Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488574
• Subject: XM_006502825.3
• Aligned Length: 1273
• Identities: 912
• Gaps: 251

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAA-AAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTG  73
            |||         ||       ||| |.|||   ||||||||||||.||.||.|||||||||||||..|||..||
Sbjct    1  ATG---------CA-------GAACAGACC---AGAGATGGGCAGCAGTGAGCCCCTTCCCATCGTGGATTCTG  55

Query   74  ACAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAG  147
            |||.||||||||||||||||||.|.|..|||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct   56  ACAAGAGGAGGAAGAAGAAGCGTAAGACCCGGGCCACCGACTCTCTGCCAGGAAAGTTTGAAGATGTGTACCAG  129

Query  148  CTGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGA  221
            ||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.||||||||.|||.||.||
Sbjct  130  CTGACCTCGGAATTGCTGGGAGAAGGAGCCTATGCCAAAGTCCAGGGTGCTGTGAACCTACAGAGTGGGAAGGA  203

Query  222  GTATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGT  295
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  204  GTATGCTGTCAAAATCATCGAGAAGCAAGCCGGGCACAGTCGAAGTCGAGTGTTCCGTGAGGTGGAGACACTGT  277

Query  296  ATCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTC  369
            ||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  278  ATCAGTGTCAAGGGAACAGGAACATTTTGGAGCTGATTGAATTCTTTGAAGATGACACACGGTTTTACTTGGTC  351

Query  370  TTTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAG  443
            ||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  TTTGAGAAATTGCAAGGAGGCTCCATCCTAGCACACATCCAGAAGCGGAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAG  425

Query  444  CCGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGGCATTGCTCATCGTGATCTGAAAC  517
            ..||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  426  TAGAGTGGTGCGGGACGTCGCCACTGCCCTTGACTTCCTGCACACTAAAGGCATTGCTCACCGTGATCTGAAGC  499

Query  518  CAGAAAATATATTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGG  591
            |||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  CAGAAAACATACTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCGGTGAAAATTTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGG  573

Query  592  ATGAAACTGAACAACTCCTGTACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACAT  665
            .|.||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||
Sbjct  574  GTAAAGTTGAACAACTCCTGCACTCCCATAACCACGCCAGAGCTGACTACTCCATGCGGCTCTGCAGAGTATAT  647

Query  666  GGCCCCTGAGGTAGTGGAGGTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGG  739
            |||.||||||||.|||||||||||.|.||||.||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  GGCACCTGAGGTGGTGGAGGTCTTTAGGGACGAGGCTACTTTCTATGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGG  721

Query  740  GCGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGAC  813
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  722  GTGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCCCCCTTTGTAGGTCACTGTGGGGCTGACTGTGGCTGGGAC  795

Query  814  CGGGGCGAGGTCTGCAGGGTGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGA  887
            |||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  796  CGGGGAGAGGTATGCAGGATGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAGAGCATCCAGGAAGGCAAATACGAGTTTCCTGA  869

Query  888  CAAGGACTGGGCACACATCTCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGA  961
            |||.||||||||.||||||||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  870  CAAAGACTGGGCTCACATCTCCAACGAGGCCAAAGACCTCATCTCTAAGCTCCTGGTTCGAGATGCGAAGCAAA  943

Query  962  GACTTAGCGCCGCCCAAGTTCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCG  1035
            ||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||                 |.||||||            
Sbjct  944  GACTCAGTGCTGCCCAGGTTCTGCAGCATCCATGGGT-----------------ACAAGGGA------------  988

Query 1036  CAAGTCCTCCAGAGGAACAGCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCA  1109
                           |||||||||||.||||||.||||.|||||||||||                        
Sbjct  989  ---------------AACAGCAGCACCATGGACTTGACTCTCTTCGCAGC------------------------  1023

Query 1110  GCTATCTCAGCACGAAGAGAACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGC  1183
                                                                                      
Sbjct 1024  --------------------------------------------------------------------------  1023

Query 1184  TTTCCCCTCCCTGCAAGTCACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGACAGGAGC  1257
                                                                                      
Sbjct 1024  --------------------------------------------------------------------------  1023

Query 1258  CCGCCCACAGCACTC  1272
                           
Sbjct 1024  ---------------  1023