Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474479
• Subject: XM_017002659.1
• Aligned Length: 1402
• Identities: 1036
• Gaps: 361

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAAAAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAAAAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  74

Query   75  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  148

Query  149  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  222

Query  223  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  296

Query  297  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  370

Query  371  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  444

Query  445  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGACAAAGTCTCTCTCTGTCACCTAGG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||                      
Sbjct  445  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGGCA----------------------  496

Query  519  CTGGAGTGCTATGGCGCCATCAGGGCTCACTGCAGCCCCAACCTCCCTGGGCTCCAGTGATCCTCCCACCTCAG  592
                                                                                      
Sbjct  497  --------------------------------------------------------------------------  496

Query  593  CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACANGCATTTGCTCATNGTGATNTGAAACCAAGNAAAATATATTGTGTGAATCT  666
                                        ||||||||.|||||.||||||||  .||||||||||||||||||||
Sbjct  497  ----------------------------TTGCTCATCGTGATCTGAAACCA--GAAAATATATTGTGTGAATCT  540

Query  667  CCAGGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGATGAAACTGAACAACTCCTTG  740
            ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  541  CCA-GAAAAGGTGTCTCCAGTG-AAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGATGAAACTGAACAACTCC-TG  611

Query  741  TACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATGGCCCCTGAAGGTAGTNGAG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||.|||
Sbjct  612  TACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATGGCCCCTG-AGGTAGTGGAG  684

Query  815  GTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGCGTGGTCCTCTACATCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  685  GTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGCGTGGTCCTCTACATCAT  758

Query  889  GCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACCGGGGCGAGGTCTGCAGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  759  GCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACCGGGGCGAGGTCTGCAGGG  832

Query  963  TGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGACAAGGACTGGGCACACATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  833  TGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGACAAGGACTGGGCACACATC  906

Query 1037  TCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAGACTTAGCGCCGCCCAAGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  907  TCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAGACTTAGCGCCGCCCAAGT  980

Query 1111  TCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCGCAAGTCCTCCAGAGGAACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||                                            ||||||
Sbjct  981  TCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGG--------------------------------------------GGAACA  1010

Query 1185  GCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAGCTATCTCAGCACGAAGAG  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct 1011  GCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGC-------------------------------------------  1041

Query 1259  AACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCTTTCCCCTCCCTGCAAGTC  1332
                                                                                      
Sbjct 1042  --------------------------------------------------------------------------  1041

Query 1333  ACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGACAGGAGCCCGCCCACAGCACTC  1402
                                                                                  
Sbjct 1042  ----------------------------------------------------------------------  1041