Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470042
- Subject:
- XM_006532158.3
- Aligned Length:
- 1776
- Identities:
- 1287
- Gaps:
- 402
Alignment
Query 1 ATGTTTGGGATTCAGGAAAGCATCCAACGGAGTGGAAGCAGCATGAAGGAAGAGCCGCTGGGCAGCGGCATGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGCGGTGCGGACGTGGATGCAGGGCGCCGGGGTGCTGGACGCCAACACGGCGGCGCAGAGCGGGGTGGGTCTGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCCGGGCTCACTTTGAGAAGCAGCCGCCTTCCAATCTGCGGAAATCCAACTTCTTCCACTTCGTCCTGGCCCTC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TACGACAGACAGGGCCAGCCCGTGGAGATCGAGAGGACAGCGTTTGTGGGGTTCGTGGAGAAGGAAAAAGAAGC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAACAGCGAAAAGACCAATAACGGAATTCACTACCGGCTTCAGCTTCTCTACAGCAATGGGATAAGGACGGAGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGGATTTCTACGTGCGCCTCATTGACTCCATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1 -----------------------------ATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCT 45
Query 445 GAAATGTGCCGAGTCTTGCTCACACATGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG 518
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46 GAAATGTGCCGAGTATTGCTCACACACGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG 119
Query 519 AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCTTGAAATTTTTCCTCAAATGTAACCAAAATT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 120 AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCCTGAAGTTTTTCCTTAAATGCAACCAAAATT 193
Query 593 GCCTAAAGAATGCGGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACGACAGTCAATGTGGAT 666
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 194 GCCTAAAGAATGCAGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACCACAGTCAACGTGGAT 267
Query 667 GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCATAATAATTCCAAGCATGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 268 GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCACAATAACTCCAAGCACGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT 341
Query 741 TGACCCCTCGGAAGGTACGCCCTCTTATCTGGAACAT---GCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTG 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 TGACCCCTCGGAAGGTACGCCCTCTTATCTGGAACATGCAGCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTG 415
Query 812 AAGGATGGACGACGGGAGGTGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTC 885
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 AAGGATGGACGACGGGAGGCGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTC 489
Query 886 GGTACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATCACTCCTCATGCCATCCGTGTGCAGACCCCTCCTCGGCACATCCC 959
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 490 GGTACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATAACTCCTCATGCCATCCGAGTTCAGACACCTCCTCGGCACATCCC 563
Query 960 TGGTGTTGTGGAAGTCACACTGTCCTACAAATCTAAGCAGTTCTGCAAAGGAACACCAGGCAGATTCATTTATA 1033
||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 564 TGGTGTGGTGGAAGTCACACTGTCGTACAAGTCCAAGCAGTTCTGCAAAGGGACACCAGGCAGATTCATCTACA 637
Query 1034 CAGCGCTCAACGAACCCACCATCGATTATGGTTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCACCCTGGTGAC 1107
||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 638 CAGCACTCAATGAACCCACCATCGACTACGGCTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCATCCTGGTGAC 711
Query 1108 CCTGAGCGTTTGCCAAAGGAAGTAATACTCAAAAGGGCTGCGGATCTGGTAGAAGCACTGTATGGGATGCCACA 1181
||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 712 CCAGAGCGCTTGCCAAAGGAAGTGATCCTTAAAAGAGCTGCAGATCTGGTTGAAGCCCTGTATGGGATGCCCCA 785
Query 1182 CAACAACCAGGAAATCATTCTGAAGAGAGCGGCCGACATTGCCGAGGCCCTGTACAGTGTTCCCCGCAACCACA 1255
||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 786 CAACAACCAGGAGATTATCCTGAAGAGAGCTGCCGACATTGCAGAGGCTCTGTACAGTGTCCCTCGGAACCACA 859
Query 1256 ACCAACTCCCGGCCCTTGCTAACACCTCGGTCCACGCAGGGATGATGGGCGTGAATTCGTTCAGTGGACAACTG 1329
||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 860 ACCAGCTCCCAGCCCTTGCTAACACTTCGGTCCATGCAGGGATGATGGGTGTGAACTCCTTCAGTGGACAACTG 933
Query 1330 GCCGTGAATGTCTCCGAGGCATCACAAGCCACCAATCAGGGTTTCACCCGCAACTCAAGCAGCGTATCACCACA 1403
||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 934 GCTGTGAATGTCTCGGAGGCATCACAAGCCACCAATCAAGGTTTCACCCGCAACTCAAGCAGCGTGTCACCACA 1007
Query 1404 CGGGTACGTGCCGAGCACCACTCCCCAGCAGACCAACTATAACTCCGTCACCACGAGCATGAACGGATACGGCT 1477
.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1008 TGGCTATGTGCCGAGCACCACCCCACAGCAAACCAACTATAACTCAGTCACCACAAGCATGAATGGCTACGGCT 1081
Query 1478 CTGCCGCAATGTCCAATTTGGGCGGCTCCCCCACCTTCCTCAACGGCTCAGCTGCCAACTCCCCCTATGCCATA 1551
|.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1082 CAGCCGCCATGTCCAATTTGGGCGGCTCCCCAACCTTCCTCAATGGCTCAGCTGCCAACTCACCCTATGCCATT 1155
Query 1552 GTGCCATCCAGCCCCACCATGGCCTCCTCCACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGCAGCTCCTCGGGCATCTTCTC 1625
||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1156 GTGCCATCCAGCCCCACCATGGCCTCATCTACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGTAGCTCCTCTGGCATCTTCTC 1229
Query 1626 CTTCTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCCGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTCGTCAGACCCCAGACCT 1699
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1230 CTTCTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCAGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTTGTCAGACCCCAGACGT 1303
Query 1700 CCCCACCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTTCCTCCTATG 1773
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1304 CCCCTCCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTCCCTCCCATG 1377
