Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480924
• Subject: XM_011514335.2
• Aligned Length: 1137
• Identities: 986
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGGAGCAGCTGAACTCAGCAAACACCCGCTTCGCCTTGGACCTGTTCCTGGCGTTGAGTGAGAACAATCCGGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGGAAACATCTTCATCTCTCCCTTCAGCATTTCATCTGCTATGGCCATGGTTTTTCTGGGGACCAGAGGTAACA  148
                                                    ||||.||      .||||              ||
Sbjct    1  ----------------------------------------ATGGACA------GTCTG--------------CA  14

Query  149  CGGCAGCACAGCTGTCCAAGACTTTCCATTTCAACACGGTTGAAGAGGTTCATTCAAGATTCCAGAGTCTGAAT  222
            .||             .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   15  TGG-------------AAAGACTTTCCATTTCAACACGGTTGAAGAGGTTCATTCAAGATTCCAGAGTCTGAAT  75

Query  223  GCTGATATCAACAAACGTGGAGCGTCTTATATTCTGAAACTTGCTAATAGATTATATGGAGAGAAAACTTACAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   76  GCTGATATCAACAAACGTGGAGCGTCTTATATTCTGAAACTTGCTAATAGATTATATGGAGAGAAAACTTACAA  149

Query  297  TTTCCTTCCTGAGTTCTTGGTTTCGACTCAGAAAACATATGGTGCTGACCTGGCCAGTGTGGATTTTCAGCATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  150  TTTCCTTCCTGAGTTCTTGGTTTCGACTCAGAAAACATATGGTGCTGACCTGGCCAGTGTGGATTTTCAGCATG  223

Query  371  CCTCTGAAGATGCAAGGAAGACCATAAACCAGTGGGTCAAAGGACAGACAGAAGGAAAAATTCCGGAACTGTTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  224  CCTCTGAAGATGCAAGGAAGACCATAAACCAGTGGGTCAAAGGACAGACAGAAGGAAAAATTCCGGAACTGTTG  297

Query  445  GCTTCGGGCATGGTTGATAACATGACCAAACTTGTGCTAGTAAATGCCATCTATTTCAAGGGAAACTGGAAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298  GCTTCGGGCATGGTTGATAACATGACCAAACTTGTGCTAGTAAATGCCATCTATTTCAAGGGAAACTGGAAGGA  371

Query  519  TAAATTCATGAAAGAAGCCACGACGAATGCACCATTCAGATTGAATAAGAAAGACAGAAAAACTGTGAAAATGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  372  TAAATTCATGAAAGAAGCCACGACGAATGCACCATTCAGATTGAATAAGAAAGACAGAAAAACTGTGAAAATGA  445

Query  593  TGTATCAGAAGAAAAAATTTGCATATGGCTACATCGAGGACCTTAAGTGCCGTGTGCTGGAACTGCCTTACCAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  446  TGTATCAGAAGAAAAAATTTGCATATGGCTACATCGAGGACCTTAAGTGCCGTGTGCTGGAACTGCCTTACCAA  519

Query  667  GGCGAGGAGCTCAGCATGGTCATCCTGCTGCCGGATGACATTGAGGACGAGTCCACGGGCCTGAAGAAGATTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  520  GGCGAGGAGCTCAGCATGGTCATCCTGCTGCCGGATGACATTGAGGACGAGTCCACGGGCCTGAAGAAGATTGA  593

Query  741  GGAACAGTTGACTTTGGAAAAGTTGCATGAGTGGACTAAACCTGAGAATCTCGATTTCATTGAAGTTAATGTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  GGAACAGTTGACTTTGGAAAAGTTGCATGAGTGGACTAAACCTGAGAATCTCGATTTCATTGAAGTTAATGTCA  667

Query  815  GCTTGCCCAGGTTCAAACTGGAAGAGAGTTACACTCTCAACTCCGACCTCGCCCGCCTAGGTGTGCAGGATCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  GCTTGCCCAGGTTCAAACTGGAAGAGAGTTACACTCTCAACTCCGACCTCGCCCGCCTAGGTGTGCAGGATCTC  741

Query  889  TTTAACAGTAGCAAGGCTGATCTGTCTGGCATGTCAGGAGCCAGAGATATTTTTATATCAAAAATTGTCCACAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  742  TTTAACAGTAGCAAGGCTGATCTGTCTGGCATGTCAGGAGCCAGAGATATTTTTATATCAAAAATTGTCCACAA  815

Query  963  GTCATTTGTGGAAGTGAATGAAGAGGGAACAGAGGCGGCAGCTGCCACAGCAGGCATCGCAACTTTCTGCATGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  816  GTCATTTGTGGAAGTGAATGAAGAGGGAACAGAGGCGGCAGCTGCCACAGCAGGCATCGCAACTTTCTGCATGT  889

Query 1037  TGATGCCCGAAGAAAATTTCACTGCCGACCATCCATTCCTTTTCTTTATTCGGCATAATTCCTCAGGTAGCATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  890  TGATGCCCGAAGAAAATTTCACTGCCGACCATCCATTCCTTTTCTTTATTCGGCATAATTCCTCAGGTAGCATC  963

Query 1111  CTATTCTTGGGGAGATTTTCTTCCCCT  1137
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  964  CTATTCTTGGGGAGATTTTCTTCCCCT  990