Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489760
• Subject: NM_004714.3
• Aligned Length: 1887
• Identities: 1767
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCAGGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCAGGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGA  74

Query   75  TGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGATGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGATGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTG  148

Query  149  TGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACTATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACTATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCG  222

Query  223  CCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTGAACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTGAACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTA  296

Query  297  CATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAATTGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAATTGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCC  370

Query  371  AGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGGCCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGGCCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTC  444

Query  445  CTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATGAACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATGAACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATAT  518

Query  519  AGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTGCCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTGCCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGT  592

Query  593  ACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGAACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGAACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGC  666

Query  667  ACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATTCACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATTCACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCT  740

Query  741  GTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGGCAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGGCAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACC  814

Query  815  AGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCCTGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCCTGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATG  888

Query  889  TGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAGCCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAGCCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCA  962

Query  963  GATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGCCATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGCCATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGT  1036

Query 1037  ACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGACGAAAGAACTCAGGA-----------------  1093
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct 1037  ACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGACGAAAGAACTCAGGAAGGATTACCAGGGCCCC  1110

Query 1094  --------------------------------------------------------------------------  1093
                                                                                      
Sbjct 1111  GGGACACGGCGGCTGCAGGAGGTGCTGGGCGTGCAGACGGGCGGGCCCGGGGGCCGGCGGGCGGGGGAGCCGGG  1184

Query 1094  -----------------------------AGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCA  1138
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCACAGCCCCGCCGACTACCTCCGCTTCCAGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCA  1258

Query 1139  TCAGCCCCCTGGGGGCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCA  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAGCCCCCTGGGGGCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCA  1332

Query 1213  GGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGCCCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAG  1286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGCCCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAG  1406

Query 1287  TTCTGGAGGCTCCAGTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTACCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTG  1360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTCTGGAGGCTCCAGTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTACCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTG  1480

Query 1361  GGCCCCCTATCACAGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCCACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGG  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCCCCCTATCACAGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCCACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGG  1554

Query 1435  GGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCCTCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACC  1508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCCTCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACC  1628

Query 1509  CCCCCAGCCCCGATACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTCACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCC  1582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCCCAGCCCCGATACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTCACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCC  1702

Query 1583  TGGTGGGCGGCCCTGCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGCCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTC  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGTGGGCGGCCCTGCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGCCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTC  1776

Query 1657  CGGACTCGGATGACTGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGG  1730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGGACTCGGATGACTGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGG  1850

Query 1731  CCTCCGTGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG  1767
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTCCGTGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG  1887