Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489732
• Subject: NM_001329605.2
• Aligned Length: 1426
• Identities: 1045
• Gaps: 371

Alignment

Query    1  ATGGACCATCCTAGTAGGGAAAAGGATGAAAGACAACGGACAACTAAACCCATGGCACAAAGGAGTGCACACTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACCATCCTAGTAGGGAAAAGGATGAAAGACAACGGACAACTAAACCCATGGCACAAAGGAGTGCACACTG  74

Query   75  CTCTCGACCATCTGGCTCCTCATCGTCCTCTGGGGTTCTTATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTCGACCATCTGGCTCCTCATCGTCCTCTGGGGTTCTTATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA  148

Query  149  TAGGATGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCAATCAAACTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGGATGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCAATCAAACTG  222

Query  223  GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAGCTTCATTTAGAGTACAGATTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAGCTTCATTTAGAGTACAGATTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA  296

Query  297  AGGTCTCCCACAGGTGTATTACTTTGGACCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGTCTCCCACAGGTGTATTACTTTGGACCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA  370

Query  371  GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGTTG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  371  GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGCTG  444

Query  445  CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG  518

Query  519  TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG  592

Query  593  AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG  666

Query  667  CATCTTGGCA----------------------------------------------------------------  676
            ||||||||||                                                                
Sbjct  667  CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG  740

Query  677  ----------------------AAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA  728
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA  814

Query  729  ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG  888

Query  803  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC  962

Query  877  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGATTCTGGTG  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGATTCTGGTG  1036

Query  951  CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAATCAGA--  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1037  CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAATCAGAAT  1110

Query 1023  -------------GCCTTAGGACTGT------TACA---------GCTGAGCATTA---------TGATGT---  1056
                         ||| .||||..||      |.||         ||.||.||.||         |.|.||   
Sbjct 1111  GTATCATCAGAGCGCC-GAGGAGAGTGGGAAATTCAGCCCAGCCGGCAGACCAATACCTCATACCTAACGTCTC  1183

Query 1057  --------------------------------------------------------------------------  1056
                                                                                      
Sbjct 1184  ACTTGGCTGCAGACCGCCATGGGGGATCAGTGCAGGTGGTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGAT  1257

Query 1057  --------------------------------------------------------------------------  1056
                                                                                      
Sbjct 1258  CCCACGGGAGCCCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCATGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAAATGTAT  1331

Query 1057  --------------------------------------------------------------------------  1056
                                                                                      
Sbjct 1332  AATGTTTCATAAACCCTGGCACTGGTCACAAAGCTCAGCTGTGAAAATGAAATTTGTAGTATTTTTAAACATGA  1405

Query 1057  --------------------  1056
                                
Sbjct 1406  ATGTCAATTTCAAGTGTATT  1425