Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470042
- Subject:
- XM_017314251.1
- Aligned Length:
- 1773
- Identities:
- 1263
- Gaps:
- 423
Alignment
Query 1 ATGTTTGGGATTCAGGAAAGCATCCAACGGAGTGGAAGCAGCATGAAGGAAGAGCCGCTGGGCAGCGGCATGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGCGGTGCGGACGTGGATGCAGGGCGCCGGGGTGCTGGACGCCAACACGGCGGCGCAGAGCGGGGTGGGTCTGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCCGGGCTCACTTTGAGAAGCAGCCGCCTTCCAATCTGCGGAAATCCAACTTCTTCCACTTCGTCCTGGCCCTC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TACGACAGACAGGGCCAGCCCGTGGAGATCGAGAGGACAGCGTTTGTGGGGTTCGTGGAGAAGGAAAAAGAAGC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAACAGCGAAAAGACCAATAACGGAATTCACTACCGGCTTCAGCTTCTCTACAGCAATGGGATAAGGACGGAGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGGATTTCTACGTGCGCCTCATTGACTCCATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1 -----------------------------ATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCT 45
Query 445 GAAATGTGCCGAGTCTTGCTCACACATGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG 518
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46 GAAATGTGCCGAGTATTGCTCACACACGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG 119
Query 519 AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCTTGAAATTTTTCCTCAAATGTAACCAAAATT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 120 AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCCTGAAGTTTTTCCTTAAATGCAACCAAAATT 193
Query 593 GCCTAAAGAATGCGGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACGACAGTCAATGTGGAT 666
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 194 GCCTAAAGAATGCAGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACCACAGTCAACGTGGAT 267
Query 667 GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCATAATAATTCCAAGCATGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 268 GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCACAATAACTCCAAGCACGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT 341
Query 741 TGACCCCTCGGAAGGTACGCCCTCTTATCTGGAACATGCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTGAAG 814
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 TGACCCCTCGGAA------------------------GCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTGAAG 391
Query 815 GATGGACGACGGGAGGTGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTCGGT 888
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 392 GATGGACGACGGGAGGCGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTCGGT 465
Query 889 ACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATCACTCCTCATGCCATCCGTGTGCAGACCCCTCCTCGGCACATCCCTGG 962
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 466 ACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATAACTCCTCATGCCATCCGAGTTCAGACACCTCCTCGGCACATCCCTGG 539
Query 963 TGTTGTGGAAGTCACACTGTCCTACAAATCTAAGCAGTTCTGCAAAGGAACACCAGGCAGATTCATTTATACAG 1036
|||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 540 TGTGGTGGAAGTCACACTGTCGTACAAGTCCAAGCAGTTCTGCAAAGGGACACCAGGCAGATTCATCTACACAG 613
Query 1037 CGCTCAACGAACCCACCATCGATTATGGTTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCACCCTGGTGACCCT 1110
|.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 614 CACTCAATGAACCCACCATCGACTACGGCTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCATCCTGGTGACCCA 687
Query 1111 GAGCGTTTGCCAAAGGAAGTAATACTCAAAAGGGCTGCGGATCTGGTAGAAGCACTGTATGGGATGCCACACAA 1184
|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 688 GAGCGCTTGCCAAAGGAAGTGATCCTTAAAAGAGCTGCAGATCTGGTTGAAGCCCTGTATGGGATGCCCCACAA 761
Query 1185 CAACCAGGAAATCATTCTGAAGAGAGCGGCCGACATTGCCGAGGCCCTGTACAGTGTTCCCCGCAACCACAACC 1258
|||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 762 CAACCAGGAGATTATCCTGAAGAGAGCTGCCGACATTGCAGAGGCTCTGTACAGTGTCCCTCGGAACCACAACC 835
Query 1259 AACTCCCGGCCCTTGCTAACACCTCGGTCCACGCAGGGATGATGGGCGTGAATTCGTTCAGTGGACAACTGGCC 1332
|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 836 AGCTCCCAGCCCTTGCTAACACTTCGGTCCATGCAGGGATGATGGGTGTGAACTCCTTCAGTGGACAACTGGCT 909
Query 1333 GTGAATGTCTCCGAGGCATCACAAGCCACCAATCAGGGTTTCACCCGCAACTCAAGCAGCGTATCACCACACGG 1406
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 910 GTGAATGTCTCGGAGGCATCACAAGCCACCAATCAAGGTTTCACCCGCAACTCAAGCAGCGTGTCACCACATGG 983
Query 1407 GTACGTGCCGAGCACCACTCCCCAGCAGACCAACTATAACTCCGTCACCACGAGCATGAACGGATACGGCTCTG 1480
.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 984 CTATGTGCCGAGCACCACCCCACAGCAAACCAACTATAACTCAGTCACCACAAGCATGAATGGCTACGGCTCAG 1057
Query 1481 CCGCAATGTCCAATTTGGGCGGCTCCCCCACCTTCCTCAACGGCTCAGCTGCCAACTCCCCCTATGCCATAGTG 1554
||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1058 CCGCCATGTCCAATTTGGGCGGCTCCCCAACCTTCCTCAATGGCTCAGCTGCCAACTCACCCTATGCCATTGTG 1131
Query 1555 CCATCCAGCCCCACCATGGCCTCCTCCACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGCAGCTCCTCGGGCATCTTCTCCTT 1628
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1132 CCATCCAGCCCCACCATGGCCTCATCTACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGTAGCTCCTCTGGCATCTTCTCCTT 1205
Query 1629 CTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCCGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTCGTCAGACCCCAGACCTCCC 1702
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1206 CTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCAGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTTGTCAGACCCCAGACGTCCC 1279
Query 1703 CACCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTTCCTCCTATG 1773
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1280 CTCCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTCCCTCCCATG 1350
