Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00472
• Subject: NM_001290360.3
• Aligned Length: 1776
• Identities: 1772
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGTTTGGGATTCAGGAAAGCATCCAACGGAGTGGAAGCAGCATGAAGGAAGAGCCGCTGGGCAGCGGCATGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTGGGATTCAGGAAAGCATCCAACGGAGTGGAAGCAGCATGAAGGAAGAGCCGCTGGGCAGCGGCATGAA  74

Query   75  CGCGGTGCGGACGTGGATGCAGGGCGCCGGGGTGCTGGACGCCAACACGGCGGCGCAGAGCGGGGTGGGTCTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCGGTGCGGACGTGGATGCAGGGCGCCGGGGTGCTGGACGCCAACACGGCGGCGCAGAGCGGGGTGGGTCTGG  148

Query  149  CCCGGGCTCACTTTGAGAAGCAGCCGCCTTCCAATCTGCGGAAATCCAACTTCTTCCACTTCGTCCTGGCCCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCGGGCTCACTTTGAGAAGCAGCCGCCTTCCAATCTGCGGAAATCCAACTTCTTCCACTTCGTCCTGGCCCTC  222

Query  223  TACGACAGACAGGGCCAGCCCGTGGAGATCGAGAGGACAGCGTTTGTGGGGTTCGTGGAGAAGGAAAAAGAAGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACGACAGACAGGGCCAGCCCGTGGAGATCGAGAGGACAGCGTTTGTGGGGTTCGTGGAGAAGGAAAAAGAAGC  296

Query  297  CAACAGCGAAAAGACCAATAACGGAATTCACTACCGGCTTCAGCTTCTCTACAGCAATGGGATAAGGACGGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAACAGCGAAAAGACCAATAACGGAATTCACTACCGGCTTCAGCTTCTCTACAGCAATGGGATAAGGACGGAGC  370

Query  371  AGGATTTCTACGTGCGCCTCATTGACTCCATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGATTTCTACGTGCGCCTCATTGACTCCATGACAAAACAAGCCATAGTGTATGAAGGCCAAGACAAGAACCCA  444

Query  445  GAAATGTGCCGAGTCTTGCTCACACATGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAATGTGCCGAGTCTTGCTCACACATGAGATCATGTGCAGCCGCTGTTGTGACAAGAAAAGCTGTGGCAACCG  518

Query  519  AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCTTGAAATTTTTCCTCAAATGTAACCAAAATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAATGAGACTCCCTCAGATCCAGTGATAATTGACAGGTTCTTCTTGAAATTTTTCCTCAAATGTAACCAAAATT  592

Query  593  GCCTAAAGAATGCGGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACGACAGTCAATGTGGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCTAAAGAATGCGGGAAACCCACGTGACATGCGGAGATTCCAGGTCGTGGTGTCTACGACAGTCAATGTGGAT  666

Query  667  GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCATAATAATTCCAAGCATGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCATGTCCTGGCAGTCTCTGATAACATGTTTGTCCATAATAATTCCAAGCATGGGCGGAGGGCTCGGAGGCT  740

Query  741  TGACCCCTCGGAAGGTACGCCCTCTTATCTGGAACAT---GCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTG  811
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACCCCTCGGAAGGTACGCCCTCTTATCTGGAACATGCAGCTACTCCCTGTATCAAAGCCATCAGCCCGAGTG  814

Query  812  AAGGATGGACGACGGGAGGTGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTC  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGGATGGACGACGGGAGGTGCGACTGTGATCATCATAGGGGACAATTTCTTTGATGGGTTACAGGTCATATTC  888

Query  886  GGTACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATCACTCCTCATGCCATCCGTGTGCAGACCCCTCCTCGGCACATCCC  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTACCATGCTGGTCTGGAGTGAGTTGATCACTCCTCATGCCATCCGTGTGCAGACCCCTCCTCGGCACATCCC  962

Query  960  TGGTGTTGTGGAAGTCACACTGTCCTACAAATCTAAGCAGTTCTGCAAAGGAACACCAGGCAGATTCATTTATA  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGTGTTGTGGAAGTCACACTGTCCTACAAATCTAAGCAGTTCTGCAAAGGAACACCAGGCAGATTCATTTATA  1036

Query 1034  CAGCGCTCAACGAACCCACCATCGATTATGGTTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCACCCTGGTGAC  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGCGCTCAACGAACCCACCATCGATTATGGTTTCCAGAGGTTACAGAAGGTCATTCCTCGGCACCCTGGTGAC  1110

Query 1108  CCTGAGCG-TTGCCAAAGGAAGTAATACTCAAAAGGGCTGCGGATCTGGTAGAAGCACTGTATGGGATGCCACA  1180
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTGAGCGTTTGCCAAAGGAAGTAATACTCAAAAGGGCTGCGGATCTGGTAGAAGCACTGTATGGGATGCCACA  1184

Query 1181  CAACAACCAGGAAATCATTCTGAAGAGAGCGGCCGACATTGCCGAGGCCCTGTACAGTGTTCCCCGCAACCACA  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAACAACCAGGAAATCATTCTGAAGAGAGCGGCCGACATTGCCGAGGCCCTGTACAGTGTTCCCCGCAACCACA  1258

Query 1255  ACCAACTCCCGGCCCTTGCTAACACCTCGGTCCACGCAGGGATGATGGGCGTGAATTCGTTCAGTGGACAACTG  1328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCAACTCCCGGCCCTTGCTAACACCTCGGTCCACGCAGGGATGATGGGCGTGAATTCGTTCAGTGGACAACTG  1332

Query 1329  GCCGTGAATGTCTCCGAGGCATCACAAGCCACCAATCAGGGTTTCACCCGCAACTCAAGCAGCGTATCACCACA  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCGTGAATGTCTCCGAGGCATCACAAGCCACCAATCAGGGTTTCACCCGCAACTCAAGCAGCGTATCACCACA  1406

Query 1403  CGGGTACGTGCCGAGCACCACTCCCCAGCAGACCAACTATAACTCCGTCACCACGAGCATGAACGGATACGGCT  1476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGGGTACGTGCCGAGCACCACTCCCCAGCAGACCAACTATAACTCCGTCACCACGAGCATGAACGGATACGGCT  1480

Query 1477  CTGCCGCAATGTCCAATTTGGGCGGCTCCCCCACCTTCCTCAACGGCTCAGCTGCCAACTCCCCCTATGCCATA  1550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGCCGCAATGTCCAATTTGGGCGGCTCCCCCACCTTCCTCAACGGCTCAGCTGCCAACTCCCCCTATGCCATA  1554

Query 1551  GTGCCATCCAGCCCCACCATGGCCTCCTCCACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGCAGCTCCTCGGGCATCTTCTC  1624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGCCATCCAGCCCCACCATGGCCTCCTCCACAAGCCTCCCCTCCAACTGCAGCAGCTCCTCGGGCATCTTCTC  1628

Query 1625  CTTCTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCCGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTCGTCAGACCCCAGACCT  1698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTCTCACCAGCCAACATGGTCTCAGCCGTGAAACAGAAGAGTGCTTTCGCACCAGTCGTCAGACCCCAGACCT  1702

Query 1699  CCCCACCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTTCCTCCTATG  1772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCCCACCTCCCACCTGCACCAGCACCAACGGGAACAGCCTGCAAGCGATATCTGGCATGATTGTTCCTCCTATG  1776