Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487784
• Subject: NM_001285487.1
• Aligned Length: 1282
• Identities: 1044
• Gaps: 101

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAA-AAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTG  73
            |||         ||       ||| |.|||   ||||||||||||.||.||.|||||||||||||..|||..||
Sbjct    1  ATG---------CA-------GAACAGACC---AGAGATGGGCAGCAGTGAGCCCCTTCCCATCGTGGATTCTG  55

Query   74  ACAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAG  147
            |||.||||||||||||||||||.|.|..|||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct   56  ACAAGAGGAGGAAGAAGAAGCGTAAGACCCGGGCCACCGACTCTCTGCCAGGAAAGTTTGAAGATGTGTACCAG  129

Query  148  CTGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGA  221
            ||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.||||||||.|||.||.||
Sbjct  130  CTGACCTCGGAATTGCTGGGAGAAGGAGCCTATGCCAAAGTCCAGGGTGCTGTGAACCTACAGAGTGGGAAGGA  203

Query  222  GTATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGT  295
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  204  GTATGCTGTCAAAATCATCGAGAAGCAAGCCGGGCACAGTCGAAGTCGAGTGTTCCGTGAGGTGGAGACACTGT  277

Query  296  ATCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTC  369
            ||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  278  ATCAGTGTCAAGGGAACAGGAACATTTTGGAGCTGATTGAATTCTTTGAAGATGACACACGGTTTTACTTGGTC  351

Query  370  TTTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAG  443
            ||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  TTTGAGAAATTGCAAGGAGGCTCCATCCTAGCACACATCCAGAAGCGGAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAG  425

Query  444  CCGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGGCATTGCTCATCGTGATCTGAAAC  517
            ..||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  426  TAGAGTGGTGCGGGACGTCGCCACTGCCCTTGACTTCCTGCACACTAAAGGCATTGCTCACCGTGATCTGAAGC  499

Query  518  CAGAAAATATATTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGG  591
            |||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  CAGAAAACATACTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCGGTGAAAATTTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGG  573

Query  592  ATGAAACTGAACAACTCCTGTACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACAT  665
            .|.||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||
Sbjct  574  GTAAAGTTGAACAACTCCTGCACTCCCATAACCACGCCAGAGCTGACTACTCCATGCGGCTCTGCAGAGTATAT  647

Query  666  GGCCCCTGAGGTAGTGGAGGTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGG  739
            |||.||||||||.|||||||||||.|.||||.||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  GGCACCTGAGGTGGTGGAGGTCTTTAGGGACGAGGCTACTTTCTATGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGG  721

Query  740  GCGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGAC  813
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  722  GTGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCCCCCTTTGTAGGTCACTGTGGGGCTGACTGTGGCTGGGAC  795

Query  814  CGGGGCGAGGTCTGCAGGGTGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGA  887
            |||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  796  CGGGGAGAGGTATGCAGGATGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAGAGCATCCAGGAAGGCAAATACGAGTTTCCTGA  869

Query  888  CAAGGACTGGGCACACATCTCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGA  961
            |||.||||||||.||||||||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  870  CAAAGACTGGGCTCACATCTCCAACGAGGCCAAAGACCTCATCTCTAAGCTCCTGGTTCGAGATGCGAAGCAAA  943

Query  962  GACTTAGCGCCGCCCAAGTTCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGG-------------------------------  1004
            ||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||                               
Sbjct  944  GACTCAGTGCTGCCCAGGTTCTGCAGCATCCATGGGTACAAGGGCAAGCTCCAGAAAGGGGACTCCCCACGCCG  1017

Query 1005  -------------GGAACAGCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCA  1065
                         |.|||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1018  CAAGTCCTTCAGAGAAACAGCAGCACCATGGACTTGACTCTCTTCGCAGCTGAGGCCATTGCCCTGAACCGCCA  1091

Query 1066  GCTATCTCAGCACGAAGAGAACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGC  1139
            |||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|..|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1092  GCTGTCTCAGCATGAGGAGAATGAACTGGCCGAGGAACAGGAGGCCCTAGCTGAGGGCCTCTGCTCCATGAAGC  1165

Query 1140  TTTCCCCTCCCTGCAAGTCACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGG-------------  1200
            |.||||||||.|.|||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||..|             
Sbjct 1166  TGTCCCCTCCATCCAAATCTCGCCTGGCTCGAAGGCGAGCCCTGGCCCAGGCTGGCCGAAGCCGAGATGCAAAC  1239

Query 1201  ------------------------  1200
                                    
Sbjct 1240  CCATGTTTGACACCGGCAGGGCTC  1263