Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000492337
- Subject:
- NM_001161566.3
- Aligned Length:
- 3993
- Identities:
- 3803
- Gaps:
- 189
Alignment
Query 1 ATGGCGAGCGACTCCCCGGCTCGAAGCCTGGATGAAATAGATCTCTCGGCTCTGAGGGACCCCGCAGGGATCTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGAGCGACTCCCCGGCTCGAAGCCTGGATGAAATAGATCTCTCGGCTCTGAGGGACCCCGCAGGGATCTT 74
Query 75 TGAATTGGTGGAACTTGTTGGAAATGGAACATACGGGCAAGTTTATAAGGGTCGTCATGTCAAAACGGGCCAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAATTGGTGGAACTTGTTGGAAATGGAACATACGGGCAAGTTTATAAGGGTCGTCATGTCAAAACGGGCCAGC 148
Query 149 TTGCAGCCATCAAGGTTATGGATGTCACAGGGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACAAGAAATTAACATGTTGAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTGCAGCCATCAAGGTTATGGATGTCACAGGGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACAAGAAATTAACATGTTGAAG 222
Query 223 AAATATTCTCATCACCGGAATATTGCTACATACTATGGTGCTTTTATCAAAAAGAACCCACCAGGCATGGATGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAATATTCTCATCACCGGAATATTGCTACATACTATGGTGCTTTTATCAAAAAGAACCCACCAGGCATGGATGA 296
Query 297 CCAACTTTGGTTGGTGATGGAGTTTTGTGGTGCTGGCTCTGTCACCGACCTGATCAAGAACACAAAAGGTAACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAACTTTGGTTGGTGATGGAGTTTTGTGGTGCTGGCTCTGTCACCGACCTGATCAAGAACACAAAAGGTAACA 370
Query 371 CGTTGAAAGAGGAGTGGATTGCATACATCTGCAGGGAAATCTTACGGGGGCTGAGTCACCTGCACCAGCATAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGTTGAAAGAGGAGTGGATTGCATACATCTGCAGGGAAATCTTACGGGGGCTGAGTCACCTGCACCAGCATAAA 444
Query 445 GTGATTCATCGAGATATTAAAGGGCAAAATGTCTTGCTGACTGAAAATGCAGAAGTTAAACTAGTGGACTTTGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGATTCATCGAGATATTAAAGGGCAAAATGTCTTGCTGACTGAAAATGCAGAAGTTAAACTAGTGGACTTTGG 518
Query 519 AGTCAGTGCTCAGCTTGATCGAACAGTGGGCAGGAGGAATACTTTCATTGGAACTCCCTACTGGATGGCACCAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGTCAGTGCTCAGCTTGATCGAACAGTGGGCAGGAGGAATACTTTCATTGGAACTCCCTACTGGATGGCACCAG 592
Query 593 AAGTTATTGCCTGTGATGAAAACCCAGATGCCACATATGATTTCAAGAGTGACTTGTGGTCTTTGGGTATCACC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGTTATTGCCTGTGATGAAAACCCAGATGCCACATATGATTTCAAGAGTGACTTGTGGTCTTTGGGTATCACC 666
Query 667 GCCATTGAAATGGCAGAAGGTGCTCCCCCTCTCTGTGACATGCACCCCATGAGAGCTCTCTTCCTCATCCCCCG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCCATTGAAATGGCAGAAGGTGCTCCCCCTCTCTGTGACATGCACCCCATGAGAGCTCTCTTCCTCATCCCCCG 740
Query 741 GAACCCAGCGCCTCGGCTGAAGTCTAAGAAGTGGTCAAAAAAATTCCAGTCATTTATTGAGAGCTGCTTGGTAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAACCCAGCGCCTCGGCTGAAGTCTAAGAAGTGGTCAAAAAAATTCCAGTCATTTATTGAGAGCTGCTTGGTAA 814
Query 815 AGAATCACAGCCAGCGACCAGCAACAGAACAATTGATGAAGCATCCATTTATACGAGACCAACCTAATGAGCGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGAATCACAGCCAGCGACCAGCAACAGAACAATTGATGAAGCATCCATTTATACGAGACCAACCTAATGAGCGA 888
Query 889 CAGGTCCGCATTCAACTCAAGGACCATATTGATAGAACAAAGAAGAAGCGAGGAGAAAAAGATGAGACAGAGTA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAGGTCCGCATTCAACTCAAGGACCATATTGATAGAACAAAGAAGAAGCGAGGAGAAAAAGATGAGACAGAGTA 962
Query 963 TGAGTACAGTGGAAGTGAGGAAGAAGAGGAGGAGAATGACTCAGGAGAGCCCAGCTCCATCCTGAATCTGCCAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGAGTACAGTGGAAGTGAGGAAGAAGAGGAGGAGAATGACTCAGGAGAGCCCAGCTCCATCCTGAATCTGCCAG 1036
Query 1037 GGGAGTCGACGCTGCGGAGGGACTTTCTGAGGCTGCAGCTGGCCAACAAGGAGCGTTCTGAGGCCCTACGGAGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGGAGTCGACGCTGCGGAGGGACTTTCTGAGGCTGCAGCTGGCCAACAAGGAGCGTTCTGAGGCCCTACGGAGG 1110
Query 1111 CAGCAGCTGGAGCAGCAGCAGCGGGAGAATGAGGAGCACAAGCGGCAGCTGCTGGCCGAGCGTCAGAAGCGCAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGCAGCTGGAGCAGCAGCAGCGGGAGAATGAGGAGCACAAGCGGCAGCTGCTGGCCGAGCGTCAGAAGCGCAT 1184
Query 1185 CGAGGAGCAGAAAGAGCAGAGGCGGCGGCTGGAGGAGCAACAAAGGCGAGAGAAGGAGCTGCGGAAGCAGCAGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CGAGGAGCAGAAAGAGCAGAGGCGGCGGCTGGAGGAGCAACAAAGGCGAGAGAAGGAGCTGCGGAAGCAGCAGG 1258
Query 1259 AGAGGGAGCAGCGCCGGCACTATGAGGAGCAGATGCGCCGGGAGGAGGAGAGGAGGCGTGCGGAGCATGAACAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGAGGGAGCAGCGCCGGCACTATGAGGAGCAGATGCGCCGGGAGGAGGAGAGGAGGCGTGCGGAGCATGAACAG 1332
Query 1333 GAATATAAGCGCAAACAATTGGAAGAACAGAGACAAGCAGAAAGACTGCAGAGGCAGCTAAAGCAAGAAAGAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAATATAAGCGCAAACAATTGGAAGAACAGAGACAAGCAGAAAGACTGCAGAGGCAGCTAAAGCAAGAAAGAGA 1406
Query 1407 CTACTTAGTTTCCCTTCAGCATCAGCGGCAGGAGCAGAGGCCTGTGGAGAAGAAGCCACTGTACCATTACAAAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTACTTAGTTTCCCTTCAGCATCAGCGGCAGGAGCAGAGGCCTGTGGAGAAGAAGCCACTGTACCATTACAAAG 1480
Query 1481 AAGGAATGAGTCCTAGTGAGAAGCCAGCATGGGCCAAGGAGGTAGAAGAACGGTCAAGGCTCAACCGGCAAAGT 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGGAATGAGTCCTAGTGAGAAGCCAGCATGGGCCAAGG----------------------------------- 1519
Query 1555 TCCCCTGCCATGCCTCACAAGGTTGCCAACAGGATATCTGACCCCAACCTGCCCCCAAGGTCGGAGTCCTTCAG 1628
Sbjct 1520 -------------------------------------------------------------------------- 1519
Query 1629 CATTAGTGGAGTTCAGCCTGCTCGAACACCCCCCATGCTCAGACCAGTCGATCCCCAGATCCCACATCTGGTAG 1702
||||||||||||||||||
Sbjct 1520 --------------------------------------------------------AGATCCCACATCTGGTAG 1537
Query 1703 CTGTAAAATCCCAGGGACCTGCCTTGACCGCCTCCCAGTCAGTGCACGAGCAGCCCACAAAGGGCCTCTCTGGG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1538 CTGTAAAATCCCAGGGACCTGCCTTGACCGCCTCCCAGTCAGTGCACGAGCAGCCCACAAAGGGCCTCTCTGGG 1611
Query 1777 TTTCAGGAGGCTCTGAACGTGACCTCCCACCGCGTGGAGATGCCACGCCAGAACTCAGATCCCACCTCGGAAAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612 TTTCAGGAGGCTCTGAACGTGACCTCCCACCGCGTGGAGATGCCACGCCAGAACTCAGATCCCACCTCGGAAAA 1685
Query 1851 TCCTCCTCTCCCCACTCGCATTGAAAAGTTTGACCGAAGCTCTTGGTTACGACAGGAAGAAGACATTCCACCAA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1686 TCCTCCTCTCCCCACTCGCATTGAAAAGTTTGACCGAAGCTCTTGGTTACGACAGGAAGAAGACATTCCACCAA 1759
Query 1925 AGGTGCCTCAAAGAACAACTTCTATATCCCCAGCATTAGCCAGAAAGAATTCTCCTGGGAATGGTAGTGCTCTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1760 AGGTGCCTCAAAGAACAACTTCTATATCCCCAGCATTAGCCAGAAAGAATTCTCCTGGGAATGGTAGTGCTCTG 1833
Query 1999 GGACCCAGACTAGGATCTCAACCCATCAGAGCAAGCAACCCTGATCTCCGGAGAACTGAGCCCATCTTGGAGAG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834 GGACCCAGACTAGGATCTCAACCCATCAGAGCAAGCAACCCTGATCTCCGGAGAACTGAGCCCATCTTGGAGAG 1907
Query 2073 CCCCTTGCAGAGGACCAGCAGTGGCAGTTCCTCCAGCTCCAGCACCCCTAGCTCCCAGCCCAGCTCCCAAGGAG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908 CCCCTTGCAGAGGACCAGCAGTGGCAGTTCCTCCAGCTCCAGCACCCCTAGCTCCCAGCCCAGCTCCCAAGGAG 1981
Query 2147 GCTCCCAGCCTGGATCACAAGCAGGATCCAGTGAACGCACCAGAGTTCGAGCCAACAGTAAGTCAGAAGGATCA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1982 GCTCCCAGCCTGGATCACAAGCAGGATCCAGTGAACGCACCAGAGTTCGAGCCAACAGTAAGTCAGAAGGATCA 2055
Query 2221 CCTGTGCTCCCCCATGAGCCTGCCAAGGTGAAACCAGAAGAATCCAGGGACATTACCCGGCCCAGTCGACCAGC 2294
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2056 CCTGTGCTCCCCCATGAGCCTGCGAAGGTGAAACCAGAAGAATCCAGGGACATTACCCGGCCCAGTCGACCAGC 2129
Query 2295 TAGCTACAAAAAAGCTATAGATGAGGATCTGACGGCATTAGCCAAAGAACTAAGAGAACTCCGGATTGAAGAAA 2368
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130 T------------------------GATCTGACGGCATTAGCCAAAGAACTAAGAGAACTCCGGATTGAAGAAA 2179
Query 2369 CAAACCGCCCAATGAAGAAGGTGACTGATTACTCCTCCTCCAGTGAGGAGTCAGAAAGTAGCGAGGAAGAGGAG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2180 CAAACCGCCCAATGAAGAAGGTGACTGATTACTCCTCCTCCAGTGAGGAGTCAGAAAGTAGCGAGGAAGAGGAG 2253
Query 2443 GAAGATGGAGAGAGCGAGACCCATGATGGGACAGTGGCTGTCAGCGACATACCCAGACTGATACCAACAGGAGC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2254 GAAGATGGAGAGAGCGAGACCCATGATGGGACAGTGGCTGTCAGCGACATACCCAGACTGATACCAACAGGAGC 2327
Query 2517 TCCAGGCAGCAACGAGCAGTACAATGTGGGAATGGTGGGGACGCATGGGCTGGAGACCTCTCATGCGGACAGTT 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2328 TCCAGGCAGCAACGAGCAGTACAATGTGGGAATGGTGGGGACGCATGGGCTGGAGACCTCTCATGCGGACAGTT 2401
Query 2591 TCAGCGGCAGTATTTCAAGAGAAGGAACCTTGATGATTAGAGAGACGTCTGGAGAGAAGAAGCGATCTGGCCAC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2402 TCAGCGGCAGTATTTCAAGAGAAGGAACCTTGATGATTAGAGAGACGTCTGGAGAGAAGAAGCGATCTGGCCAC 2475
Query 2665 AGTGACAGCAATGGCTTTGCTGGCCACATCAACCTCCCTGACCTGGTGCAGCAGAGCCATTCTCCAGCTGGAAC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2476 AGTGACAGCAATGGCTTTGCTGGCCACATCAACCTCCCTGACCTGGTGCAGCAGAGCCATTCTCCAGCTGGAAC 2549
Query 2739 CCCGACTGAGGGACTGGGGCGCGTCTCAACCCATTCCCAGGAGATGGACTCTGGGACTGAATATGGCATGGGGA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2550 CCCGACTGAGGGACTGGGGCGCGTCTCAACCCATTCCCAGGAGATGGACTCTGGGACTGAATATGGCATGGGGA 2623
Query 2813 GCAGCACCAAAGCCTCCTTCACCCCCTTTGTGGACCCCAGAGTATACCAGACGTCTCCCACTGATGAAGATGAA 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2624 GCAGCACCAAAGCCTCCTTCACCCCCTTTGTGGACCCCAGAGTATACCAGACGTCTCCCACTGATGAAGATGAA 2697
Query 2887 GAGGATGAGGAATCATCAGCCGCAGCTCTGTTTACTAGCGAACTTCTTAGGCAAGAACAGGCCAAACTCAATGA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2698 GAGGATGAGGAATCATCAGCCGCAGCTCTGTTTACTAGCGAACTTCTTAGGCAAGAACAGGCCAAACTCAATGA 2771
Query 2961 AGCAAGAAAGATTTCGGTGGTAAATGTAAACCCAACCAACATTCGGCCTCATAGCGACACACCAGAAATCAGAA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2772 AGCAAGAAAGATTTCGGTGGTAAATGTAAACCCAACCAACATTCGGCCTCATAGCGACACACCAGAAATCAGAA 2845
Query 3035 AATACAAGAAACGATTCAACTCAGAAATACTTTGTGCAGCTCTGTGGGGTGTAAACCTTCTGGTGGGGACTGAA 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2846 AATACAAGAAACGATTCAACTCAGAAATACTTTGTGCAGCTCTGTGGGGTGTAAACCTTCTGGTGGGGACTGAA 2919
Query 3109 AATGGCCTGATGCTTTTGGACCGAAGTGGGCAAGGCAAAGTCTATAATCTGATCAACCGGAGGCGATTTCAGCA 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2920 AATGGCCTGATGCTTTTGGACCGAAGTGGGCAAGGCAAAGTCTATAATCTGATCAACCGGAGGCGATTTCAGCA 2993
Query 3183 GATGGATGTGCTAGAGGGACTGAATGTCCTTGTGACAATTTCAGGAAAGAAGAATAAGCTACGAGTTTACTATC 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2994 GATGGATGTGCTAGAGGGACTGAATGTCCTTGTGACAATTTCAGGAAAGAAGAATAAGCTACGAGTTTACTATC 3067
Query 3257 TTTCATGGTTAAGAAACAGAATACTACATAATGACCCAGAAGTAGAAAAGAAACAAGGCTGGATCACTGTTGGG 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3068 TTTCATGGTTAAGAAACAGAATACTACATAATGACCCAGAAGTAGAAAAGAAACAAGGCTGGATCACTGTTGGG 3141
Query 3331 GACTTGGAAGGCTGTATACATTATAAAGTTGTTAAATATGAAAGGATCAAATTTTTGGTGATTGCCTTAAAGAA 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3142 GACTTGGAAGGCTGTATACATTATAAAGTTGTTAAATATGAAAGGATCAAATTTTTGGTGATTGCCTTAAAGAA 3215
Query 3405 TGCTGTGGAAATATATGCTTGGGCTCCTAAACCGTATCATAAATTCATGGCATTTAAGTCTTTTGCAGATCTCC 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3216 TGCTGTGGAAATATATGCTTGGGCTCCTAAACCGTATCATAAATTCATGGCATTTAAGTCTTTTGCAGATCTCC 3289
Query 3479 AGCACAAGCCTCTGCTAGTTGATCTCACGGTAGAAGAAGGTCAAAGATTAAAGGTTATTTTTGGTTCACACACT 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3290 AGCACAAGCCTCTGCTAGTTGATCTCACGGTAGAAGAAGGTCAAAGATTAAAGGTTATTTTTGGTTCACACACT 3363
Query 3553 GGTTTCCATGTAATTGATGTTGATTCAGGAAACTCTTATGATATCTACATACCATCTCATATTCAGGGCAATAT 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3364 GGTTTCCATGTAATTGATGTTGATTCAGGAAACTCTTATGATATCTACATACCATCTCATATTCAGGGCAATAT 3437
Query 3627 CACTCCTCATGCTATTGTCATCTTGCCTAAAACAGATGGAATGGAAATGCTTGTTTGCTATGAGGATGAGGGGG 3700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3438 CACTCCTCATGCTATTGTCATCTTGCCTAAAACAGATGGAATGGAAATGCTTGTTTGCTATGAGGATGAGGGGG 3511
Query 3701 TGTATGTAAACACCTATGGCCGGATAACTAAGGATGTGGTGCTCCAATGGGGAGAAATGCCCACGTCTGTGGCC 3774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3512 TGTATGTAAACACCTATGGCCGGATAACTAAGGATGTGGTGCTCCAATGGGGAGAAATGCCCACGTCTGTGGCC 3585
Query 3775 TACATTCATTCCAATCAGATAATGGGCTGGGGCGAGAAAGCTATTGAGATCCGGTCAGTGGAAACAGGACATTT 3848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3586 TACATTCATTCCAATCAGATAATGGGCTGGGGCGAGAAAGCTATTGAGATCCGGTCAGTGGAAACAGGACATTT 3659
Query 3849 GGATGGAGTATTTATGCATAAGCGAGCTCAAAGGTTAAAGTTTCTATGTGAAAGAAATGATAAGGTATTTTTTG 3922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3660 GGATGGAGTATTTATGCATAAGCGAGCTCAAAGGTTAAAGTTTCTATGTGAAAGAAATGATAAGGTATTTTTTG 3733
Query 3923 CATCCGTGCGATCTGGAGGAAGTAGCCAAGTGTTTTTCATGACCCTCAACAGAAATTCCATGATGAACTGG 3993
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3734 CATCCGTGCGATCTGGAGGAAGTAGCCAAGTGTTTTTCATGACCCTCAACAGAAATTCCATGATGAACTGG 3804