Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000487784
- Subject:
- XM_006502822.3
- Aligned Length:
- 1282
- Identities:
- 1044
- Gaps:
- 101
Alignment
Query 1 ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAA-AAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTG 73
||| || ||| |.||| ||||||||||||.||.||.|||||||||||||..|||..||
Sbjct 1 ATG---------CA-------GAACAGACC---AGAGATGGGCAGCAGTGAGCCCCTTCCCATCGTGGATTCTG 55
Query 74 ACAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAG 147
|||.||||||||||||||||||.|.|..|||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 56 ACAAGAGGAGGAAGAAGAAGCGTAAGACCCGGGCCACCGACTCTCTGCCAGGAAAGTTTGAAGATGTGTACCAG 129
Query 148 CTGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGA 221
||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.||||||||.|||.||.||
Sbjct 130 CTGACCTCGGAATTGCTGGGAGAAGGAGCCTATGCCAAAGTCCAGGGTGCTGTGAACCTACAGAGTGGGAAGGA 203
Query 222 GTATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGT 295
||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 204 GTATGCTGTCAAAATCATCGAGAAGCAAGCCGGGCACAGTCGAAGTCGAGTGTTCCGTGAGGTGGAGACACTGT 277
Query 296 ATCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTC 369
||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 278 ATCAGTGTCAAGGGAACAGGAACATTTTGGAGCTGATTGAATTCTTTGAAGATGACACACGGTTTTACTTGGTC 351
Query 370 TTTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAG 443
||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 TTTGAGAAATTGCAAGGAGGCTCCATCCTAGCACACATCCAGAAGCGGAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAG 425
Query 444 CCGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGGCATTGCTCATCGTGATCTGAAAC 517
..||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 426 TAGAGTGGTGCGGGACGTCGCCACTGCCCTTGACTTCCTGCACACTAAAGGCATTGCTCACCGTGATCTGAAGC 499
Query 518 CAGAAAATATATTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGG 591
|||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 CAGAAAACATACTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCGGTGAAAATTTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGG 573
Query 592 ATGAAACTGAACAACTCCTGTACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACAT 665
.|.||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 574 GTAAAGTTGAACAACTCCTGCACTCCCATAACCACGCCAGAGCTGACTACTCCATGCGGCTCTGCAGAGTATAT 647
Query 666 GGCCCCTGAGGTAGTGGAGGTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGG 739
|||.||||||||.|||||||||||.|.||||.||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648 GGCACCTGAGGTGGTGGAGGTCTTTAGGGACGAGGCTACTTTCTATGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGG 721
Query 740 GCGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGAC 813
|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 722 GTGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCCCCCTTTGTAGGTCACTGTGGGGCTGACTGTGGCTGGGAC 795
Query 814 CGGGGCGAGGTCTGCAGGGTGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGA 887
|||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 796 CGGGGAGAGGTATGCAGGATGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAGAGCATCCAGGAAGGCAAATACGAGTTTCCTGA 869
Query 888 CAAGGACTGGGCACACATCTCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGA 961
|||.||||||||.||||||||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 870 CAAAGACTGGGCTCACATCTCCAACGAGGCCAAAGACCTCATCTCTAAGCTCCTGGTTCGAGATGCGAAGCAAA 943
Query 962 GACTTAGCGCCGCCCAAGTTCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGG------------------------------- 1004
||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 944 GACTCAGTGCTGCCCAGGTTCTGCAGCATCCATGGGTACAAGGGCAAGCTCCAGAAAGGGGACTCCCCACGCCG 1017
Query 1005 -------------GGAACAGCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCA 1065
|.|||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1018 CAAGTCCTTCAGAGAAACAGCAGCACCATGGACTTGACTCTCTTCGCAGCTGAGGCCATTGCCCTGAACCGCCA 1091
Query 1066 GCTATCTCAGCACGAAGAGAACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGC 1139
|||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|..|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1092 GCTGTCTCAGCATGAGGAGAATGAACTGGCCGAGGAACAGGAGGCCCTAGCTGAGGGCCTCTGCTCCATGAAGC 1165
Query 1140 TTTCCCCTCCCTGCAAGTCACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGG------------- 1200
|.||||||||.|.|||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||..|
Sbjct 1166 TGTCCCCTCCATCCAAATCTCGCCTGGCTCGAAGGCGAGCCCTGGCCCAGGCTGGCCGAAGCCGAGATGCAAAC 1239
Query 1201 ------------------------ 1200
Sbjct 1240 CCATGTTTGACACCGGCAGGGCTC 1263