Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02088
• Subject: NM_004698.4
• Aligned Length: 2049
• Identities: 2049
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCACTGTCAAAGAGGGAGCTGGATGAGCTGAAACCATGGATAGAGAAGACAGTGAAGAGGGTCCTGGGTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCACTGTCAAAGAGGGAGCTGGATGAGCTGAAACCATGGATAGAGAAGACAGTGAAGAGGGTCCTGGGTTT  74

Query   75  CTCAGAGCCTACGGTGGTCACAGCAGCATTGAACTGTGTGGGGAAGGGCATGGACAAGAAGAAGGCAGCCGATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCAGAGCCTACGGTGGTCACAGCAGCATTGAACTGTGTGGGGAAGGGCATGGACAAGAAGAAGGCAGCCGATC  148

Query  149  ATCTGAAACCTTTTCTTGATGATTCTACTCTCCGATTTGTGGACAAACTGTTTGAGGCTGTGGAGGAAGGCCGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCTGAAACCTTTTCTTGATGATTCTACTCTCCGATTTGTGGACAAACTGTTTGAGGCTGTGGAGGAAGGCCGA  222

Query  223  AGCTCTAGGCATTCCAAGTCTAGCAGTGACAGGAGCAGAAAACGAGAGCTAAAGGAGGTGTTTGGTGATGACTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCTCTAGGCATTCCAAGTCTAGCAGTGACAGGAGCAGAAAACGAGAGCTAAAGGAGGTGTTTGGTGATGACTC  296

Query  297  TGAGATCTCTAAAGAATCATCAGGAGTAAAGAAGCGACGAATACCCCGTTTTGAGGAGGTGGAAGAAGAGCCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGATCTCTAAAGAATCATCAGGAGTAAAGAAGCGACGAATACCCCGTTTTGAGGAGGTGGAAGAAGAGCCAG  370

Query  371  AGGTGATCCCTGGGCCTCCATCAGAGAGCCCTGGCATGCTGACTAAGCTCCAGATCAAACAGATGATGGAGGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGTGATCCCTGGGCCTCCATCAGAGAGCCCTGGCATGCTGACTAAGCTCCAGATCAAACAGATGATGGAGGCA  444

Query  445  GCAACACGACAAATCGAGGAGAGGAAAAAACAGCTGAGCTTCATTAGCCCCCCTACACCTCAGCCAAAGACTCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAACACGACAAATCGAGGAGAGGAAAAAACAGCTGAGCTTCATTAGCCCCCCTACACCTCAGCCAAAGACTCC  518

Query  519  TTCTTCCTCCCAACCAGAACGACTTCCTATTGGCAACACTATTCAGCCCTCCCAGGCTGCCACTTTCATGAATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCTTCCTCCCAACCAGAACGACTTCCTATTGGCAACACTATTCAGCCCTCCCAGGCTGCCACTTTCATGAATG  592

Query  593  ATGCCATTGAGAAGGCAAGGAAAGCAGCTGAACTGCAAGCTCGAATCCAAGCCCAGCTGGCACTGAAGCCAGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCCATTGAGAAGGCAAGGAAAGCAGCTGAACTGCAAGCTCGAATCCAAGCCCAGCTGGCACTGAAGCCAGGA  666

Query  667  CTCATCGGCAATGCCAACATGGTGGGCCTGGCTAATCTCCATGCCATGGGCATTGCTCCCCCGAAGGTGGAGTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCATCGGCAATGCCAACATGGTGGGCCTGGCTAATCTCCATGCCATGGGCATTGCTCCCCCGAAGGTGGAGTT  740

Query  741  AAAAGACCAAACGAAACCTACACCACTGATCCTGGATGAGCAAGGGCGCACTGTAGATGCAACAGGCAAGGAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAAGACCAAACGAAACCTACACCACTGATCCTGGATGAGCAAGGGCGCACTGTAGATGCAACAGGCAAGGAGA  814

Query  815  TTGAGCTGACACACCGCATGCCTACTCTGAAAGCCAATATTCGTGCTGTGAAGAGGGAACAATTCAAGCAACAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGAGCTGACACACCGCATGCCTACTCTGAAAGCCAATATTCGTGCTGTGAAGAGGGAACAATTCAAGCAACAA  888

Query  889  CTAAAGGAAAAGCCATCAGAAGACATGGAATCCAATACCTTTTTTGACCCCCGAGTCTCCATTGCCCCTTCCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTAAAGGAAAAGCCATCAGAAGACATGGAATCCAATACCTTTTTTGACCCCCGAGTCTCCATTGCCCCTTCCCA  962

Query  963  GCGCCAGAGACGCACTTTTAAATTCCATGACAAGGGCAAATTTGAGAAGATTGCTCAGCGATTACGGACAAAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGCCAGAGACGCACTTTTAAATTCCATGACAAGGGCAAATTTGAGAAGATTGCTCAGCGATTACGGACAAAGG  1036

Query 1037  CTCAACTGGAGAAGCTACAGGCAGAGATTTCACAAGCAGCTCGAAAAACAGGCATCCATACTTCGACTAGGCTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCAACTGGAGAAGCTACAGGCAGAGATTTCACAAGCAGCTCGAAAAACAGGCATCCATACTTCGACTAGGCTT  1110

Query 1111  GCCCTCATTGCTCCTAAGAAGGAGCTAAAGGAAGGAGATATTCCTGAAATTGAGTGGTGGGACTCTTACATAAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCCTCATTGCTCCTAAGAAGGAGCTAAAGGAAGGAGATATTCCTGAAATTGAGTGGTGGGACTCTTACATAAT  1184

Query 1185  CCCCAATGGCTTTGATCTTACAGAGGAAAATCCCAAGAGAGAAGATTATTTTGGAATCACAAATCTTGTTGAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCCAATGGCTTTGATCTTACAGAGGAAAATCCCAAGAGAGAAGATTATTTTGGAATCACAAATCTTGTTGAAC  1258

Query 1259  ATCCAGCCCAGCTCAATCCTCCAGTTGACAATGACACACCAGTTACTCTGGGAGTATATCTTACCAAGAAGGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCCAGCCCAGCTCAATCCTCCAGTTGACAATGACACACCAGTTACTCTGGGAGTATATCTTACCAAGAAGGAA  1332

Query 1333  CAGAAAAAACTTCGGAGACAAACAAGGAGGGAAGCACAGAAGGAACTACAAGAAAAAGTCAGGCTGGGCCTGAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGAAAAAACTTCGGAGACAAACAAGGAGGGAAGCACAGAAGGAACTACAAGAAAAAGTCAGGCTGGGCCTGAT  1406

Query 1407  GCCTCCTCCAGAACCCAAAGTGAGAATTTCTAATTTGATGCGAGTATTAGGAACAGAAGCTGTTCAAGACCCCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCTCCTCCAGAACCCAAAGTGAGAATTTCTAATTTGATGCGAGTATTAGGAACAGAAGCTGTTCAAGACCCCA  1480

Query 1481  CGAAGGTAGAAGCCCACGTCAGAGCTCAGATGGCAAAAAGACAGAAAGCGCATGAAGAGGCCAACGCTGCCCGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGAAGGTAGAAGCCCACGTCAGAGCTCAGATGGCAAAAAGACAGAAAGCGCATGAAGAGGCCAACGCTGCCCGA  1554

Query 1555  AAACTCACAGCAGAACAGAGAAAGGTCAAGAAAATTAAAAAGCTTAAAGAAGACATTTCACAGGGGGTACACAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAACTCACAGCAGAACAGAGAAAGGTCAAGAAAATTAAAAAGCTTAAAGAAGACATTTCACAGGGGGTACACAT  1628

Query 1629  ATCTGTATATAGAGTTCGAAATTTGAGCAACCCAGCCAAGAAGTTCAAGATTGAAGCCAATGCTGGGCAACTGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATCTGTATATAGAGTTCGAAATTTGAGCAACCCAGCCAAGAAGTTCAAGATTGAAGCCAATGCTGGGCAACTGT  1702

Query 1703  ACCTGACAGGGGTGGTGGTACTGCACAAGGATGTCAACGTGGTAGTAGTGGAAGGGGGCCCCAAGGCCCAGAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCTGACAGGGGTGGTGGTACTGCACAAGGATGTCAACGTGGTAGTAGTGGAAGGGGGCCCCAAGGCCCAGAAG  1776

Query 1777  AAATTTAAGCGTCTTATGCTGCATCGGATAAAGTGGGATGAACAGACATCTAACACAAAGGGAGATGATGATGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAATTTAAGCGTCTTATGCTGCATCGGATAAAGTGGGATGAACAGACATCTAACACAAAGGGAGATGATGATGA  1850

Query 1851  GGAGTCTGATGAGGAAGCTGTGAAGAAAACCAACAAATGTGTACTAGTCTGGGAGGGTACAGCCAAAGACCGGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGAGTCTGATGAGGAAGCTGTGAAGAAAACCAACAAATGTGTACTAGTCTGGGAGGGTACAGCCAAAGACCGGA  1924

Query 1925  GCTTTGGAGAGATGAAGTTTAAACAGTGTCCTACAGAGAACATGGCTCGTGAGCATTTCAAAAAGCATGGGGCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCTTTGGAGAGATGAAGTTTAAACAGTGTCCTACAGAGAACATGGCTCGTGAGCATTTCAAAAAGCATGGGGCT  1998

Query 1999  GAACACTACTGGGACCTTGCGCTGAGTGAATCTGTGTTAGAGTCCACTGAT  2049
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAACACTACTGGGACCTTGCGCTGAGTGAATCTGTGTTAGAGTCCACTGAT  2049