Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488574
• Subject: NM_021461.5
• Aligned Length: 1286
• Identities: 1087
• Gaps: 55

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAAAAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  74
                                                ||||||||.||.||.|||||||||||||..|||..|||
Sbjct    1  ------------------------------------ATGGGCAGCAGTGAGCCCCTTCCCATCGTGGATTCTGA  38

Query   75  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  148
            ||.||||||||||||||||||.|.|..|||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct   39  CAAGAGGAGGAAGAAGAAGCGTAAGACCCGGGCCACCGACTCTCTGCCAGGAAAGTTTGAAGATGTGTACCAGC  112

Query  149  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  222
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.||||||||.|||.||.|||
Sbjct  113  TGACCTCGGAATTGCTGGGAGAAGGAGCCTATGCCAAAGTCCAGGGTGCTGTGAACCTACAGAGTGGGAAGGAG  186

Query  223  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  187  TATGCTGTCAAAATCATCGAGAAGCAAGCCGGGCACAGTCGAAGTCGAGTGTTCCGTGAGGTGGAGACACTGTA  260

Query  297  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  370
            |||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  261  TCAGTGTCAAGGGAACAGGAACATTTTGGAGCTGATTGAATTCTTTGAAGATGACACACGGTTTTACTTGGTCT  334

Query  371  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  444
            |||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  335  TTGAGAAATTGCAAGGAGGCTCCATCCTAGCACACATCCAGAAGCGGAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGT  408

Query  445  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGGCATTGCTCATCGTGATCTGAAACC  518
            .||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  409  AGAGTGGTGCGGGACGTCGCCACTGCCCTTGACTTCCTGCACACTAAAGGCATTGCTCACCGTGATCTGAAGCC  482

Query  519  AGAAAATATATTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGA  592
            ||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  483  AGAAAACATACTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCGGTGAAAATTTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGG  556

Query  593  TGAAACTGAACAACTCCTGTACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATG  666
            |.||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  557  TAAAGTTGAACAACTCCTGCACTCCCATAACCACGCCAGAGCTGACTACTCCATGCGGCTCTGCAGAGTATATG  630

Query  667  GCCCCTGAGGTAGTGGAGGTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGG  740
            ||.||||||||.|||||||||||.|.||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  GCACCTGAGGTGGTGGAGGTCTTTAGGGACGAGGCTACTTTCTATGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGG  704

Query  741  CGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACC  814
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  705  TGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCCCCCTTTGTAGGTCACTGTGGGGCTGACTGTGGCTGGGACC  778

Query  815  GGGGCGAGGTCTGCAGGGTGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGAC  888
            ||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  779  GGGGAGAGGTATGCAGGATGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAGAGCATCCAGGAAGGCAAATACGAGTTTCCTGAC  852

Query  889  AAGGACTGGGCACACATCTCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAG  962
            ||.||||||||.||||||||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  853  AAAGACTGGGCTCACATCTCCAACGAGGCCAAAGACCTCATCTCTAAGCTCCTGGTTCGAGATGCGAAGCAAAG  926

Query  963  ACTTAGCGCCGCCCAAGTTCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCGC  1036
            |||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  927  ACTCAGTGCTGCCCAGGTTCTGCAGCATCCATGGGTACAAGGGCAAGCTCCAGAAAGGGGACTCCCCACGCCGC  1000

Query 1037  AAGTCCTCCAGAGGAACAGCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAG  1110
            |||||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1001  AAGTCCTTCAGAGAAACAGCAGCACCATGGACTTGACTCTCTTCGCAGCTGAGGCCATTGCCCTGAACCGCCAG  1074

Query 1111  CTATCTCAGCACGAAGAGAACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCT  1184
            ||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|..|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1075  CTGTCTCAGCATGAGGAGAATGAACTGGCCGAGGAACAGGAGGCCCTAGCTGAGGGCCTCTGCTCCATGAAGCT  1148

Query 1185  TTCCCCTCCCTGCAAGTCACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGAC-AGGAGC  1257
            .||||||||.|.|||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||     ||||.| ||..||
Sbjct 1149  GTCCCCTCCATCCAAATCTCGCCTGGCTCGAAGGCGAGCCCTGGCCCAGGCTGGCC-----GAAGCCGAGATGC  1217

Query 1258  CCGCCCA-------------CAGCACTC  1272
            ...||||             |||..|||
Sbjct 1218  AAACCCATGTTTGACACCGGCAGGGCTC  1245