Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488574
• Subject: XM_017320015.1
• Aligned Length: 1272
• Identities: 896
• Gaps: 267

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAAAAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  74
                                                ||||||||.||.||.|||||||||||||..|||..|||
Sbjct    1  ------------------------------------ATGGGCAGCAGTGAGCCCCTTCCCATCGTGGATTCTGA  38

Query   75  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  148
            ||.||||||||||||||||||.|.|..|||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct   39  CAAGAGGAGGAAGAAGAAGCGTAAGACCCGGGCCACCGACTCTCTGCCAGGAAAGTTTGAAGATGTGTACCAGC  112

Query  149  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  222
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.||||||||.|||.||.|||
Sbjct  113  TGACCTCGGAATTGCTGGGAGAAGGAGCCTATGCCAAAGTCCAGGGTGCTGTGAACCTACAGAGTGGGAAGGAG  186

Query  223  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  187  TATGCTGTCAAAATCATCGAGAAGCAAGCCGGGCACAGTCGAAGTCGAGTGTTCCGTGAGGTGGAGACACTGTA  260

Query  297  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  370
            |||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  261  TCAGTGTCAAGGGAACAGGAACATTTTGGAGCTGATTGAATTCTTTGAAGATGACACACGGTTTTACTTGGTCT  334

Query  371  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  444
            |||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  335  TTGAGAAATTGCAAGGAGGCTCCATCCTAGCACACATCCAGAAGCGGAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGT  408

Query  445  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGGCATTGCTCATCGTGATCTGAAACC  518
            .||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  409  AGAGTGGTGCGGGACGTCGCCACTGCCCTTGACTTCCTGCACACTAAAGGCATTGCTCACCGTGATCTGAAGCC  482

Query  519  AGAAAATATATTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGA  592
            ||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  483  AGAAAACATACTGTGTGAATCTCCAGAAAAGGTGTCTCCGGTGAAAATTTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGG  556

Query  593  TGAAACTGAACAACTCCTGTACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATG  666
            |.||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  557  TAAAGTTGAACAACTCCTGCACTCCCATAACCACGCCAGAGCTGACTACTCCATGCGGCTCTGCAGAGTATATG  630

Query  667  GCCCCTGAGGTAGTGGAGGTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGG  740
            ||.||||||||.|||||||||||.|.||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  GCACCTGAGGTGGTGGAGGTCTTTAGGGACGAGGCTACTTTCTATGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGG  704

Query  741  CGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACC  814
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  705  TGTGGTCCTCTACATCATGCTGAGTGGCTACCCCCCCTTTGTAGGTCACTGTGGGGCTGACTGTGGCTGGGACC  778

Query  815  GGGGCGAGGTCTGCAGGGTGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGAC  888
            ||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  779  GGGGAGAGGTATGCAGGATGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAGAGCATCCAGGAAGGCAAATACGAGTTTCCTGAC  852

Query  889  AAGGACTGGGCACACATCTCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAG  962
            ||.||||||||.||||||||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  853  AAAGACTGGGCTCACATCTCCAACGAGGCCAAAGACCTCATCTCTAAGCTCCTGGTTCGAGATGCGAAGCAAAG  926

Query  963  ACTTAGCGCCGCCCAAGTTCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCGC  1036
            |||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||                 |.||||||             
Sbjct  927  ACTCAGTGCTGCCCAGGTTCTGCAGCATCCATGGGT-----------------ACAAGGGA-------------  970

Query 1037  AAGTCCTCCAGAGGAACAGCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAG  1110
                          |||||||||||.||||||.||||.|||||||||||                         
Sbjct  971  --------------AACAGCAGCACCATGGACTTGACTCTCTTCGCAGC-------------------------  1005

Query 1111  CTATCTCAGCACGAAGAGAACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCT  1184
                                                                                      
Sbjct 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005

Query 1185  TTCCCCTCCCTGCAAGTCACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGACAGGAGCC  1258
                                                                                      
Sbjct 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005

Query 1259  CGCCCACAGCACTC  1272
                          
Sbjct 1006  --------------  1005