Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491737
- Subject:
- NM_025696.3
- Aligned Length:
- 3668
- Identities:
- 3238
- Gaps:
- 13
Alignment
Query 1 ATGGAGGCGGCGCGCACGGAGCGCCCCGCAGGCAGGCCGGGGGCGCCGCTTGTCCGGACGGGGCTCCTACTCTT 74
|||||||||||..||||.|||||||||||||||.||||.|||||.||.||.|.||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGGAGGCGGCAGGCACTGAGCGCCCCGCAGGCTGGCCCGGGGCACCCCTCGCCCGGACTGGGCTGCTGCTCTT 74
Query 75 GTCGACGTGGGTCCTGGCCGGCGCCGAGATCACTTGGGACGCGACAGGCGGTCCCGGACGCCCGGCGGCCCCGG 148
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||.||||.||.|.||||||
Sbjct 75 GTCAACATGGGTCCTGGCCGGCGCCGAGATCACTTGGGGCGCGACAGGAGGTCCGGGGCGCCTGGTGTCCCCGG 148
Query 149 CTTCGCGGCCACCGGCGTTGTCTCCACTCTCGCCGCGGGCAGTGGCCAGCCAGTGGCCGGAGGAGCTGGCGTCG 222
||||.||.|||||.|.||||.||||.||||.|||.|||||||.||..|.||.||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 149 CTTCACGACCACCAGTGTTGCCTCCTCTCTTGCCACGGGCAGCGGAGAACCGGTGGCCTGAGGAGCTGGCATCT 222
Query 223 GCGCGGAGAGCCGCCGTGCTGGGGCGCCGGGCCGGACCAGAGCTGCTGCCCCAGCAGGGCGGCGGCAGAGGCGG 296
||.|||||||||||.|..|.|.|.||||||.||.|.|.|||||..||..|||| |||| ||..||||
Sbjct 223 GCACGGAGAGCCGCTGCACCGAGACGCCGGTCCAGGCTAGAGCCACTATCCCA----GGCG-----AGCCGCGG 287
Query 297 TGAGATGCAGGTGGAAGCCGGAGGGACATCACCGGCAGGCGAGCGGCGGGGCCGGGGCATCCCAGCTCCT-GCC 369
.|||||.|.|...|||||.|..||.|..||.||.|.|||||...||.|||.||.||||||.|||.||||| |||
Sbjct 288 GGAGATACGGACTGAAGCTGCGGGAATGTCGCCTGAAGGCGCTAGGTGGGTCCCGGGCATTCCATCTCCTAGCC 361
Query 370 AAGCTTGGCGGCGCGAGGAGGAGTCGCCGGGCGCAGCCCCCAATCACCCAGGAACGCGGGGACGCCTGGGCCAC 443
|.|| .|||.|.||||||||||.||||||||||||||||||||.|.|||.|||.|||||||||.|.|||||.||
Sbjct 362 AGGC-GGGCAGTGCGAGGAGGACTCGCCGGGCGCAGCCCCCAAGCCCCCTGGAGCGCGGGGACTCTTGGGCTAC 434
Query 444 TGCTCCGGCCGATGGTTCCAGAGGAAGCCGTCCCCTTGCTAAGGGTTCCCGGGAGGAGGTGAAGGCGCCGCGGG 517
|||||..||.||||||.|||.||||||||||||.|...|.||||||||.||.||||||||||.||||.|||||.
Sbjct 435 TGCTCTCGCAGATGGTGCCAAAGGAAGCCGTCCTCACACCAAGGGTTCGCGAGAGGAGGTGAGGGCGACGCGGA 508
Query 518 CTGGGGGGTCGGCGGCTGAAGACCTCCGGCTGCCCAGCACCTCCTTCGCGCTGACCGGGGACTCGGCCCACAAC 591
||||.||..||.|..||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 509 CTGGAGGAGCGTCCACTGAGGAGCTCCGGCTGCCCAGCACGTCTTTTGCACTGACCGGGGACTCGGCTCATAAC 582
Query 592 CAAGCCATGGTGCACTGGTCGGGACACAACAGCAGCGTCATACTTATCCTGACGAAGCTGTATGACTTCAACCT 665
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 583 CAAGCCATGGTGCACTGGTCGGGACACAACAGCAGTGTCATACTGATCCTGACGAAGCTCTATGACTTCAACCT 656
Query 666 GGGCAGCGTGACTGAGAGTTCACTATGGAGGTCGACAGATTATGGCACCACCTATGAAAAGCTGAATGACAAAG 739
|||.||.||||||||||||||.||.||||||||...||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 657 GGGGAGTGTGACTGAGAGTTCTCTGTGGAGGTCAGTAGATTATGGCGCCACCTATGAAAAACTTAATGACAAAG 730
Query 740 TGGGTTTGAAGACTGTCCTCAGTTACCTCTATGTCAATCCAACCAACAAAAGGAAGATTATGCTTCTCAGTGAT 813
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 731 TGGGTTTGAAGACCGTCCTCAGTTATCTCTATGTCAACCCCACCAACAAAAGGAAGATCATGCTCCTTAGTGAC 804
Query 814 CCTGAGATGGAGAGCAGCATATTGATCAGCTCAGACGAAGGGGCGACCTATCAGAAGTATCGGCTCACCTTCTA 887
||.||||||||||||||..||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 805 CCCGAGATGGAGAGCAGTGTACTGATCAGCTCAGATGAAGGGGCGACCTACCAAAAGTACCGGCTTACATTCTA 878
Query 888 TATCCAGAGCCTGCTCTTTCATCCCAAGCAAGAGGACTGGGTGCTGGCCTACAGTTTGGATCAAAAGCTCTACA 961
.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 879 CATCCAGAGCCTGCTCTTCCATCCCAAGCAGGAGGACTGGGTGCTGGCCTACAGCTTGGACCAAAAGCTTTATA 952
Query 962 GCTCCATGGACTTTGGAAGACGGTGGCAACTCATGCATGAACGCATCACACCCAACAGGTTTTATTGGTCGGTG 1035
|||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 953 GCTCCATGGACTTCGGCAGACGATGGCAACTCATGCATGAACGCATCACGCCCAACAGGTTTTACTGGTCGGTG 1026
Query 1036 GCCGGATTGGATAAGGAGGCGGACCTGGTGCACATGGAGGTGCGGACCACGGATGGATATGCTCACTACCTCAC 1109
.|.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||..|.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1027 TCTGGACTGGATAAGGAGGCAGACCTGGTGCACATGGAAGTGAGGACGGCAGATGGATATGCCCACTACCTCAC 1100
Query 1110 CTGCAGGATCCAGGAATGTGCCGAGACAACTAGAAGTGGGCCTTTTGCCCGCTCCATTGACATCAGTTCCCTGG 1183
||||||.|||||.||||||||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||
Sbjct 1101 CTGCAGAATCCAAGAATGTGCTGAGACAACTCGGAGCGGCCCTTTTGCCCGCTCCATTGACATCAGCTCCTTGG 1174
Query 1184 TTGTCCAGGATGAATATATCTTCATTCAGGTAACAACTA-GTGGAAGAGCCAGCTACTACGTGTCTTATCGAAG 1256
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||.|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1175 TTGTCCAGGATGAATATATCTTCATTCAGGTAACAA-TAGGTGGACGAGCCAGCTACTACGTGTCGTATCGAAG 1247
Query 1257 AGAGGCCTTTGCTCAGATAAAGCTGCCTAAGTACTCGTTGCCAAAGGACATGCACATCATCAGTACAGACGAGA 1330
|||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1248 AGAAGCCTTTGCCCAGATAAAGCTGCCCAAGTACTCCTTGCCAAAGGACATGCACATTATCAGTACCGATGAGA 1321
Query 1331 ACCAAGTATTTGCTGCGGTCCAAGAATGGAACCAGAATGACACGTACAACCTCTACATCTCAGACACGCGTGGG 1404
|||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1322 ACCAAGTGTTTGCAGCCGTCCAAGAATGGAACCAGAATGACACCTACAACCTCTACATCTCAGACACACGTGGG 1395
Query 1405 ATTTACTTCACTCTGGCCATGGAGAACATCAAGAGCAGCAGAGGTCTAATGGGGAACATCATTATTGAATTGTA 1478
||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1396 ATCTACTTTACCCTGGCTATGGAGAACATTAAGAGCAGCCGAGGTCTAATGGGAAACATCATTATTGAATTATA 1469
Query 1479 TGAGGTAGCAGGTATCAAAGGGATATTTCTGGCAAACAAGAAGGTGGACGACCAGGTGAAGACATACATCACTT 1552
||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470 TGAGGTAGCAGGTATCAAGGGGATATTCCTGGCAAACAAGAAGGTGGATGACCAGGTGAAGACATACATCACTT 1543
Query 1553 ACAACAAAGGCAGGGATTGGCGCCTGCTGCAAGCTCCGGATGTGGACCTGAGAGGAAGCCCAGTGCACTGCCTG 1626
||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct 1544 ACAACAAAGGCAGGGATTGGCGTCTCCTGCAAGCTCCAGATGTGGACCTGAGAGGAAGCCCAGTGCACTGTTTA 1617
Query 1627 CTGCCCTTCTGTTCCTTACATCTGCACCTGCAACTCTCTGAAAATCCATATTCCTCAGGAAGAATCTCTAGCAA 1700
|||||||||||||||.||||..||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1618 CTGCCCTTCTGTTCCCTACACTTGCATCTGCAGCTCTCTGAAAACCCATATTCCTCTGGAAGAATCTCCAGCAA 1691
Query 1701 GGAGACAGCCCCAGGACTTGTGGTGGCTACAGGCAACATTGGCCCGGAGCTCTCATATACTGATATTGGTGTGT 1774
|||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||.|.||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 1692 GGACACAGCGCCTGGACTTGTGGTTGCCACGGGTAATATTGGCTCCGAACTCTCCTATACGGATATCGGTGTGT 1765
Query 1775 TCATCTCCTCCGATGGGGGCAACACATGGAGACAGATCTTTGATGAAGAGTACAATGTCTGGTTCCTAGACTGG 1848
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766 TCATCTCCTCTGATGGGGGCAACACATGGAGACAGATCTTTGATGAAGAATACAATGTCTGGTTCCTAGACTGG 1839
Query 1849 GGTGGTGCCCTCGTGGCCATGAAACACACACCTCTGCCAGTCAGGCATTTGTGGGTGAGTTTTGATGAGGGCCA 1922
||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840 GGTGGTGCTCTGGTGGCCATGAAGCACACACCTCTGCCAGTCAGGCATTTGTGGGTGAGTTTTGATGAGGGCCA 1913
Query 1923 CTCTTGGGACAAGTATGGTTTCACTTCGGTTCCTCTCTTTGTTGACGGGGCTCTGGTGGAGGCAGGAATGGAGA 1996
.||.||||||||||||||||||||.|.|.|.|||||.||.||.||.|||||..||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1914 TTCCTGGGACAAGTATGGTTTCACATTGCTGCCTCTTTTCGTGGATGGGGCGTTGGTGGAGGCAGGAGTAGAGA 1987
Query 1997 CCCACATCATGACAGTTTTTGGCCACTTCAGCCTCCGCTCCGAATGGCAATTGGTGAAAGTGGACTACAAATCT 2070
|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1988 CGCACATCATGACAGTTTTTGGCCACTTCAGCCTGCGCTCCGAATGGCAGTTGGTGAAAGTGGACTACAAGTCT 2061
Query 2071 ATCTTCAGCCGGCATTGCACCAAGGAGGACTATCAGACCTGGCACCTGCTCAATCAGGGAGAGCCTTGTGTCAT 2144
|||||||||||||..||.|||||||||||||.|.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2062 ATCTTCAGCCGGCGCTGTACCAAGGAGGACTTTGAGACTTGGCACCTGCTCAATCAGGGAGAGCCTTGTGTCAT 2135
Query 2145 GGGAGAAAGGAAAATATTCAAGAAACGTAAGCCAGGAGCTCAGTGTGCCCTGGGCCGAGACCACTCAGGATCAG 2218
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||..||||.||.||.|
Sbjct 2136 GGGGGAAAGGAAAATATTCAAGAAACGCAAGCCAGGCGCTCAGTGTGCCCTTGGCAGAGAGTACTCTGGGTCGG 2209
Query 2219 TGGTCTCAGAACCCTGTGTCTGTGCCAATTGGGACTTCGAGTGTGACTATGGGTATGAGAGACATGGGGAGAGC 2292
||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 2210 TGGTGTCAGAACCCTGTGTCTGTGCGGACTGGGACTTCGAATGTGACTATGGCTATGAGAGACATGGAGAGAGC 2283
Query 2293 CAGTGTGTCCCAGCTTTCTGGTACAATCCAGCATCCCCATCAAAGGACTGCAGCCTTGGTCAAAGCTACCTTAA 2366
||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2284 CAGTGTGTCCCAGCTTTCTGGTACAACCCAGCTTCCCCTTCAAAGGACTGCAGCCTTGGTCAAAGCTACCTTAA 2357
Query 2367 CAGCACTGGGTATCGGCGGATTGTGTCCAACAACTGCACAGATGGGCTAAGGGAGAAGTACACCGCCAAGGCCC 2440
||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||.|||.|.|
Sbjct 2358 CAGCACTGGGTACCGGAGGATTGTATCCAACAACTGCACAGATGGGCTAAGGGATAAGTACTCTGCTAAGACTC 2431
Query 2441 AGATGTGCCCTGGAAAAGCCCCTCGGGGCCTCCATGTGGTGACGACCGATGGGCGGCTGGTGGCAGAGCAGGGG 2514
||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 2432 AGTTGTGTCCTGGAAAAGCTCCTCGGGGCCTCCATGTGGTGACCACTGACGGGCGCCTGGTGGCAGAACAGGGC 2505
Query 2515 CACAATGCAACTTTCATCATCCTCATGGAGGAGGGTGATCTACAAAGGACAAACATCCAGCTTGACTTTGGGGA 2588
|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2506 CACAATGCAACCTTCATCATTCTAATGGAGGAGGGTGACCTTCAAAGGACAAACATCCAGCTTGACTTTGGAGA 2579
Query 2589 TGGGATTGCTGTGTCCTACGCAAACTTCAGCCCCATCGAGGACGGCATCAAGCACGTGTATAAGAGTGCGGGGA 2662
||||.|.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.|||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2580 TGGGGTGGCTGTATCCTATGCCAACTTCAGCCCCATTGAGGATGGCATCAGGCATGTGTATAAGAGCGCGGGGA 2653
Query 2663 TCTTCCAGGTGACAGCCTATGCAGAGAACAACCTTGGCTCAGACACAGCTGTCCTCTTCCTGCATGTGGTTTGT 2736
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2654 TCTTCCAGGTGACAGCTTATGCGGAGAACAACCTTGGCTCGGACACAGCCTTCCTCTTCCTGCATGTGGTTTGT 2727
Query 2737 CCTGTGGAGCATGTTCATCTCCGAGTTCCATTTGTTGCCATAAGAAATAAGGAGGTCAACATCAGTGCAGTCGT 2810
||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2728 CCAGTGGAACACGTTCACCTTCGAGTCCCATTCGTCGCAATACGGAATAAGGACGTCAACATCAGTGCAGTTGT 2801
Query 2811 GTGGCCCAGTCAACTGGGGACCCTTACCTATTTCTGGTGGTTCGGCAATAGCACAAAGCCTCTCATCACTTTGG 2884
||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 2802 GTGGCCCAGTCAGCTAGGGACCCTCACCTACTTCTGGTGGTTTGGAAATAGCACAAAGCCCCTCATCACCTTGG 2875
Query 2885 ACAGCAGCATTTCCTTCACATTCCTTGCAGAAGGAACCGACACCATCACAGTCCAGGTGGCTGCTGGGAATGCC 2958
||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2876 ACAGCAGCATCTCTTTCACATTCCTTGCAGAGGGAACCAACACCATCACTGTCCAGGTTGCTGCTGGGAATGCC 2949
Query 2959 CTCATCCAGGACACAAAAGAGATTGCAGTTCATGAATATTTCCAGTCCCAGCTTTTATCATTCTCTCCTAATCT 3032
||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 2950 CTCATCCAAGACACAAAAGAGATTGCAGTACATGAATACTTCCAGTCACAGCTCTTATCGTTCTCTCCAAATCT 3023
Query 3033 GGATTACCACAATCCTGACATTCCTGAGTGGAGAAAAGATATTGGCAATGTCATCAAGCGAGCTCTGGTTAAAG 3106
||||||||||||||||||.||.|||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 3024 GGATTACCACAATCCTGATATCCCTGAGTGGAGGCAAGACATTGGCAATGTCATCAAGCGAGCTCTGATTAAAG 3097
Query 3107 TAACCAGTGTCCCAGAGGACCAGATCCTCATTGCCGTGTTTCCTGGTCTCCCCACTTCAGCAGAGCTTTTCATT 3180
|.||||||||||||||.||||||||||||.|.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 3098 TGACCAGTGTCCCAGAAGACCAGATCCTCGTGGCTGTGTTCCCGGGTCTCCCTACTTCAGCAGAGCTTTTCATT 3171
Query 3181 CTTCCACCCAAGAACCTGACAGAGAGGAGGAAAGGCAATGAAGGGGACCTGGAACAAATTGTAGAAACACTGTT 3254
||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 3172 CTCCCACCTAAGAACTTGACAGAGAGGAGGAAAGGCCACGAAGGGGATCTCGAACAAATTGTAGAGACACTATT 3245
Query 3255 TAATGCTCTCAACCAAAATTTGGTCCAGTTTGAGCTGAAGCCGGGGGTACAAGTCATTGTGTATGTCACACAGC 3328
||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 3246 TAATGCGCTTAATCAAAACTTGGTACAGTTTGAGCTGAAGCCAGGTGTCCAGGTCATTGTTTATGTCACACAGC 3319
Query 3329 TGACGTTAGCTCCATTGGTGGACTCCAGTGCTGGGCACAGCAGCTCAGCCATGCTTATGCTATTATCAGTGGTA 3402
||||.||||||||..|||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||..|.||.||||||
Sbjct 3320 TGACATTAGCTCCCCTGGTGGACTCCAGCGCTGGGCATAGCAGCTCTGCCATGCTTATGCTCCTCTCGGTGGTA 3393
Query 3403 TTTGTTGGCCTGGCTGTGTTTTTGATCTACAAGTTTAAAAGGAAAATCCCTTGGATTAACATCTATGCTCAAGT 3476
||.||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3394 TTCGTCGGCTTGGCTGTGTTTCTGATCTACAAGTTTAAAAGGAAAATCCCCTGGATTAACATCTATGCCCAAGT 3467
Query 3477 CCAACACGACAAGGAGCAGGAGATGATTGGGTCAGTGAGCCAAAGTGAAAACGCCCCCAAAATCACACTCAGTG 3550
||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 3468 CCAACATGACAAGGAACAGGAGATGATCGGGTCAGTGAGCCAAAGTGAGAATGCACCCAAAATCACACTCAGTG 3541
Query 3551 ACTTTACGGAGCCTGAGGAGCTGCTGGACAAAGAGCTGGACACGCGGGTCATAGGAGGCATTGCCACTATTGCA 3624
||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||
Sbjct 3542 ACTTCACCGAGCCCGAGGAGCTGCTGGACAAAGAGCTGGACACGCGGGTCATAGGAAGCATTGCCACCATTGCA 3615
Query 3625 AACAGCGAAAGCACAAAGGAGATCCCCAACTGCACTAGTGTT 3666
|.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3616 AGCAGCGAGAGCACAAAGGAGATCCCCAACTGCACTAGTGTT 3657