Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492256
• Subject: XM_017020967.1
• Aligned Length: 1866
• Identities: 1582
• Gaps: 276

Alignment

Query    1  ATGAACAAATTGAATTTTCATAACAACAGAGTCATGCAAGACCGCCGCAGTGTGTGCATTTTCCTTCCCAACGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACAAATTGAATTTTCATAACAACAGAGTCATGCAAGACCGCCGCAGTGTGTGCATTTTCCTTCCCAACGA  74

Query   75  TGAATCTCTGAACATCATCATAAATGTTAAGATTCTGTGTCACCAGTTGCTGGTCCAGGTTTGTGACCTGCTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAATCTCTGAACATCATCATAAATGTTAAGATTCTGTGTCACCAGTTGCTGGTCCAGGTTTGTGACCTGCTCA  148

Query  149  GGCTAAAGGACTGCCACCTCTTTGGACTCAGTGTTATACAAAATAATGAACATGTGTATATGGAGTTGTCACAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCTAAAGGACTGCCACCTCTTTGGACTCAGTGTTATACAAAATAATGAACATGTGTATATGGAGTTGTCACAA  222

Query  223  AAGCTTTACAAATATTGTCCAAAAGAATGGAAGAAAGAGGCCAGCAA------------------------GGG  272
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        |||
Sbjct  223  AAGCTTTACAAATATTGTCCAAAAGAATGGAAGAAAGAGGCCAGCAAGGTACGACAATACGAAGTCACTTGGGG  296

Query  273  TATCGACCAATTTGGGCCTCCTATGATCATCCACTTCCGTGTGCAGTACTATGTGGAAAATGGCAGATTGATCA  346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATCGACCAATTTGGGCCTCCTATGATCATCCACTTCCGTGTGCAGTACTATGTGGAAAATGGCAGATTGATCA  370

Query  347  GTGACAGAGCAGCAAGATACTATTATTACTGGCACCTGAGAAAACAAGTTCTTCATTCTCAGTGTGTGCTCCGA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGACAGAGCAGCAAGATACTATTATTACTGGCACCTGAGAAAACAAGTTCTTCATTCTCAGTGTGTGCTCCGA  444

Query  421  GAGGAGGCCTACTTCCTGCTGGCAGCCTTTGCCCTGCAGGCTGATCTTGGGAACTTCAAAAGGAATAAGCACTA  494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGAGGCCTACTTCCTGCTGGCAGCCTTTGCCCTGCAGGCTGATCTTGGGAACTTCAAAAGGAATAAGCACTA  518

Query  495  TGGAAAATACTTCGAGCCAGAGGCTTACTTCCCATCTTGGGTTGTTTCCAAGAGGGGGAAGGACTACATCCTGA  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGAAAATACTTCGAGCCAGAGGCTTACTTCCCATCTTGGGTTGTTTCCAAGAGGGGGAAGGACTACATCCTGA  592

Query  569  AGCACATTCCAAACATGCACAAAGATCAGTTTGCACTAACAGCTTCCGAAGCTCATCTTAAATATATCAAAGAG  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCACATTCCAAACATGCACAAAGATCAGTTTGCACTAACAGCTTCCGAAGCTCATCTTAAATATATCAAAGAG  666

Query  643  GCTGTCCGACTGGATGACGTCGCTGTTCATTACTACAGATTGTATAAGGATAAAAGGGAAATTGAAGCATCGCT  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTGTCCGACTGGATGACGTCGCTGTTCATTACTACAGATTGTATAAGGATAAAAGGGAAATTGAAGCATCGCT  740

Query  717  GACTCTTGGATTGACCATGAGGGGAATACAGATTTTTCAGAATTTAGATGAAGAGAAACAATTACTTTATGATT  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GACTCTTGGATTGACCATGAGGGGAATACAGATTTTTCAGAATTTAGATGAAGAGAAACAATTACTTTATGATT  814

Query  791  TCCCCTGGACAAATGTTGGAAAATTGGTGTTTGTGGGTAAGAAATTTGAGATTTTGCCAGATGGCTTGCCTTCT  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCCCTGGACAAATGTTGGAAAATTGGTGTTTGTGGGTAAGAAATTTGAGATTTTGCCAGATGGCTTGCCTTCT  888

Query  865  GCCCGGAAGCTCATATACTACACGGGGTGCCCCATGCGCTCCAGACACCTCCTGCAACTTCTGAGCAACAGCCA  938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCCGGAAGCTCATATACTACACGGGGTGCCCCATGCGCTCCAGACACCTCCTGCAACTTCTGAGCAACAGCCA  962

Query  939  CCGCCTCTATATGAATCTGCAGCCTGTCCTGCGCCATATCCGGAAGCTGGAGGAAAACGAAGAGAAGAAGCAGT  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGCCTCTATATGAATCTGCAGCCTGTCCTGCGCCATATCCGGAAGCTGGAGGAAAACGAAGAGAAGAAGCAGT  1036

Query 1013  ACCGGGAATCTTACATCAGTGACAACCTGGACCTCGACATGGACCAGCTGGAAAAACGGTCGCGGGCCAGCGGG  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCGGGAATCTTACATCAGTGACAACCTGGACCTCGACATGGACCAGCTGGAAAAACGGTCGCGGGCCAGCGGG  1110

Query 1087  AGCAGTGCGGGCAGCATGAAACACAAGCGCCTGTCCCGTCATTCCACCGCCAGCCACAGCAGTTCCCACACCTC  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCAGTGCGGGCAGCATGAAACACAAGCGCCTGTCCCGTCATTCCACCGCCAGCCACAGCAGTTCCCACACCTC  1184

Query 1161  GGGCATTGAGGCAGACACCAAGCCCCGGGACACGGGGCCAGAAGACAGCTACTCCAGCAGTGCCATCCACCGCA  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGCATTGAGGCAGACACCAAGCCCCGGGACACGGGGCCAGAAGACAGCTACTCCAGCAGTGCCATCCACCGCA  1258

Query 1235  AGCTGAAAACCTGCAGCTCAATGACCAGTCATGGCAGCTCCCACACCTCAGGGGTGGAGAGTGGCGGCAAAGAC  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCTGAAAACCTGCAGCTCAATGACCAGTCATGGCAGCTCCCACACCTCAGGGGTGGAGAGTGGCGGCAAAGAC  1332

Query 1309  CGGCTGGAAGAGGACTTACAGGACGATGAAATAGAGATGTTGGTTGATGACCCCCGGGATCTGGAGCAGATGAA  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGGCTGGAAGAGGACTTACAGGACGATGAAATAGAGATGTTGGTTGATGACCCCCGGGATCTGGAGCAGATGAA  1406

Query 1383  TGAAGAGTCTCTGGAAGTCAGCCCAGACATGTGCATCTACATCACAGAGGACATGCTCATGTCGCGGAAGCTGA  1456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGAAGAGTCTCTGGAAGTCAGCCCAGACATGTGCATCTACATCACAGAGGACATGCTCATGTCGCGGAAGCTGA  1480

Query 1457  ATGGACACTCTGGGTTGATTGTGAAAGAAATTGGGTCTTCCACCTCGAGCTCTTCAGAAACAGTTGTTAAGCTT  1530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGGACACTCTGGGTTGATTGTGAAAGAAATTGGGTCTTCCACCTCGAGCTCTTCAGAAACAGTTGTTAAGCTT  1554

Query 1531  CGTGGCCAGAGTACTGATTCTCTTCCACAGACTATATGTCGGAAACCAAAGACCTCCACTGATCGACACAGCTT  1604
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|       |.|||||||.|||         .|.||.||..|||
Sbjct 1555  CGTGGCCAGAGTACTGATTCTCTTCCACAGCC-------CAGAAACCACAGA---------TTGGAAACCACTT  1612

Query 1605  GAGCCTCGATGACATCAGACTTTACCAGAAAGACTTCCTGCGCATTGCAGGTCTGTGTCAGGACACTGCTCAGA  1678
                 ||                                                                   
Sbjct 1613  -----TC-------------------------------------------------------------------  1614

Query 1679  GTTACACCTTTGGATGTGGCCATGAACTGGATGAGGAAGGCCTCTATTGCAACAGTTGCTTGGCCCAGCAGTGC  1752
                                                                                      
Sbjct 1615  --------------------------------------------------------------------------  1614

Query 1753  ATCAACATCCAAGATGCTTTTCCAGTCAAAAGAACCAGCAAATACTTTTCTCTGGATCTCACTCATGATGAAGT  1826
                                                                                      
Sbjct 1615  --------------------------------------------------------------------------  1614

Query 1827  TCCAGAGTTTGTTGTG  1842
                            
Sbjct 1615  ----------------  1614