Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000470042
Subject:
NM_001364159.1
Aligned Length:
1773
Identities:
1374
Gaps:
399

Alignment

Query    1  ATGTTTGGGATTCAGGAAAGCATCCAACGGAGTGGAAGCAGCATGAAGGAAGAGCCGCTGGGCAGCGGCATGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGCGGTGCGGACGTGGATGCAGGGCGCCGGGGTGCTGGACGCCAACACGGCGGCGCAGAGCGGGGTGGGTCTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCCGGGCTCACTTTGAGAAGCAGCCGCCTTCCAATCTGCGGAAATCCAACTTCTTCCACTTCGTCCTGGCCCTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TACGACAGACAGGGCCAGCCCGTGGAGATCGAGAGGACAGCGTTTGTGGGGTTCGTGGAGAAGGAAAAAGAAGC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAACAGCGAAAAGACCAATAACGGAATTCACTACCGGCTTCAGCTTCTCTACAGCAATGGGATAAGGACGGAGC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AGGATTTCTACGTGCGCCTCATTGACTCCATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCA  444
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------ATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCA  45

Query  445  GAAATGTGCCGAGTCTTGCTCACACATGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   46  GAAATGTGCCGAGTCTTGCTCACACATGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG  119

Query  519  AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCTTGAAATTTTTCCTCAAATGTAACCAAAATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120  AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCTTGAAATTTTTCCTCAAATGTAACCAAAATT  193

Query  593  GCCTAAAGAATGCGGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACGACAGTCAATGTGGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  194  GCCTAAAGAATGCGGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACGACAGTCAATGTGGAT  267

Query  667  GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCATAATAATTCCAAGCATGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  268  GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCATAATAATTCCAAGCATGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT  341

Query  741  TGACCCCTCGGAAGGTACGCCCTCTTATCTGGAACATGCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  342  TGACCCCTCGGAAGGTACGCCCTCTTATCTGGAACATGCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTGAAG  415

Query  815  GATGGACGACGGGAGGTGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTCGGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  416  GATGGACGACGGGAGGTGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTCGGT  489

Query  889  ACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATCACTCCTCATGCCATCCGTGTGCAGACCCCTCCTCGGCACATCCCTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490  ACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATCACTCCTCATGCCATCCGTGTGCAGACCCCTCCTCGGCACATCCCTGG  563

Query  963  TGTTGTGGAAGTCACACTGTCCTACAAATCTAAGCAGTTCTGCAAAGGAACACCAGGCAGATTCATTTATACAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  564  TGTTGTGGAAGTCACACTGTCCTACAAATCTAAGCAGTTCTGCAAAGGAACACCAGGCAGATTCATTTATACAG  637

Query 1037  CGCTCAACGAACCCACCATCGATTATGGTTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCACCCTGGTGACCCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  638  CGCTCAACGAACCCACCATCGATTATGGTTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCACCCTGGTGACCCT  711

Query 1111  GAGCGTTTGCCAAAGGAAGTAATACTCAAAAGGGCTGCGGATCTGGTAGAAGCACTGTATGGGATGCCACACAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  712  GAGCGTTTGCCAAAGGAAGTAATACTCAAAAGGGCTGCGGATCTGGTAGAAGCACTGTATGGGATGCCACACAA  785

Query 1185  CAACCAGGAAATCATTCTGAAGAGAGCGGCCGACATTGCCGAGGCCCTGTACAGTGTTCCCCGCAACCACAACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  CAACCAGGAAATCATTCTGAAGAGAGCGGCCGACATTGCCGAGGCCCTGTACAGTGTTCCCCGCAACCACAACC  859

Query 1259  AACTCCCGGCCCTTGCTAACACCTCGGTCCACGCAGGGATGATGGGCGTGAATTCGTTCAGTGGACAACTGGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  860  AACTCCCGGCCCTTGCTAACACCTCGGTCCACGCAGGGATGATGGGCGTGAATTCGTTCAGTGGACAACTGGCC  933

Query 1333  GTGAATGTCTCCGAGGCATCACAAGCCACCAATCAGGGTTTCACCCGCAACTCAAGCAGCGTATCACCACACGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  934  GTGAATGTCTCCGAGGCATCACAAGCCACCAATCAGGGTTTCACCCGCAACTCAAGCAGCGTATCACCACACGG  1007

Query 1407  GTACGTGCCGAGCACCACTCCCCAGCAGACCAACTATAACTCCGTCACCACGAGCATGAACGGATACGGCTCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008  GTACGTGCCGAGCACCACTCCCCAGCAGACCAACTATAACTCCGTCACCACGAGCATGAACGGATACGGCTCTG  1081

Query 1481  CCGCAATGTCCAATTTGGGCGGCTCCCCCACCTTCCTCAACGGCTCAGCTGCCAACTCCCCCTATGCCATAGTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082  CCGCAATGTCCAATTTGGGCGGCTCCCCCACCTTCCTCAACGGCTCAGCTGCCAACTCCCCCTATGCCATAGTG  1155

Query 1555  CCATCCAGCCCCACCATGGCCTCCTCCACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGCAGCTCCTCGGGCATCTTCTCCTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156  CCATCCAGCCCCACCATGGCCTCCTCCACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGCAGCTCCTCGGGCATCTTCTCCTT  1229

Query 1629  CTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCCGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTCGTCAGACCCCAGACCTCCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230  CTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCCGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTCGTCAGACCCCAGACCTCCC  1303

Query 1703  CACCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTTCCTCCTATG  1773
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304  CACCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTTCCTCCTATG  1374