Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489760
• Subject: NM_006484.2
• Aligned Length: 1803
• Identities: 1767
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCAGGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCAGGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGA  74

Query   75  TGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGATGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGATGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTG  148

Query  149  TGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACTATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACTATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCG  222

Query  223  CCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTGAACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTGAACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTA  296

Query  297  CATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAATTGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAATTGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCC  370

Query  371  AGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGGCCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGGCCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTC  444

Query  445  CTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATGAACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATGAACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATAT  518

Query  519  AGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTGCCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTGCCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGT  592

Query  593  ACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGAACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGAACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGC  666

Query  667  ACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATTCACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATTCACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCT  740

Query  741  GTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGGCAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGGCAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACC  814

Query  815  AGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCCTGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCCTGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATG  888

Query  889  TGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAGCCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAGCCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCA  962

Query  963  GATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGCCATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGCCATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGT  1036

Query 1037  ACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGACGAAAGAACTCAGGA-----------------  1093
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct 1037  ACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGACGAAAGAACTCAGGAAGGATTACCAGGGCCCC  1110

Query 1094  -------------------AGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCATCAGCCCCCT  1148
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGACACGGCGGCTGCAGGAGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCATCAGCCCCCT  1184

Query 1149  GGGGGCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCAGGCAGCAGTG  1222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGGGCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCAGGCAGCAGTG  1258

Query 1223  CCTCCACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGCCCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAGTTCTGGAGGC  1296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCTCCACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGCCCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAGTTCTGGAGGC  1332

Query 1297  TCCAGTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTACCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTGGGCCCCCTAT  1370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCAGTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTACCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTGGGCCCCCTAT  1406

Query 1371  CACAGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCCACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGGGGTGATGTGC  1444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACAGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCCACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGGGGTGATGTGC  1480

Query 1445  CCCACAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCCTCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACCCCCCCAGCCC  1518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCACAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCCTCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACCCCCCCAGCCC  1554

Query 1519  CGATACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTCACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCCTGGTGGGCGG  1592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CGATACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTCACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCCTGGTGGGCGG  1628

Query 1593  CCCTGCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGCCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTCCGGACTCGGA  1666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCTGCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGCCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTCCGGACTCGGA  1702

Query 1667  TGACTGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGGCCTCCGTGGT  1740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGACTGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGGCCTCCGTGGT  1776

Query 1741  GTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG  1767
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG  1803