Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470042
• Subject: NM_001290710.1
• Aligned Length: 1773
• Identities: 1480
• Gaps: 204

Alignment

Query    1  ATGTTTGGGATTCAGGAAAGCATCCAACGGAGTGGAAGCAGCATGAAGGAAGAGCCGCTGGGCAGCGGCATGAA  74
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTGGGATCCAGGAAAGCATCCAACGGAGTGGAAGCAGTATGAAGGAAGAGCCGCTGGGCAGCGGCATGAA  74

Query   75  CGCGGTGCGGACGTGGATGCAGGGCGCCGGGGTGCTGGACGCCAACACGGCGGCGCAGAGCGGGGTGGGTCTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCGGTGCGGACGTGGATGCAGGGCGCCGGGGTGCTGGACGCCAACACAGCGGCGCAGAGCGGGGTGGGTCTGG  148

Query  149  CCCGGGCTCACTTTGAGAAGCAGCCGCCTTCCAATCTGCGGAAATCCAACTTCTTCCACTTCGTCCTGGCCCTC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCGGGCTCACTTTGAGAAGCAGCCGCCTTCTAACCTGCGGAAATCCAACTTCTTCCACTTCGTCCTGGCCCTC  222

Query  223  TACGACAGACAGGGCCAGCCCGTGGAGATCGAGAGGACAGCGTTTGTGGGGTTCGTGGAGAAGGAAAAAGAAGC  296
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACGACAGACAGGGCCAGCCCGTGGAGATTGAGAGGACGGCCTTTGTGGGGTTCGTGGAGAAGGAAAAAGAAGC  296

Query  297  CAACAGCGAAAAGACCAATAACGGAATTCACTACCGGCTTCAGCTTCTCTACAGCAATGGGATAAGGACGGAGC  370
            |||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.||.|
Sbjct  297  CAACAGCGAAAAGACCAATAATGGGATCCACTACCGGCTCCAGCTCCTCTACAGCAATGGGATACGGACAGAAC  370

Query  371  AGGATTTCTACGTGCGCCTCATTGACTCCATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCA  444
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  AGGATTTCTATGTGCGCCTCATCGACTCCATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCT  444

Query  445  GAAATGTGCCGAGTCTTGCTCACACATGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG  518
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAATGTGCCGAGTATTGCTCACACACGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG  518

Query  519  AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCTTGAAATTTTTCCTCAAATGTAACCAAAATT  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  519  AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCCTGAAGTTTTTCCTTAAATGCAACCAAAATT  592

Query  593  GCCTAAAGAATGCGGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACGACAGTCAATGTGGAT  666
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  GCCTAAAGAATGCAGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACCACAGTCAACGTGGAT  666

Query  667  GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCATAATAATTCCAAGCATGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCACAATAACTCCAAGCACGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT  740

Query  741  TGACCCCTCGGAAGGTACGCCCTCTTATCTGGAACATGCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTGAAG  814
            |||||||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACCCCTCGGAA------------------------GCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTGAAG  790

Query  815  GATGGACGACGGGAGGTGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTCGGT  888
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  GATGGACGACGGGAGGCGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTCGGT  864

Query  889  ACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATCACTCCTCATGCCATCCGTGTGCAGACCCCTCCTCGGCACATCCCTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  865  ACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATAACTCCTCATGCCATCCGAGTTCAGACACCTCCTCGGCACATCCCTGG  938

Query  963  TGTTGTGGAAGTCACACTGTCCTACAAATCTAAGCAGTTCTGCAAAGGAACACCAGGCAGATTCATTTATACAG  1036
            |||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  939  TGTGGTGGAAGTCACACTGTCGTACAAGTCCAAGCAGTTCTGCAAAGGGACACCAGGCAGATTCATCTACACAG  1012

Query 1037  CGCTCAACGAACCCACCATCGATTATGGTTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCACCCTGGTGACCCT  1110
            |.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1013  CACTCAATGAACCCACCATCGACTACGGCTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCATCCTGGTGACCCA  1086

Query 1111  GAGCGTTTGCCAAAGGAAGTAATACTCAAAAGGGCTGCGGATCTGGTAGAAGCACTGTATGGGATGCCACACAA  1184
            |||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1087  GAGCGCTTGCCAAAGGAAGTGATCCTTAAAAGAGCTGCAGATCTGGTTGAAGCCCTGTATGGGATGCCCCACAA  1160

Query 1185  CAACCAGGAAATCATTCTGAAGAGAGCGGCCGACATTGCCGAGGCCCTGTACAGTGTTCCCCGCAACCACAACC  1258
            |||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1161  CAACCAGGAGATTATCCTGAAGAGAGCTGCCGACATTGCAGAGGCTCTGTACAGTGTCCCTCGGAACCACAACC  1234

Query 1259  AACTCCCGGCCCTTGCTAACACCTCGGTCCACGCAGGGATGATGGGCGTGAATTCGTTCAGTGGACAACTGGCC  1332
            |.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1235  AGCTCCCAGCCCTTGCTAACACTTCGGTCCATGCAGGGATGATGGGTGTGAACTCCTTCAGTGGACAACTGGCT  1308

Query 1333  GTGAATGTCTCCGAGGCATCACAAGCCACCAATCAGGGTTTCACCCGCAACTCAAGCAGCGTATCACCACACGG  1406
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|                                     
Sbjct 1309  GTGAATGTCTCGGAGGCATCACAAGCCACCAATCAAG-------------------------------------  1345

Query 1407  GTACGTGCCGAGCACCACTCCCCAGCAGACCAACTATAACTCCGTCACCACGAGCATGAACGGATACGGCTCTG  1480
                                                                                      
Sbjct 1346  --------------------------------------------------------------------------  1345

Query 1481  CCGCAATGTCCAATTTGGGCGGCTCCCCCACCTTCCTCAACGGCTCAGCTGCCAACTCCCCCTATGCCATAGTG  1554
                                                                                 |.|||
Sbjct 1346  ---------------------------------------------------------------------TTGTG  1350

Query 1555  CCATCCAGCCCCACCATGGCCTCCTCCACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGCAGCTCCTCGGGCATCTTCTCCTT  1628
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1351  CCATCCAGCCCCACCATGGCCTCATCTACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGTAGCTCCTCTGGCATCTTCTCCTT  1424

Query 1629  CTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCCGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTCGTCAGACCCCAGACCTCCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1425  CTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCAGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTTGTCAGACCCCAGACGTCCC  1498

Query 1703  CACCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTTCCTCCTATG  1773
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1499  CTCCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTCCCTCCCATG  1569