Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00980
• Subject: XM_017006441.1
• Aligned Length: 1146
• Identities: 834
• Gaps: 312

Alignment

Query    1  ATGGCTGTTAGTGTCACACCAATTCGGGACACAAAATGGCTAACACTGGAAGTATGTAGAGAGTTCCAGAGGGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GACTTGCTCACGGCCAGACACGGAATGTAAATTTGCACATCCTTCGAAAAGCTGCCAAGTTGAAAATGGACGAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TAATCGCCTGCTTTGATTCATTGAAAGGCCGTTGCTCCAGGGAGAACTGCAAATATCTTCATCCACCCCCACAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTAAAAACGCAGTTGGAGATAAATGGACGCAATAACTTGATTCAGCAGAAGAACATGGCCATGTTGGCCCAGCA  296
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------ATGGCCATGTTGGCCCAGCA  20

Query  297  AATGCAACTAGCCAATGCCATGATGCCTGGTGCCCCATTACAACCCGTGCCAATGTTTTCAGTTGCACCAAGCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   21  AATGCAACTAGCCAATGCCATGATGCCTGGTGCCCCATTACAACCCGTGCCAATGTTTTCAGTTGCACCAAGCT  94

Query  371  TAGCCACCAATGCATCAGCAGCCGCCTTTAATCCCTATCTGGGACCTGTTTCTCCAAGCCTGGTCCCGGCAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   95  TAGCCACCAATGCATCAGCAGCCGCCTTTAATCCCTATCTGGGACCTGTTTCTCCAAGCCTGGTCCCGGCAGAG  168

Query  445  ATCTTGCCGACTGCACCAATGTTGGTTACAGGGAATCCGGGTGTCCCTGTACCTGCAGCTGCTGCAGCTGCTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  169  ATCTTGCCGACTGCACCAATGTTGGTTACAGGGAATCCGGGTGTCCCTGTACCTGCAGCTGCTGCAGCTGCTGC  242

Query  519  ACAGAAATTAATGCGAACAGACAGACTTGAGGTATGTCGAGAGTACCAACGTGGCAATTGCAACCGAGGAGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  243  ACAGAAATTAATGCGAACAGACAGACTTGAGGTATGTCGAGAGTACCAACGTGGCAATTGCAACCGAGGAGAAA  316

Query  593  ATGATTGTCGGTTTGCTCATCCTGCTGACAGCACAATGATTGACACCAATGACAACACAGTCACTGTGTGTATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  317  ATGATTGTCGGTTTGCTCATCCTGCTGACAGCACAATGATTGACACCAATGACAACACAGTCACTGTGTGTATG  390

Query  667  GATTACATCAAAGGGAGATGCTCTCGGGAAAAGTGCAAATACTTTCATCCCCCTGCACATTTGCAAGCCAAGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  391  GATTACATCAAAGGGAGATGCTCTCGGGAAAAGTGCAAATACTTTCATCCCCCTGCACATTTGCAAGCCAAGAT  464

Query  741  CAAGGCTGCCCAATACCAGGTCAACCAGGCTGCAGCTGCACAGGCTGCAGCCACCGCAGCTGCCATGGGAATTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  465  CAAGGCTGCCCAATACCAGGTCAACCAGGCTGCAGCTGCACAGGCTGCAGCCACCGCAGCTGCCATGGGAATTC  538

Query  815  CTCAAGCTGTACTTCCCCCATTACCAAAGAGGCCTGCTCTTGAAAAAACCAACGGTGCCACCGCAGTCTTTAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539  CTCAAGCTGTACTTCCCCCATTACCAAAGAGGCCTGCTCTTGAAAAAACCAACGGTGCCACCGCAGTCTTTAAC  612

Query  889  ACTGGTATTTTCCAATACCAACAGGCTCTAGCCAACATGCAGTTACAACAGCATACAGCATTTCTCCCACCAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  613  ACTGGTATTTTCCAATACCAACAGGCTCTAGCCAACATGCAGTTACAACAGCATACAGCATTTCTCCCACCA--  684

Query  963  CTCAATATTGTGCATGACACCCGCTACAAGTGTTGTTCCCATGGTGCACGGTGCTACGCCAGCCACTGTGTCCG  1036
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  685  ----------------------------------GTTCCCATGGTGCACGGTGCTACGCCAGCCACTGTGTCCG  724

Query 1037  CAGCAACAACATCTGCCACAAGTGTTCCCTTCGCTGCAACAGCCACAGCCAACCAGATACCCATAATATCTGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  CAGCAACAACATCTGCCACAAGTGTTCCCTTCGCTGCAACAGCCACAGCCAACCAGATACCCATAATATCTGCC  798

Query 1111  GAACATCTGACTAGCCACAAGTATGTTACCCAGATG  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  GAACATCTGACTAGCCACAAGTATGTTACCCAGATG  834