Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489760
• Subject: XM_006539527.3
• Aligned Length: 1947
• Identities: 1630
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGGCCGCTCGCCCACCGCACTGGGGTCCCCATCGCGCTCCAGCCCCCCGTGGGCCCAGCGCCATCCCTGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCGGGTCTCAGCGGCGGTGGCAGCCGAGGTGCAGGATGCGAGAAGGCGCCCCCCGGCCGGGCTCCCGCTCCAG  148

Query    1  --------------------------------ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCA  42
                                            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  149  GCCTCACGCCCCTGCGGCCCTCTGAGCCCACCATGGCCGTCCCACCAGGCCATGGTCCTTTCTCTGGCTTTCCG  222

Query   43  GGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGATGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGA  116
            |||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGCCCCAGGAACACACACAGGTACTACCTGATGTGCGGCTCCTGCCCCGGAGACTGCCCCTGGCCTTCCGGGA  296

Query  117  TGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTGTGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACT  190
            |||..||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCGGCCTCAGCCCCGCTGCGCAAGCTCTCGGTGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACT  370

Query  191  ATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCGCCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTG  264
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAACAGGCGCCACCCCAGGACTCGAGCACCAAAAAGGAGAAGAAGGTCCTG  444

Query  265  AACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTACATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAAT  338
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  445  AACCACGGTTATGATGACGACAACCACGACTACATTGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTAGAGCGCTATGAGAT  518

Query  339  TGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCCAGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGG  412
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  519  TGACTCTCTTATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCCAGGTGGTGAAAGCCTATGATCACCAGACTCAGGAGCTGGTGG  592

Query  413  CCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTCCTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATG  486
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  593  CCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCCTTCCTGAACCAGGCACAGATTGAGCTACGGCTGTTGGAGCTGATG  666

Query  487  AACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATATAGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTG  560
            |||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  AACCAGCATGATACAGAGATGAAGTACTACATAGTACACCTTAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAATCACCTGTG  740

Query  561  CCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGTACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGA  634
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||
Sbjct  741  CCTGGTGTTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGTACGACCTCCTCCGCAACACACACTTTCGGGGTGTCTCACTGA  814

Query  635  ACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGCACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATT  708
            |||||||..||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  815  ACCTGACGAGGAAGCTGGCACAGCAGCTCTGCACAGCTCTGCTCTTTCTGGCCACCCCCGAGCTCAGCATCATC  888

Query  709  CACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCTGTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGG  782
            |||||||||||||||||.||.||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  CACTGCGACCTCAAGCCTGAGAACATCCTGCTCTGCAACCCCAAGCGCAGTGCCATCAAGATCGTGGACTTCGG  962

Query  783  CAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACCAGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCC  856
            |||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  CAGTTCCTGCCAGCTTGGCCAGCGGATCTACCAGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCCGAGGTGCTCC  1036

Query  857  TGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATGTGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAG  930
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGGTACACCCTATGACCTGGCCATTGACATGTGGTCCCTGGGCTGCATCCTCGTGGAGATGCACACCGGAGAG  1110

Query  931  CCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCAGATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGC  1004
            |||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||.||||||||||.||.||..|
Sbjct 1111  CCCCTCTTCAGTGGCTCTAATGAGGTGGACCAGATGAGCCGTATTGTGGAGGTGTTGGGCATCCCTCCCGCACC  1184

Query 1005  CATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGTACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGA  1078
            |||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATGCTGGAACAGGCACCCAAGGCTCGAAAGTACTTTGAGCGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGA  1258

Query 1079  CGAAAGAACTCAGGAAGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCATCAGCCCCCTGGGG  1152
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1259  CAAAGGAACTCAGGAAGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAATATGAGCCCGCCGCCCGCATCAGCCCTCTGGGC  1332

Query 1153  GCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCAGGCAGCAGTGCCTC  1226
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTCTGCAGCATGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCAGGCAGCAGTGCCTC  1406

Query 1227  CACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGCCCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAGTTCTGGAGGCTCCA  1300
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1407  CACCTCGCCGGCGCCCCTTGACACCTGCCCCTCCTCTAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAGCTCTGGAGGTTCCA  1480

Query 1301  GTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTACCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTGGGCCCCCTATCACA  1374
            ||||||||||||..||||||.|..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1481  GTGGCTCCTCCAACGACAACAGAGCCTACCGATACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCAGGGCCCCCCATCACT  1554

Query 1375  GACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCCACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGGGGTGATGTGCCCCA  1448
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCTACCCTCCCAGCCTCTGCGCCCCTGGGCAGGGGGTGATGTGCCCCA  1628

Query 1449  CAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCCTCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACCCCCCCAGCCCCGAT  1522
            |||||||||||||||||||..|||||||||..||.||||.|||||.|||||.|||||||||||...||||||.|
Sbjct 1629  CAAGACACATCAAGCCCCTATCTCTGCCTCAACATTGCCGGGGACTGGGGCTCAGTTACCCCCATTGCCCCGTT  1702

Query 1523  ACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTCACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCCTGGTGGGCGGCCCT  1596
            .||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1703  GCCTTGGACGACCCCCATCACCAACATCACCACCACCCCCAGAGTTGATGGATGTGAGCCTGGTGGGCAGCCCT  1776

Query 1597  GCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGCCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTCCGGACTCGGATGAC  1670
            .|.||||||||.|||||||..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCAGACTGCTCTCCACCTCCTCCAGCACCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTCCGGACTCGGATGAC  1850

Query 1671  TGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGGCCTCCGTGGTGTAC  1744
            .||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||
Sbjct 1851  AGGAGGTCGACCACCTCTCCCACCCCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCGCCTGGGTCTCCATGGTGTAC  1924

Query 1745  CCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG  1767
            ||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1925  CCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCA  1947