Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476441
• Subject: XM_017010289.1
• Aligned Length: 1312
• Identities: 1123
• Gaps: 167

Alignment

Query    1  ATGAGGCCCGGAGGGGAGCGGCCCGTGGAAGGGGGCGCGTGCAATGGCCGCTCCGAGCTGGAGCTACTGAAGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGCCCGGAGGGGAGCGGCCCGTGGAAGGGGGCGCGTGCAATGGCCGCTCCGAGCTGGAGCTACTGAAGCT  74

Query   75  GCGCTCGGCGGAGTGCATCGACGAGGCGGCCGAGCGGCTGGGGGCCCTGAGCCGCGCGATCTGGAGCCAGCCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGCTCGGCGGAGTGCATCGACGAGGCGGCCGAGCGGCTGGGGGCCCTGAGCCGCGCGATCTGGAGCCAGCCCG  148

Query  149  AGCTGGCCTACGAGGAGCACCATGCCCACCGCGTGCTGACGCACTTCTTCGAGCGGGAGCCGCCCGCGGCCTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTGGCCTACGAGGAGCACCATGCCCACCGCGTGCTGACGCACTTCTTCGAGCGGGAGCCGCCCGCGGCCTCC  222

Query  223  TGGGCAGTGCAGCCGCACTACCAGCTGCCCACGGCCTTCCGCGCCGAGTGGGAGCCGCCGGAGGCCCGGGCACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGGCAGTGCAGCCGCACTACCAGCTGCCCACGGCCTTCCGCGCCGAGTGGGAGCCGCCGGAGGCCCGGGCACC  296

Query  297  GAGCGCCACGCCACGCCCGCTGCACCTGGGCTTCCTCTGCGAGTACGACGCGCTGCCCGGCATCGGCCACGCCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGCGCCACGCCACGCCCGCTGCACCTGGGCTTCCTCTGCGAGTACGACGCGCTGCCCGGCATCGGCCACGCCT  370

Query  371  GCGGCCACAACCTCATCGCTGAGGTCGGGGCGGCGGCCGCGCTGGGCGTGAGGGGGGCCTTAGAGGGCCTCCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCGGCCACAACCTCATCGCTGAGGTCGGGGCGGCGGCCGCGCTGGGCGTGAGGGGGGCCTTAGAGGGCCTCCCC  444

Query  445  AGGCCGCCTCCGCCCGTGAAGGTAGTTGTCCTGGGAACCCCTGCAGAAGAAGATGGTGGTGGCAAAATTGATTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGCCGCCTCCGCCCGTGAAGGTAGTTGTCCTGGGAACCCCTGCAGAAGAAGATGGTGGTGGCAAAATTGATTT  518

Query  519  AATTGAAGCAGGGGCTTTTACAAATCTTGATGTTGTTTTTATGGCCCACCCATCACAAGAGAATGCTGCTTATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATTGAAGCAGGGGCTTTTACAAATCTTGATGTTGTTTTTATGGCCCACCCATCACAAGAGAATGCTGCTTATC  592

Query  593  TACCAGATATGGCTGAACATGATGTGACTGTGAAATACTATGGAAAAGCATCTCATTCTGCTTCTTATCCCTGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TACCAGATATGGCTGAACATGATGTGACTGTGAAATACTATGGAAAAGCATCTCATTCTGCTTCTTATCCCTGG  666

Query  667  GAAGGATTAAATGCATTAGATGCTGCTGTGCTGGCCTATAACAATCTGTCTGTGTTCAGACAGCAAATGAAACC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAGGATTAAATGCATTAGATGCTGCTGTGCTGGCCTATAACAATCTGTCTGTGTTCAGACAGCAAATGAAACC  740

Query  741  AACCTGGAGAGTTCATGGTATAATAAAAAATGGTGGTGTAAAACCCAATATCATTCCCTCTTATTCTGAATTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AACCTGGAGAGTTCATGGTATAATAAAAAATGGTGGTGTAAAACCCAATATCATTCCCTCTTATTCTGAATTAA  814

Query  815  TCTATTACTTCCGTGCACCCTCAATGAAAGAACTTCAAGTTTTGACCAAAAAGGCAGAAGATTGCTTCAGAGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTATTACTTCCGTGCACCCTCAATGAAAGAACTTCAAGTTTTGACCAAAAAGGCAGAAGATTGCTTCAGAGCT  888

Query  889  GCAGCTTTGGCTTCAGGGTGCACAGTGGAAATTAAAGGTGGAGCACATGATTATTACAATGTTCTTCCCAATAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCAGCTTTGGCTTCAGGGTGCACAGTGGAAATTAAAGGTGGAGCACATGATTATTACAATGTTCTTCCCAATAA  962

Query  963  GAGCCTATGGAAAGCCTATATGGAAAATGGAAGAAAGCTAGGAATAGAGTTCATTTCAGAAGATACAATGTTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGCCTATGGAAAGCCTATATGGAAAATGGAAGAAAGCTAGGAATAGAGTTCATTTCAGAAGATACAATGTTGA  1036

Query 1037  ATGGCCCTTCAGGATCTACGGATTTTGGAAATGTTAGTTTTGTGGTTCCTGGAATTCATCCATATTTTCACATT  1110
            |||||||||||||                          |.|.||                            .
Sbjct 1037  ATGGCCCTTCAGG--------------------------TAGAGG----------------------------G  1056

Query 1111  GGATCTAATGCCTTGAATCATACTGA-ACAGTACACTGAAGCTGCTGGGTCA-CAGGAAGCTCAGTTCTACACT  1182
            ||.||||...||..||        || ||||.|    ||||     |||.|| |||..||              
Sbjct 1057  GGCTCTATCCCCAAGA--------GAGACAGAA----GAAG-----GGGCCATCAGAGAG--------------  1099

Query 1183  CTGCGGACGGCCAAAGCTCTGGCAA-TGACGGCACTGGATGTTATTTTTAAACCAG-AGTTACTGGAAGGAATC  1254
              ||.||.||  .|||| |..|||| ||      |||  |||.|         ||| ||     .||||.|   
Sbjct 1100  --GCAGAAGG--GAAGC-CATGCAAGTG------CTG--TGTCA---------CAGAAG-----AGAAGAA---  1143

Query 1255  AGAGAGGACTTTAAACTGAAACTTCAAGAAGAACAGTTTGTAAATGCAGTAGAA  1308
            ||.|||                                                
Sbjct 1144  AGGGAG------------------------------------------------  1149