Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487784
• Subject: NM_001285488.1
• Aligned Length: 1281
• Identities: 1028
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAAAAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  74
                                                ||||||||.||.||.|||||||||||||..|||..|||
Sbjct    1  ------------------------------------ATGGGCAGCAGTGAGCCCCTTCCCATCGTGGATTCTGA  38

Query   75  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  148
            ||.||||||||||||||||||.|.|..|||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct   39  CAAGAGGAGGAAGAAGAAGCGTAAGACCCGGGCCACCGACTCTCTGCCAGGAAAGTTTGAAGATGTGTACCAGC  112

Query  149  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  222
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.||||||||.|||.||.|||
Sbjct  113  TGACCTCGGAATTGCTGGGAGAAGGAGCCTATGCCAAAGTCCAGGGTGCTGTGAACCTACAGAGTGGGAAGGAG  186

Query  223  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  187  TATGCTGTCAAAATCATCGAGAAGCAAGCCGGGCACAGTCGAAGTCGAGTGTTCCGTGAGGTGGAGACACTGTA  260

Query  297  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  370
            |||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  261  TCAGTGTCAAGGGAACAGGAACATTTTGGAGCTGATTGAATTCTTTGAAGATGACACACGGTTTTACTTGGTCT  334

Query  371  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  444
            |||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  335  TTGAGAAATTGCAAGGAGGCTCCATCCTAGCACACATCCAGAAGCGGAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGT  408

Query  445  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGGCATTGCTCATCGTGATCTGAAACC  518
            .||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  409  AGAGTGGTGCGGGACGTCGCCACTGCCCTTGACTTCCTGCACACTAAAGGCATTGCTCACCGTGATCTGAAGCC  482

Query  519  AGAAAATATATTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGA  592
            ||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  483  AGAAAACATACTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCGGTGAAAATTTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGG  556

Query  593  TGAAACTGAACAACTCCTGTACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATG  666
            |.||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  557  TAAAGTTGAACAACTCCTGCACTCCCATAACCACGCCAGAGCTGACTACTCCATGCGGCTCTGCAGAGTATATG  630

Query  667  GCCCCTGAGGTAGTGGAGGTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGG  740
            ||.||||||||.|||||||||||.|.||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  GCACCTGAGGTGGTGGAGGTCTTTAGGGACGAGGCTACTTTCTATGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGG  704

Query  741  CGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACC  814
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  705  TGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCCCCCTTTGTAGGTCACTGTGGGGCTGACTGTGGCTGGGACC  778

Query  815  GGGGCGAGGTCTGCAGGGTGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGAC  888
            ||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  779  GGGGAGAGGTATGCAGGATGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAGAGCATCCAGGAAGGCAAATACGAGTTTCCTGAC  852

Query  889  AAGGACTGGGCACACATCTCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAG  962
            ||.||||||||.||||||||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  853  AAAGACTGGGCTCACATCTCCAACGAGGCCAAAGACCTCATCTCTAAGCTCCTGGTTCGAGATGCGAAGCAAAG  926

Query  963  ACTTAGCGCCGCCCAAGTTCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGG--------------------------------  1004
            |||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||                                
Sbjct  927  ACTCAGTGCTGCCCAGGTTCTGCAGCATCCATGGGTACAAGGGCAAGCTCCAGAAAGGGGACTCCCCACGCCGC  1000

Query 1005  ------------GGAACAGCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAG  1066
                        |.|||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1001  AAGTCCTTCAGAGAAACAGCAGCACCATGGACTTGACTCTCTTCGCAGCTGAGGCCATTGCCCTGAACCGCCAG  1074

Query 1067  CTATCTCAGCACGAAGAGAACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCT  1140
            ||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|..|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1075  CTGTCTCAGCATGAGGAGAATGAACTGGCCGAGGAACAGGAGGCCCTAGCTGAGGGCCTCTGCTCCATGAAGCT  1148

Query 1141  TTCCCCTCCCTGCAAGTCACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGG--------------  1200
            .||||||||.|.|||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||..|              
Sbjct 1149  GTCCCCTCCATCCAAATCTCGCCTGGCTCGAAGGCGAGCCCTGGCCCAGGCTGGCCGAAGCCGAGATGCAAACC  1222

Query 1201  -----------------------  1200
                                   
Sbjct 1223  CATGTTTGACACCGGCAGGGCTC  1245