCTGCAGACCATCTACGGAGCAGAGGCACGGAAGGAGTCACGGGGCGCGCAT  1776

Query 1777  GCCAGGGAAGACTACAAGGTGCGGATTGATGAGTACGATTACTCCAAGCCCATCCAGGGGCAACAGAAGAAGCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCAGGGAAGACTACAAGGTGCGGATTGATGAGTACGATTACTCCAAGCCCATCCAGGGGCAACAGAAGAAGCC  1850

Query 1851  CTTTGAGGAGCACTGGAGGAAGCACACCCTGTCCTATGTGGACGTTGGCACTGGGAAGGT--------------  1910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||              
Sbjct 1851  CTTTGAGGAGCACTGGAGGAAGCACACCCTGTCCTATGTGGACGTTGGCACTGGGAA-GTGCACAGCCAGAGAA  1923

Query 1911  ----------CACTCTGGAATATAG------ACCCGTGAT-----CGACAAAACTTTGAACGAGGCTGACT---  1960
                      |||.|.|||| |.||      .|..|||||     |..||..|||..|||.|| ||.||||   
Sbjct 1924  CAACACATCACACACAGGAA-ACAGTTGTGCTCATGTGATGGGGGCCTCAGCACTAGGAAGGA-GCGGACTATT  1995

Query 1961  -GTGCCACCGTCCCGC--CAGC------------------CATTCGCTCCTAC------  1992
             |||       |.|||  ||||                  ||       |||.      
Sbjct 1996  GGTG-------CACGCAGCAGCTTGAATAAATCTGAAAGTCA-------CTATGCTGTG  2040