Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474479
• Subject: XM_017320015.1
• Aligned Length: 1402
• Identities: 891
• Gaps: 397

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAAAAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  74
                                                ||||||||.||.||.|||||||||||||..|||..|||
Sbjct    1  ------------------------------------ATGGGCAGCAGTGAGCCCCTTCCCATCGTGGATTCTGA  38

Query   75  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  148
            ||.||||||||||||||||||.|.|..|||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct   39  CAAGAGGAGGAAGAAGAAGCGTAAGACCCGGGCCACCGACTCTCTGCCAGGAAAGTTTGAAGATGTGTACCAGC  112

Query  149  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  222
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.||||||||.|||.||.|||
Sbjct  113  TGACCTCGGAATTGCTGGGAGAAGGAGCCTATGCCAAAGTCCAGGGTGCTGTGAACCTACAGAGTGGGAAGGAG  186

Query  223  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  187  TATGCTGTCAAAATCATCGAGAAGCAAGCCGGGCACAGTCGAAGTCGAGTGTTCCGTGAGGTGGAGACACTGTA  260

Query  297  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  370
            |||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  261  TCAGTGTCAAGGGAACAGGAACATTTTGGAGCTGATTGAATTCTTTGAAGATGACACACGGTTTTACTTGGTCT  334

Query  371  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  444
            |||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  335  TTGAGAAATTGCAAGGAGGCTCCATCCTAGCACACATCCAGAAGCGGAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGT  408

Query  445  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGACAAAGTCTCTCTCTGTCACCTAGG  518
            .||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.||.||||.||                      
Sbjct  409  AGAGTGGTGCGGGACGTCGCCACTGCCCTTGACTTCCTGCACACTAAAGGCA----------------------  460

Query  519  CTGGAGTGCTATGGCGCCATCAGGGCTCACTGCAGCCCCAACCTCCCTGGGCTCCAGTGATCCTCCCACCTCAG  592
                                                                                      
Sbjct  461  --------------------------------------------------------------------------  460

Query  593  CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACANGCATTTGCTCATNGTGATNTGAAACCAAGNAAAATATATTGTGTGAATCT  666
                                        |||||||..|||||.||||.|||  .||||.|||.|||||||||||
Sbjct  461  ----------------------------TTGCTCACCGTGATCTGAAGCCA--GAAAACATACTGTGTGAATCT  504

Query  667  CCAGGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGATGAAACTGAACAACTCCTTG  740
            ||| ||||||||||||||.||| |||||.||||||||||||||||||||||||.|.||..||||||||||| ||
Sbjct  505  CCA-GAAAAGGTGTCTCCGGTG-AAAATTTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGGTAAAGTTGAACAACTCC-TG  575

Query  741  TACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATGGCCCCTGAAGGTAGTNGAG  814
            .||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||| ||||.||.|||
Sbjct  576  CACTCCCATAACCACGCCAGAGCTGACTACTCCATGCGGCTCTGCAGAGTATATGGCACCTG-AGGTGGTGGAG  648

Query  815  GTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGCGTGGTCCTCTACATCAT  888
            |||||.|.||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  649  GTCTTTAGGGACGAGGCTACTTTCTATGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGTGTGGTCCTCTACATCAT  722

Query  889  GCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACCGGGGCGAGGTCTGCAGGG  962
            |||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.
Sbjct  723  GCTGAGTGGCTACCCCCCCTTTGTAGGTCACTGTGGGGCTGACTGTGGCTGGGACCGGGGAGAGGTATGCAGGA  796

Query  963  TGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGACAAGGACTGGGCACACATC  1036
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  797  TGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAGAGCATCCAGGAAGGCAAATACGAGTTTCCTGACAAAGACTGGGCTCACATC  870

Query 1037  TCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAGACTTAGCGCCGCCCAAGT  1110
            ||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||
Sbjct  871  TCCAACGAGGCCAAAGACCTCATCTCTAAGCTCCTGGTTCGAGATGCGAAGCAAAGACTCAGTGCTGCCCAGGT  944

Query 1111  TCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCGCAAGTCCTCCAGAGGAACA  1184
            |||||||||.||||||||                 |.||||||                           ||||
Sbjct  945  TCTGCAGCATCCATGGGT-----------------ACAAGGGA---------------------------AACA  974

Query 1185  GCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAGCTATCTCAGCACGAAGAG  1258
            |||||||.||||||.||||.|||||||||||                                           
Sbjct  975  GCAGCACCATGGACTTGACTCTCTTCGCAGC-------------------------------------------  1005

Query 1259  AACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCTTTCCCCTCCCTGCAAGTC  1332
                                                                                      
Sbjct 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005

Query 1333  ACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGACAGGAGCCCGCCCACAGCACTC  1402
                                                                                  
Sbjct 1006  ----------------------------------------------------------------------  1005