Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470042
- Subject:
- NM_001290711.1
- Aligned Length:
- 1773
- Identities:
- 1287
- Gaps:
- 399
Alignment
Query 1 ATGTTTGGGATTCAGGAAAGCATCCAACGGAGTGGAAGCAGCATGAAGGAAGAGCCGCTGGGCAGCGGCATGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGCGGTGCGGACGTGGATGCAGGGCGCCGGGGTGCTGGACGCCAACACGGCGGCGCAGAGCGGGGTGGGTCTGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCCGGGCTCACTTTGAGAAGCAGCCGCCTTCCAATCTGCGGAAATCCAACTTCTTCCACTTCGTCCTGGCCCTC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TACGACAGACAGGGCCAGCCCGTGGAGATCGAGAGGACAGCGTTTGTGGGGTTCGTGGAGAAGGAAAAAGAAGC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAACAGCGAAAAGACCAATAACGGAATTCACTACCGGCTTCAGCTTCTCTACAGCAATGGGATAAGGACGGAGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGGATTTCTACGTGCGCCTCATTGACTCCATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1 -----------------------------ATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCT 45
Query 445 GAAATGTGCCGAGTCTTGCTCACACATGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG 518
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46 GAAATGTGCCGAGTATTGCTCACACACGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG 119
Query 519 AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCTTGAAATTTTTCCTCAAATGTAACCAAAATT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 120 AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCCTGAAGTTTTTCCTTAAATGCAACCAAAATT 193
Query 593 GCCTAAAGAATGCGGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACGACAGTCAATGTGGAT 666
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 194 GCCTAAAGAATGCAGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACCACAGTCAACGTGGAT 267
Query 667 GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCATAATAATTCCAAGCATGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 268 GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCACAATAACTCCAAGCACGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT 341
Query 741 TGACCCCTCGGAAGGTACGCCCTCTTATCTGGAACATGCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTGAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 TGACCCCTCGGAAGGTACGCCCTCTTATCTGGAACATGCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTGAAG 415
Query 815 GATGGACGACGGGAGGTGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTCGGT 888
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 GATGGACGACGGGAGGCGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTCGGT 489
Query 889 ACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATCACTCCTCATGCCATCCGTGTGCAGACCCCTCCTCGGCACATCCCTGG 962
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 490 ACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATAACTCCTCATGCCATCCGAGTTCAGACACCTCCTCGGCACATCCCTGG 563
Query 963 TGTTGTGGAAGTCACACTGTCCTACAAATCTAAGCAGTTCTGCAAAGGAACACCAGGCAGATTCATTTATACAG 1036
|||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 564 TGTGGTGGAAGTCACACTGTCGTACAAGTCCAAGCAGTTCTGCAAAGGGACACCAGGCAGATTCATCTACACAG 637
Query 1037 CGCTCAACGAACCCACCATCGATTATGGTTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCACCCTGGTGACCCT 1110
|.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 638 CACTCAATGAACCCACCATCGACTACGGCTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCATCCTGGTGACCCA 711
Query 1111 GAGCGTTTGCCAAAGGAAGTAATACTCAAAAGGGCTGCGGATCTGGTAGAAGCACTGTATGGGATGCCACACAA 1184
|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 712 GAGCGCTTGCCAAAGGAAGTGATCCTTAAAAGAGCTGCAGATCTGGTTGAAGCCCTGTATGGGATGCCCCACAA 785
Query 1185 CAACCAGGAAATCATTCTGAAGAGAGCGGCCGACATTGCCGAGGCCCTGTACAGTGTTCCCCGCAACCACAACC 1258
|||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 786 CAACCAGGAGATTATCCTGAAGAGAGCTGCCGACATTGCAGAGGCTCTGTACAGTGTCCCTCGGAACCACAACC 859
Query 1259 AACTCCCGGCCCTTGCTAACACCTCGGTCCACGCAGGGATGATGGGCGTGAATTCGTTCAGTGGACAACTGGCC 1332
|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 860 AGCTCCCAGCCCTTGCTAACACTTCGGTCCATGCAGGGATGATGGGTGTGAACTCCTTCAGTGGACAACTGGCT 933
Query 1333 GTGAATGTCTCCGAGGCATCACAAGCCACCAATCAGGGTTTCACCCGCAACTCAAGCAGCGTATCACCACACGG 1406
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 934 GTGAATGTCTCGGAGGCATCACAAGCCACCAATCAAGGTTTCACCCGCAACTCAAGCAGCGTGTCACCACATGG 1007
Query 1407 GTACGTGCCGAGCACCACTCCCCAGCAGACCAACTATAACTCCGTCACCACGAGCATGAACGGATACGGCTCTG 1480
.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 1008 CTATGTGCCGAGCACCACCCCACAGCAAACCAACTATAACTCAGTCACCACAAGCATGAATGGCTACGGCTCAG 1081
Query 1481 CCGCAATGTCCAATTTGGGCGGCTCCCCCACCTTCCTCAACGGCTCAGCTGCCAACTCCCCCTATGCCATAGTG 1554
||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1082 CCGCCATGTCCAATTTGGGCGGCTCCCCAACCTTCCTCAATGGCTCAGCTGCCAACTCACCCTATGCCATTGTG 1155
Query 1555 CCATCCAGCCCCACCATGGCCTCCTCCACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGCAGCTCCTCGGGCATCTTCTCCTT 1628
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1156 CCATCCAGCCCCACCATGGCCTCATCTACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGTAGCTCCTCTGGCATCTTCTCCTT 1229
Query 1629 CTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCCGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTCGTCAGACCCCAGACCTCCC 1702
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1230 CTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCAGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTTGTCAGACCCCAGACGTCCC 1303
Query 1703 CACCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTTCCTCCTATG 1773
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1304 CTCCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTCCCTCCCATG 1374
