Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487784
• Subject: XM_006502823.3
• Aligned Length: 1281
• Identities: 1039
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAAAAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  74
            |||  |||                      |.||||||||||||.||.||.|||||||||||||..|||..|||
Sbjct    1  ATG--ATC----------------------ACAGAGATGGGCAGCAGTGAGCCCCTTCCCATCGTGGATTCTGA  50

Query   75  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  148
            ||.||||||||||||||||||.|.|..|||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct   51  CAAGAGGAGGAAGAAGAAGCGTAAGACCCGGGCCACCGACTCTCTGCCAGGAAAGTTTGAAGATGTGTACCAGC  124

Query  149  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  222
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.||||||||.|||.||.|||
Sbjct  125  TGACCTCGGAATTGCTGGGAGAAGGAGCCTATGCCAAAGTCCAGGGTGCTGTGAACCTACAGAGTGGGAAGGAG  198

Query  223  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  199  TATGCTGTCAAAATCATCGAGAAGCAAGCCGGGCACAGTCGAAGTCGAGTGTTCCGTGAGGTGGAGACACTGTA  272

Query  297  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  370
            |||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  273  TCAGTGTCAAGGGAACAGGAACATTTTGGAGCTGATTGAATTCTTTGAAGATGACACACGGTTTTACTTGGTCT  346

Query  371  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  444
            |||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  347  TTGAGAAATTGCAAGGAGGCTCCATCCTAGCACACATCCAGAAGCGGAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGT  420

Query  445  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGGCATTGCTCATCGTGATCTGAAACC  518
            .||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  421  AGAGTGGTGCGGGACGTCGCCACTGCCCTTGACTTCCTGCACACTAAAGGCATTGCTCACCGTGATCTGAAGCC  494

Query  519  AGAAAATATATTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGA  592
            ||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  495  AGAAAACATACTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCGGTGAAAATTTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGG  568

Query  593  TGAAACTGAACAACTCCTGTACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATG  666
            |.||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  569  TAAAGTTGAACAACTCCTGCACTCCCATAACCACGCCAGAGCTGACTACTCCATGCGGCTCTGCAGAGTATATG  642

Query  667  GCCCCTGAGGTAGTGGAGGTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGG  740
            ||.||||||||.|||||||||||.|.||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  643  GCACCTGAGGTGGTGGAGGTCTTTAGGGACGAGGCTACTTTCTATGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGG  716

Query  741  CGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACC  814
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  717  TGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCCCCCTTTGTAGGTCACTGTGGGGCTGACTGTGGCTGGGACC  790

Query  815  GGGGCGAGGTCTGCAGGGTGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGAC  888
            ||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  791  GGGGAGAGGTATGCAGGATGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAGAGCATCCAGGAAGGCAAATACGAGTTTCCTGAC  864

Query  889  AAGGACTGGGCACACATCTCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAG  962
            ||.||||||||.||||||||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  865  AAAGACTGGGCTCACATCTCCAACGAGGCCAAAGACCTCATCTCTAAGCTCCTGGTTCGAGATGCGAAGCAAAG  938

Query  963  ACTTAGCGCCGCCCAAGTTCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGG--------------------------------  1004
            |||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||                                
Sbjct  939  ACTCAGTGCTGCCCAGGTTCTGCAGCATCCATGGGTACAAGGGCAAGCTCCAGAAAGGGGACTCCCCACGCCGC  1012

Query 1005  ------------GGAACAGCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAG  1066
                        |.|||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1013  AAGTCCTTCAGAGAAACAGCAGCACCATGGACTTGACTCTCTTCGCAGCTGAGGCCATTGCCCTGAACCGCCAG  1086

Query 1067  CTATCTCAGCACGAAGAGAACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCT  1140
            ||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|..|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1087  CTGTCTCAGCATGAGGAGAATGAACTGGCCGAGGAACAGGAGGCCCTAGCTGAGGGCCTCTGCTCCATGAAGCT  1160

Query 1141  TTCCCCTCCCTGCAAGTCACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGG--------------  1200
            .||||||||.|.|||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||..|              
Sbjct 1161  GTCCCCTCCATCCAAATCTCGCCTGGCTCGAAGGCGAGCCCTGGCCCAGGCTGGCCGAAGCCGAGATGCAAACC  1234

Query 1201  -----------------------  1200
                                   
Sbjct 1235  CATGTTTGACACCGGCAGGGCTC  1257