Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470877
• Subject: XM_011510957.3
• Aligned Length: 2133
• Identities: 2090
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGCGGTAGCTGCGGCGGGTCGGTTAGGCTGGTTGTTCGCCGCGCTCTGCCTGGGCAACGCCGCGGG  74
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Sbjct    1  ATGGCGGCGGCGGTAGCTGCGGCGGGTCGGTTAGGCTGGTTGTTCGCCGCGCTCTGCCTGGGCAACGCCGCGGG  74

Query   75  GGAGGCCGCGCCGGGCCCGCGAGTGCTGGGCTTCTGCCTGGAGGAGGATGGAGCGGCGGGCGCGGGTTGGGTAC  148
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Sbjct   75  GGAGGCCGCGCCGGGCCCGCGAGTGCTGGGCTTCTGCCTGGAGGAGGATGGAGCGGCGGGCGCGGGTTGGGTAC  148

Query  149  GCGGAGGGGCGGCGCGGGACACGCCGGACGCCACCTTCCTCCTGCGCCTCTTCGGCCCGGGCTTCGCCAACAGC  222
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Sbjct  149  GCGGAGGGGCGGCGCGGGACACGCCGGACGCCACCTTCCTCCTGCGCCTCTTCGGCCCGGGCTTCGCCAACAGC  222

Query  223  TCTTGGTCCTGGGTGGCCCCGGAGGGGGCGGGCTGCCGGGAGGAGGCGGCCTCCCCCGCGGGCGAGTGGCGCGC  296
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Sbjct  223  TCTTGGTCCTGGGTGGCCCCGGAGGGGGCGGGCTGCCGGGAGGAGGCGGCCTCCCCCGCGGGCGAGTGGCGCGC  296

Query  297  GCTGCTGCGCTTGCGCCTGCGGGCCGAGGCCGTGCGCCCGCACTCGGCGCTGCTGGCGGTGCGCGTGGAGCCGG  370
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Sbjct  297  GCTGCTGCGCTTGCGCCTGCGGGCCGAGGCCGTGCGCCCGCACTCGGCGCTGCTGGCGGTGCGCGTGGAGCCGG  370

Query  371  GTGGCGGGGCGGCTGAGGAGGCGGCGCCGCCCTGGGCTCTGGGCCTGGGGGCGGCCGGGCTGCTGGCGCTGGCA  444
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Sbjct  371  GTGGCGGGGCGGCTGAGGAGGCGGCGCCGCCCTGGGCTCTGGGCCTGGGGGCGGCCGGGCTGCTGGCGCTGGCA  444

Query  445  GCGCTGGCGCGAGGCCTGCAGCTGAGCGCGCTGGCGCTGGCGCCTGCCGAGGTGCAGGTGCTGCGCGAGAGCGG  518
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Sbjct  445  GCGCTGGCGCGAGGCCTGCAGCTGAGCGCGCTGGCGCTGGCGCCTGCCGAGGTGCAGGTGCTGCGCGAGAGCGG  518

Query  519  CTCGGAGGCGGAGCGTGCGGCGGCGCGGCGTTTGGAGCCCGCGCGGCGCTGGGCCGGCTGCGCCTTGGGCGCGC  592
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Sbjct  519  CTCGGAGGCGGAGCGTGCGGCGGCGCGGCGTTTGGAGCCCGCGCGGCGCTGGGCCGGCTGCGCCTTGGGCGCGC  592

Query  593  TGCTGCTGCTGGCCAGCCTGGCGCAGGCGGCGCTGGCGGTGCTGCTGTACCGCGCGGCCGGCCAGCGTGCGGTG  666
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Sbjct  593  TGCTGCTGCTGGCCAGCCTGGCGCAGGCGGCGCTGGCGGTGCTGCTGTACCGCGCGGCCGGCCAGCGTGCGGTG  666

Query  667  CCCGCCGTGTTGGGCAGCGCGGGGCTCGTGTTCCTGGTGGGAGAGGTGGTGCCGGCCGCCGTGAGCGGGCGCTG  740
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Sbjct  667  CCCGCCGTGTTGGGCAGCGCGGGGCTCGTGTTCCTGGTGGGAGAGGTGGTGCCGGCCGCCGTGAGCGGGCGCTG  740

Query  741  GACGCTGGCGCTGGCGCCGCGAGCGCTCGGCCTCAGCCGCCTGGCCGTCCTGCTCACTCTGCCCGTCGCGCTGC  814
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Sbjct  741  GACGCTGGCGCTGGCGCCGCGAGCGCTCGGCCTCAGCCGCCTGGCCGTCCTGCTCACTCTGCCCGTCGCGCTGC  814

Query  815  CCGTGGGGCAGCTGCTGGAGCTGGCGGCGCGGCCCGGGCGGCTGCGGGAGCGGGTGCTGGAGCTGGCGCGCGGC  888
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Sbjct  815  CCGTGGGGCAGCTGCTGGAGCTGGCGGCGCGGCCCGGGCGGCTGCGGGAGCGGGTGCTGGAGCTGGCGCGCGGC  888

Query  889  GGCGGTGACCCCTACAGCGATCTCAGCAAGGGCGTGCTGCGCTGCCGGACCGTGGAGGACGTGCTCACGCCCCT  962
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Sbjct  889  GGCGGCGACCCCTACAGCGATCTCAGCAAGGGCGTGCTGCGCTGCCGGACCGTGGAGGACGTGCTCACGCCCCT  962

Query  963  CGAAGACTGCTTCATGCTGGACGCCAGCACCGTGCTGGACTTCGGCGTCCTGGCCAGCATCATGCAGAGCGGCC  1036
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Sbjct  963  CGAAGACTGCTTCATGCTGGACGCCAGCACCGTGCTGGACTTCGGCGTCCTGGCCAGCATCATGCAGAGCGGCC  1036

Query 1037  ACACGCGCATCCCGGTGTACGAGGAGGAGCGCTCCAACATCGTGGACATGCTCTACCTCAAGGACTTGGCCTTC  1110
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Sbjct 1037  ACACGCGCATCCCGGTGTACGAGGAGGAGCGCTCCAACATCGTGGACATGCTCTACCTCAAGGACTTGGCCTTC  1110

Query 1111  GTGGATCCCGAAGACTGCACGCCGCTCAGCACCATCACTCGTTTCTACAACCATCCGCTCCACTTCGTCTTCAA  1184
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Sbjct 1111  GTGGATCCCGAAGACTGCACGCCGCTCAGCACCATCACTCGTTTCTACAACCATCCGCTCCACTTCGTCTTCAA  1184

Query 1185  CGACACCAAGCTGGACGCTGTCCTGGAGGAATTCAAGCGAGGGAAGTCCCACCTGGCCATCGTGCAGAAGGTGA  1258
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Sbjct 1185  CGACACCAAGCTGGACGCTGTCCTGGAGGAATTCAAGCGAGGGAAGTCCCACCTGGCCATCGTGCAGAAGGTGA  1258

Query 1259  ACAACGAGGGTGAAGGCGACCCCTTCTACGAGGTCCTGGGCCTGGTCACCCTGGAGGACGTGATCGAGGAGATC  1332
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Sbjct 1259  ACAACGAGGGTGAAGGCGACCCCTTCTACGAGGTCCTGGGCCTGGTCACCCTGGAGGACGTGATCGAGGAGATC  1332

Query 1333  ATCAGGTCCGAGATCCTGGACGAGTCTGAAGACTACCGAGACACCGTGGTGAAGAGGAAGCCTGCTTCTCTGAT  1406
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Sbjct 1333  ATCAGGTCCGAGATCCTGGACGAGTCTGAAGACTACCGAGACACCGTGGTGAAGAGGAAGCCTGCTTCTCTGAT  1406

Query 1407  GGCCCCTCTGAAGCGGAAGGAGGAGTTCTCCTTGTTCAAGGTGTCTGATGATGAATATAAAGTAACAATCTCGC  1480
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Sbjct 1407  GGCCCCTCTGAAGCGGAAGGAGGAGTTCTCCTTGTTCAAGGTGTCTGATGATGAATATAAAGTAACAATCTCGC  1480

Query 1481  CTCAGCTGCTCTTGGCCACCCAGCGCTTCCTGTCCCGAGAAGTGGATGTATTCAGCCCGCTGCGCATCTCTGAG  1554
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Sbjct 1481  CTCAGCTGCTCTTGGCCACCCAGCGCTTCCTGTCCCGAGAAGTGGATGTATTCAGCCCGCTGCGCATCTCTGAG  1554

Query 1555  AAGGTCCTGCTGCACCTGTTGAAGCATCCCAGTGTCAACCAGGAAGTGAGGTTTGACGAGAGCAACCGGCTGGC  1628
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Sbjct 1555  AAGGTCCTGCTGCACCTGTTGAAGCATCCCAGTGTCAACCAGGAAGTGAGGTTTGACGAGAGCAACCGGCTGGC  1628

Query 1629  CACACACCACTACCTGTACCAGCGCAGCCAGCCGGTGGATTACTTCATTCTCATCCTGCAGGGCAGGGTTGAAG  1702
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Sbjct 1629  CACACACCACTACCTGTACCAGCGCAGCCAGCCGGTGGATTACTTCATTCTCATCCTGCAGGGCAGGGTTGAAG  1702

Query 1703  TGGAGATCGGGAAAGAGGGTCTGAAGTTTGAGAATGGGGCCTTCACGTACTATGGAGTGTCGGCCCTAACTGTG  1776
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Sbjct 1703  TGGAGATCGGGAAAGAGGGTCTGAAGTTTGAGAATGGGGCCTTCACGTACTATGGAGTGTCGGCCCTAACTGTG  1776

Query 1777  CCATCCTCGGTTCACCAGTCCCCGGTGTCCTCGCTCCAGCCCATCCGCCATGACCTGCAGCCCGACCCAGGTGA  1850
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Sbjct 1777  CCATCCTCGGTTCACCAGTCCCCGGTGTCCTCGCTCCAGCCCATCCGCCATGACCTGCAGCCCGACCCAGGTGA  1850

Query 1851  CGGCACGCATTCATCTGCGTATTGTCCCGACTACACCGTGAGGGCGCTCTCTGATCTGCAGCTCATCAAGGTTA  1924
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Sbjct 1851  CGGCACGCATTCATCTGCGTATTGTCCCGACTACACCGTGAGGGCGCTCTCTGATCTGCAGCTCATCAAGGTTA  1924

Query 1925  CGCGACTGCAGTACCTCAATGCACTCCTGGCTACCCGAGCCCAGAACCTGCCACAGTCCCCTGAGAACACCGAC  1998
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Sbjct 1925  CGCGACTGCAGTACCTCAATGCACTCCTGGCTACCCGAGCCCAGAACCTGCCACAGTCCCCTGAGAACACCGAC  1998

Query 1999  CTGCAGGTTATTCCAGGCAGCCAGACCAGGCTCCTTGGTGAGAAGACCACCACAGCGGCAG--GGTCCAGC---  2067
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Sbjct 1999  CTGCAGGTTATTCCAGGCAGCCAGACCAGGCTCCTTGGTGAGAAGACCACCACAGCGGCAGCTGGTCCAGCTGC  2072

Query 2068  -CACAGCAGGCCCGGCGTCCC----GGTGGAAGGCAGCCCTGGGCGGAAC--CCAGGCGTT  2121
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Sbjct 2073  TC-CAGCA-----------CCGTTTGTTGAAAGGCTGTCCT-------TCCTCCAT-----  2109