Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000473950
Subject:
NM_007509.3
Aligned Length:
1533
Identities:
1371
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGCGCTGCGGGCGATGCGGGGGATTGTCAACGGGGCCGCACCCGAGCTACCCGTGCCCACCGGTGGGCCGGC  74
            ||||||.||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||..
Sbjct    1  ATGGCGTTGCGAGCGATGCGGGGAATCGTGAACGGGGCCGCACCCGAACTGCCCGTGCCCACCGGTGGGCCGAT  74

Query   75  GGTGGGAGCTCGGGAGCAGGCGCTGGCAGTCAGTCGGAACTACCTCTCCCAGCCTCGCCTCACATACAAGACAG  148
            ||..|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct   75  GGCCGGAGCTCGGGAGCAGGCGCTGGCGGTGAGCCGGAACTACCTATCCCAGCCTCGTCTCACCTACAAGACTG  148

Query  149  TATCTGGAGTCAATGGTCCACTAGTGATCTTAGATCATGTTAAGTTTCCCAGGTATGCTGAAATTGTCCATTTG  222
            |.|||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  149  TCTCTGGGGTGAATGGTCCACTAGTGATCCTAGATCATGTGAAGTTTCCCAGATACGCTGAGATTGTCCACTTG  222

Query  223  ACCTTACCGGATGGCACAAAGAGAAGTGGGCAAGTTCTGGAAGTTAGTGGTTCCAAGGCAGTAGTTCAGGTATT  296
            ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  223  ACATTACCAGATGGCACAAAGAGAAGTGGGCAAGTCCTAGAAGTTAGTGGCTCCAAAGCAGTGGTTCAGGTATT  296

Query  297  TGAAGGGACTTCAGGTATAGATGCTAAGAAAACGTCCTGTGAGTTTACTGGGGATATTCTCCGAACACCGGTGT  370
            |||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TGAAGGGACATCTGGTATAGACGCCAAGAAAACATCCTGTGAGTTTACTGGAGATATTCTCCGAACACCAGTGT  370

Query  371  CTGAGGATATGCTTGGTCGGGTATTCAATGGATCGGGAAAACCCATTGACAGAGGTCCTGTTGTACTGGCCGAA  444
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  371  CTGAGGATATGCTTGGTCGAGTATTCAACGGATCAGGAAAACCCATTGACCGAGGCCCTGTGGTGCTGGCTGAA  444

Query  445  GACTTCCTTGATATCATGGGTCAGCCAATCAACCCTCAATGTCGAATCTACCCAGAGGAAATGATTCAGACTGG  518
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  445  GACTTCCTTGACATCATGGGTCAGCCAATCAACCCTCAGTGTCGGATCTATCCAGAAGAGATGATTCAGACGGG  518

Query  519  CATTTCGGCCATCGATGGGATGAACAGTATTGCTAGGGGGCAGAAAATTCCTATCTTCTCTGCTGCTGGGCTAC  592
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||..|||
Sbjct  519  CATTTCCGCCATCGATGGCATGAACAGTATTGCTAGGGGACAGAAAATCCCCATCTTTTCTGCTGCTGGATTAC  592

Query  593  CACACAATGAGATTGCAGCTCAGATCTGTCGCCAGGCTGGTTTGGTAAAGAAATCCAAAGATGTAGTAGACTAC  666
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  593  CACACAACGAGATTGCAGCTCAGATCTGTCGCCAGGCTGGTTTGGTAAAGAAATCCAAAGATGTAGTGGACTAT  666

Query  667  AGTGAGGAAAATTTTGCAATTGTATTTGCTGCTATGGGTGTAAACATGGAAACTGCCCGGTTCTTCAAATCTGA  740
            |||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  667  AGTGAAGAAAATTTTGCCATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTAAACATGGAAACAGCCCGGTTCTTTAAATCTGA  740

Query  741  CTTTGAAGAAAATGGCTCAATGGACAATGTCTGCCTCTTTTTGAACTTGGCTAATGACCCAACCATTGAGCGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  CTTTGAAGAAAATGGCTCAATGGACAATGTCTGCCTTTTTTTGAATCTGGCTAATGACCCAACCATTGAGCGGA  814

Query  815  TTATCACTCCTCGCCTGGCTCTAACCACAGCTGAATTTCTGGCGTACCAATGTGAGAAACATGTATTGGTTATT  888
            |.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||..||||.||.
Sbjct  815  TCATCACTCCTCGCCTGGCTCTGACCACGGCCGAGTTTCTGGCATATCAGTGTGAGAAGCACGTGCTGGTGATC  888

Query  889  CTAACAGACATGAGTTCTTATGCTGAAGCACTTCGAGAGGTTTCAGCAGCCAGGGAAGAGGTACCTGGTCGACG  962
            ||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  889  CTGACGGACATGAGCTCCTACGCTGAAGCGCTGCGAGAGGTTTCAGCTGCCAGGGAAGAGGTCCCTGGTCGGCG  962

Query  963  AGGTTTTCCAGGTTACATGTATACAGATTTAGCCACGATATATGAACGCGCTGGGCGAGTGGAAGGGAGAAACG  1036
            |||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  963  AGGCTTCCCAGGCTACATGTATACCGACTTAGCCACAATCTATGAACGTGCCGGTCGAGTGGAAGGTAGAAACG  1036

Query 1037  GCTCGATTACTCAAATCCCTATTCTAACCATGCCTAATGATGATATCACTCACCCCATCCCAGACTTGACTGGC  1110
            ||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037  GCTCTATTACCCAAATCCCTATTCTCACCATGCCCAATGACGATATCACTCATCCCATCCCTGACTTGACTGGG  1110

Query 1111  TACATTACAGAGGGGCAGATCTATGTGGACAGACAGCTGCACAACAGACAGATTTATCCACCTATCAATGTGCT  1184
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  TACATTACTGAGGGCCAGATCTATGTGGACAGACAGCTGCACAACAGACAGATTTACCCTCCTATTAATGTGCT  1184

Query 1185  GCCCTCACTATCACGGTTAATGAAGTCTGCTATTGGAGAAGGGATGACCAGGAAGGATCATGCCGATGTATCTA  1258
            |||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1185  GCCCTCACTCTCTCGGTTAATGAAGTCAGCTATCGGAGAAGGAATGACCAGAAAGGATCACGCTGATGTGTCTA  1258

Query 1259  ACCAGCTATATGCGTGCTATGCTATTGGAAAGGATGTGCAAGCCATGAAAGCTGTCGTTGGAGAAGAAGCCCTT  1332
            |||||.|.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 1259  ACCAGTTGTATGCGTGCTATGCCATCGGTAAGGACGTGCAAGCCATGAAAGCCGTGGTGGGAGAGGAAGCCCTG  1332

Query 1333  ACCTCAGATGATCTTCTCTACTTGGAATTTCTGCAGAAGTTTGAGAGGAACTTCATTGCTCAGGGTCCTTACGA  1406
            ||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||.||.||
Sbjct 1333  ACCTCAGATGATCTCCTTTACCTGGAATTTCTGCAGAAGTTTGAGAAGAACTTCATTACTCAGGGTCCCTATGA  1406

Query 1407  AAATCGCACTGTCTTTGAGACTTTGGACATTGGCTGGCAGCTACTCCGAATCTTCCCCAAAGAAATGCTGAAGA  1480
            |||.||.|||||.|.|||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAACCGAACTGTTTATGAGACTTTGGACATTGGCTGGCAGTTGCTTCGAATCTTCCCCAAAGAAATGCTGAAGA  1480

Query 1481  GAATCCCTCAGAGCACCCTCAGCGAATTTTACCCTCGAGACTCTGCAAAGCAT  1533
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1481  GAATCCCTCAGAGCACCCTGAGCGAATTTTACCCTCGAGACTCTGCAAAACAC  1533