Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02208
• Subject: NM_001371244.1
• Aligned Length: 1938
• Identities: 1935
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGAGGCCCCGGAAAGCCTTCCTGCTCCTGCTGCTCTTGGGGCTGGTGCAGCTGCTGGCCGTGGCGGGTGCCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGCCCCGGAAAGCCTTCCTGCTCCTGCTGCTCTTGGGGCTGGTGCAGCTGCTGGCCGTGGCGGGTGCCGA  74

Query   75  GGGCCCGGACGAGGATTCTTCTAACAGAGAAAATGCCATTGAGGATGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGATGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCCCGGACGAGGATTCTTCTAACAGAGAAAATGCCATTGAGGATGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGATGATG  148

Query  149  ATGAGGAAGAAGACGACTTGGAAGTTAAGGAAGAAAATGGAGTCTTGGTCCTAAATGATGCAAACTTTGATAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAGGAAGAAGACGACTTGGAAGTTAAGGAAGAAAATGGAGTCTTGGTCCTAAATGATGCAAACTTTGATAAT  222

Query  223  TTTGTGGCTGACAAAGACACAGTGCTGCTGGAGTTTTATGCTCCATGGTGTGGACATTGCAAGCAGTTTGCTCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGTGGCTGACAAAGACACAGTGCTGCTGGAGTTTTATGCTCCATGGTGTGGACATTGCAAGCAGTTTGCTCC  296

Query  297  GGAATATGAAAAAATTGCCAACATATTAAAGGATAAAGATCCTCCCATTCCTGTTGCCAAGATCGATGCAACCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAATATGAAAAAATTGCCAACATATTAAAGGATAAAGATCCTCCCATTCCTGTTGCCAAGATCGATGCAACCT  370

Query  371  CAGCGTCTGTGCTGGCCAGCAGGTTTGATGTGAGTGGCTACCCCACCATCAAGATCCTTAAGAAGGGGCAGGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGCGTCTGTGCTGGCCAGCAGGTTTGATGTGAGTGGCTACCCCACCATCAAGATCCTTAAGAAGGGGCAGGCT  444

Query  445  GTAGACTACGAGGGCTCCAGAACCCAGGAAGAAATTGTTGCCAAGGTCAGAGAAGTCTCCCAGCCCGACTGGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTAGACTACGAGGGCTCCAGAACCCAGGAAGAAATTGTTGCCAAGGTCAGAGAAGTCTCCCAGCCCGACTGGAC  518

Query  519  GCCTCCACCAGAAGTCACGCTTGTGTTGACCAAAGAGAACTTTGATGAAGTTGTGAATGATGCAGATATCATTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCTCCACCAGAAGTCACGCTTGTGTTGACCAAAGAGAACTTTGATGAAGTTGTGAATGATGCAGATATCATTC  592

Query  593  TGGTGGAGTTTTATGCCCCATGGTGTGGACACTGCAAGAAACTTGCCCCCGAGTATGAGAAGGCCGCCAAGGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGTGGAGTTTTATGCCCCATGGTGTGGACACTGCAAGAAACTTGCCCCCGAGTATGAGAAGGCCGCCAAGGAG  666

Query  667  CTCAGCAAGCGTTCTCCTCCAATTCCCCTGGCAAAGGTCGACGCCACCGCAGAAACAGACCTGGCCAAGAGGTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCAGCAAGCGTTCTCCTCCAATTCCCCTGGCAAAGGTCGACGCCACCGCAGAAACAGACCTGGCCAAGAGGTT  740

Query  741  TGATGTCTCTGGCTATCCCACCCTGAAAATTTTCCGCAAAGGAAGGCCTTATGACTACAACGGCCCACGAGAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATGTCTCTGGCTATCCCACCCTGAAAATTTTCCGCAAAGGAAGGCCTTATGACTACAACGGCCCACGAGAAA  814

Query  815  AATATGGAATCGTTGATTACATGATCGAGCAGTCCGGGCCTCCCTCCAAGGAGATTCTGACCCTGAAGCAGGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AATATGGAATCGTTGATTACATGATCGAGCAGTCCGGGCCTCCCTCCAAGGAGATTCTGACCCTGAAGCAGGTC  888

Query  889  CAGGAGTTCCTGAAGGATGGAGACGATGTCATCATCATCGGGGTCTTTAAGGGGGAGAGTGACCCAGCCTACCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGGAGTTCCTGAAGGATGGAGACGATGTCATCATCATCGGGGTCTTTAAGGGGGAGAGTGACCCAGCCTACCA  962

Query  963  GCAATACCAGGATGCCGCTAACAACCTGAGAGAAGATTACAAATTTCACCACACTTTCAGCACAGAAATAGCAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAATACCAGGATGCCGCTAACAACCTGAGAGAAGATTACAAATTTCACCACACTTTCAGCACAGAAATAGCAA  1036

Query 1037  AGTTCTTGAAAGTCTCCCAGGGGCAGTTGGTTGTAATGCAGCCTGAGAAATTCCAGTCCAAGTATGAGCCCCGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTTCTTGAAAGTCTCCCAGGGGCAGTTGGTTGTAATGCAGCCTGAGAAATTCCAGTCCAAGTATGAGCCCCGG  1110

Query 1111  AGCCACATGATGGACGTC---CAGGGCTCCACCCAGGACTCGGCCATCAAGGACTTCGTGCTGAAGTACGCCCT  1181
            ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCCACATGATGGACGTCCAGCAGGGCTCCACCCAGGACTCGGCCATCAAGGACTTCGTGCTGAAGTACGCCCT  1184

Query 1182  GCCCCTGGTTGGCCACCGCAAGGTGTCAAACGATGCTAAGCGCTACACCAGGCGCCCCCTGGTGGTCGTCTACT  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCCCTGGTTGGCCACCGCAAGGTGTCAAACGATGCTAAGCGCTACACCAGGCGCCCCCTGGTGGTCGTCTACT  1258

Query 1256  ACAGTGTGGACTTCAGCTTTGATTACAGAGCTGCAACTCAGTTTTGGCGGAGCAAAGTCCTAGAGGTGGCCAAG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACAGTGTGGACTTCAGCTTTGATTACAGAGCTGCAACTCAGTTTTGGCGGAGCAAAGTCCTAGAGGTGGCCAAG  1332

Query 1330  GACTTCCCTGAGTACACCTTTGCCATTGCGGACGAAGAGGACTATGCTGGGGAGGTGAAGGACCTGGGGCTCAG  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACTTCCCTGAGTACACCTTTGCCATTGCGGACGAAGAGGACTATGCTGGGGAGGTGAAGGACCTGGGGCTCAG  1406

Query 1404  CGAGAGTGGGGAGGATGTCAATGCCGCCATCCTGGACGAGAGTGGGAAGAAGTTCGCCATGGAGCCAGAGGAGT  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGAGAGTGGGGAGGATGTCAATGCCGCCATCCTGGACGAGAGTGGGAAGAAGTTCGCCATGGAGCCAGAGGAGT  1480

Query 1478  TTGACTCTGACACCCTCCGCGAGTTTGTCACTGCTTTCAAAAAAGGAAAACTGAAGCCAGTCATCAAATCCCAG  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTGACTCTGACACCCTCCGCGAGTTTGTCACTGCTTTCAAAAAAGGAAAACTGAAGCCAGTCATCAAATCCCAG  1554

Query 1552  CCAGTGCCCAAGAACAACAAGGGACCCGTCAAGGTCGTGGTGGGAAAGACCTTTGACTCCATTGTGATGGACCC  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCAGTGCCCAAGAACAACAAGGGACCCGTCAAGGTCGTGGTGGGAAAGACCTTTGACTCCATTGTGATGGACCC  1628

Query 1626  CAAGAAGGACGTCCTCATCGAGTTCTACGCGCCATGGTGCGGGCACTGCAAGCAGCTAGAGCCCGTGTACAACA  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAAGAAGGACGTCCTCATCGAGTTCTACGCGCCATGGTGCGGGCACTGCAAGCAGCTAGAGCCCGTGTACAACA  1702

Query 1700  GCCTGGCCAAGAAGTACAAGGGCCAAAAGGGCCTGGTCATCGCCAAGATGGACGCCACTGCCAACGACGTCCCC  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCCTGGCCAAGAAGTACAAGGGCCAAAAGGGCCTGGTCATCGCCAAGATGGACGCCACTGCCAACGACGTCCCC  1776

Query 1774  AGCGACCGCTATAAGGTGGAGGGCTTCCCCACCATCTACTTCGCCCCCAGTGGGGACAAAAAGAACCCAGTTAA  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGCGACCGCTATAAGGTGGAGGGCTTCCCCACCATCTACTTCGCCCCCAGTGGGGACAAAAAGAACCCAGTTAA  1850

Query 1848  ATTTGAGGGTGGAGACAGAGATCTGGAGCATTTGAGCAAGTTTATAGAAGAACATGCCACAAAACTGAGCAGGA  1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATTTGAGGGTGGAGACAGAGATCTGGAGCATTTGAGCAAGTTTATAGAAGAACATGCCACAAAACTGAGCAGGA  1924

Query 1922  CCAAGGAAGAGCTT  1935
            ||||||||||||||
Sbjct 1925  CCAAGGAAGAGCTT  1938