Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488574
• Subject: NM_003684.7
• Aligned Length: 1395
• Identities: 1236
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAAAAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  74
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------ATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  38

Query   75  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   39  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  112

Query  149  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  113  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  186

Query  223  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  187  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  260

Query  297  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  261  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  334

Query  371  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  408

Query  445  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAA---------------------------  491
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  409  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGACAAAGTCTCTCTCTGTCACCTAGG  482

Query  492  --------------------------------------------------------------------------  491
                                                                                      
Sbjct  483  CTGGAGTGCTATGGCGCCATCAGGGCTCACTGCAGCCCCAACCTCCCTGGGCTCCAGTGATCCTCCCACCTCAG  556

Query  492  ----------------------AGGCATTGCTCATCGTGATCTGAAACCAGAAAATATATTGTGTGAATCTCCA  543
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  557  CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATTGCTCATCGTGATCTGAAACCAGAAAATATATTGTGTGAATCTCCA  630

Query  544  GAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGATGAAACTGAACAACTCCTGTACCCC  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  GAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGATGAAACTGAACAACTCCTGTACCCC  704

Query  618  CATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATGGCCCCTGAGGTAGTGGAGGTCTTCA  691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  CATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATGGCCCCTGAGGTAGTGGAGGTCTTCA  778

Query  692  CGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGCGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGT  765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779  CGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGCGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGT  852

Query  766  GGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACCGGGGCGAGGTCTGCAGGGTGTGCCA  839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  853  GGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACCGGGGCGAGGTCTGCAGGGTGTGCCA  926

Query  840  GAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGACAAGGACTGGGCACACATCTCCAGTG  913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  927  GAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGACAAGGACTGGGCACACATCTCCAGTG  1000

Query  914  AAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAGACTTAGCGCCGCCCAAGTTCTGCAG  987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001  AAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAGACTTAGCGCCGCCCAAGTTCTGCAG  1074

Query  988  CACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCGCAAGTCCTCCAGAGGAACAGCAGCAC  1061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075  CACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCGCAAGTCCTCCAGAGGAACAGCAGCAC  1148

Query 1062  AATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAGCTATCTCAGCACGAAGAGAACGAAC  1135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149  AATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAGCTATCTCAGCACGAAGAGAACGAAC  1222

Query 1136  TAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCTTTCCCCTCCCTGCAAGTCACGCCTG  1209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223  TAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCTTTCCCCTCCCTGCAAGTCACGCCTG  1296

Query 1210  GCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGACAGGAGCCCGCCCACAGCACTC  1272
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297  GCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGACAGGAGCCCGCCCACAGCACTC  1359