Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02208
• Subject: XM_006505450.3
• Aligned Length: 1938
• Identities: 1213
• Gaps: 549

Alignment

Query    1  ATGAGGCCCCGGAAAGCCTTCCTGCTCCTGCTGCTCTTGGGGCTGGTGCAGCTGCTGGCCGTGGCGGGTGCCGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGGCCCGGACGAGGATTCTTCTAACAGAGAAAATGCCATTGAGGATGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGATGATG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAGGAAGAAGACGACTTGGAAGTTAAGGAAGAAAATGGAGTCTTGGTCCTAAATGATGCAAACTTTGATAAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTTGTGGCTGACAAAGACACAGTGCTGCTGGAGTTTTATGCTCCATGGTGTGGACATTGCAAGCAGTTTGCTCC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGAATATGAAAAAATTGCCAACATATTAAAGGATAAAGATCCTCCCATTCCTGTTGCCAAGATCGATGCAACCT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CAGCGTCTGTGCTGGCCAGCAGGTTTGATGTGAGTGGCTACCCCACCATCAAGATCCTTAAGAAGGGGCAGGCT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GTAGACTACGAGGGCTCCAGAACCCAGGAAGAAATTGTTGCCAAGGTCAGAGAAGTCTCCCAGCCCGACTGGAC  518
                                              .|||| ||||   ||....|||.|.||.|      ||| .
Sbjct    1  ----------------------------------ATGTT-CCAA---CAATTTAGTGTGCCTG------TGG-G  29

Query  519  GCCTCCACCAGAAGTCACGCTTG---TGTTGACCAAAGAGAACTTTGATGAAGTTGTGAATGATGCAGATATCA  589
            ||||         ||    ||||   |..|.|||.|.||||                               ||
Sbjct   30  GCCT---------GT----CTTGTCATTCTCACCTAGGAGA-------------------------------CA  59

Query  590  TTCTGGTGGAGTTTTATGCCCCATGGTGTGGACACTGCAAGAAACTTGCCCCCGAGTATGAGAAGGCCGCCAAG  663
            |||    ..||.||         |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct   60  TTC----CAAGATT---------TGGTGTGGACACTGCAAGAAACTTGCCCCTGAGTATGAGAAAGCTGCCAAG  120

Query  664  GAGCTCAGCAAGCGTTCTCCTCCAATTCCCCTGGCAAAGGTCGACGCCACCGCAGAAACAGACCTGGCCAAGAG  737
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||.||||||||||.|.|.|||||||||||.|||||
Sbjct  121  GAGCTCAGCAAGCGCTCTCCCCCAATTCCCTTAGCCAAAGTGGACGCCACCGAACAGACAGACCTGGCTAAGAG  194

Query  738  GTTTGATGTCTCTGGCTATCCCACCCTGAAAATTTTCCGCAAAGGAAGGCCTTATGACTACAACGGCCCACGAG  811
            ||||||||||||||||||.||.||..|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct  195  GTTTGATGTCTCTGGCTACCCGACTTTGAAAATTTTCCGCAAAGGAAGGCCTTTTGACTACAATGGCCCACGAG  268

Query  812  AAAAATATGGAATCGTTGATTACATGATCGAGCAGTCCGGGCCTCCCTCCAAGGAGATTCTGACCCTGAAGCAG  885
            |.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  269  AGAAATATGGGATTGTTGACTACATGATTGAGCAGTCTGGGCCTCCCTCAAAGGAGATCCTGACCCTGAAGCAG  342

Query  886  GTCCAGGAGTTCCTGAAGGATGGAGACGATGTCATCATCATCGGGGTCTTTAAGGGGGAGAGTGACCCAGCCTA  959
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||.|||.|||||.||||.||..|||||||.|||||
Sbjct  343  GTCCAGGAGTTCCTGAAGGATGGAGATGATGTGGTCATCATTGGGCTCTTTCAGGGAGATGGTGACCCGGCCTA  416

Query  960  CCAGCAATACCAGGATGCCGCTAACAACCTGAGAGAAGATTACAAATTTCACCACACTTTCAGCACAGAAATAG  1033
            |..|||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  417  CTTGCAGTATCAGGATGCTGCTAACAACCTGAGAGAAGATTACAAGTTTCACCACACTTTCAGCCCTGAAATAG  490

Query 1034  CAAAGTTCTTGAAAGTCTCCCAGGGGCAGTTGGTTGTAATGCAGCCTGAGAAATTCCAGTCCAAGTATGAGCCC  1107
            |.||||||.||||||||||||.||||.|||||||..|.|..||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  491  CCAAGTTCCTGAAAGTCTCCCTGGGGAAGTTGGTGCTGACACACCCTGAGAAGTTCCAGTCCAAGTATGAGCCC  564

Query 1108  CGGAGCCACATGATGGACGTCCAGGGCTCCACCCAGGACTCGGCCATCAAGGACTTCGTGCTGAAGTACGCCCT  1181
            .||..||||.|||||||.||.||||||||.||..|.|..||.|||||.|||||||..||..||||..|.|||.|
Sbjct  565  AGGTTCCACGTGATGGATGTTCAGGGCTCTACAGAAGCATCAGCCATTAAGGACTATGTAGTGAAACATGCCTT  638

Query 1182  GCCCCTGGTTGGCCACCGCAAGGTGTCAAACGATGCTAAGCGCTACACCAGGCGCCCCCTGGTGGTCGTCTACT  1255
            |||||||||.|||||.||.|||...||.||.|||||||||||.||||.||..||||||||||||||.||.||||
Sbjct  639  GCCCCTGGTGGGCCATCGTAAGACTTCTAATGATGCTAAGCGGTACAGCAAACGCCCCCTGGTGGTTGTATACT  712

Query 1256  ACAGTGTGGACTTCAGCTTTGATTACAGAGCTGCAACTCAGTTTTGGCGGAGCAAAGTCCTAGAGGTGGCCAAG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  ACAGTGTGGACTTCAGCTTTGATTACAGAGCTGCTACTCAGTTTTGGCGTAACAAAGTCCTAGAGGTGGCCAAG  786

Query 1330  GACTTCCCTGAGTACACCTTTGCCATTGCGGACGAAGAGGACTATGCTGGGGAGGTGAAGGACCTGGGGCTCAG  1403
            ||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||...||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  GACTTCCCTGAGTATACCTTCGCCATTGCTGACGAGGAAGACTATGCCACGGAGGTGAAGGACCTGGGGCTCAG  860

Query 1404  CGAGAGTGGGGAGGATGTCAATGCCGCCATCCTGGACGAGAGTGGGAAGAAGTTCGCCATGGAGCCAGAGGAGT  1477
            .||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  861  TGAGAGTGGAGAGGATGTCAATGCAGCCATCCTAGACGAGAGCGGGAAGAAGTTTGCCATGGAGCCAGAGGAGT  934

Query 1478  TTGACTCTGACACCCTCCGCGAGTTTGTCACTGCTTTCAAAAAAGGAAAACTGAAGCCAGTCATCAAATCCCAG  1551
            ||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  935  TTGATTCAGACACTCTCCGGGAATTTGTCACAGCTTTTAAAAAAGGAAAACTAAAGCCAGTCATCAAATCACAG  1008

Query 1552  CCAGTGCCCAAGAACAACAAGGGACCCGTCAAGGTCGTGGTGGGAAAGACCTTTGACTCCATTGTGATGGACCC  1625
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 1009  CCAGTACCCAAGAACAACAAGGGACCAGTCAAGGTGGTGGTGGGAAAGACCTTTGATGCCATTGTGATGGACCC  1082

Query 1626  CAAGAAGGACGTCCTCATCGAGTTCTACGCGCCATGGTGCGGGCACTGCAAGCAGCTAGAGCCCGTGTACAACA  1699
            |||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||..|.||.|.||
Sbjct 1083  CAAAAAGGACGTCCTCATTGAATTCTATGCACCCTGGTGTGGGCACTGCAAGCAGCTAGAGCCTATCTATACCA  1156

Query 1700  GCCTGGCCAAGAAGTACAAGGGCCAAAAGGGCCTGGTCATCGCCAAGATGGACGCCACTGCCAACGACGTCCCC  1773
            ||||.|.||||||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.||.||
Sbjct 1157  GCCTAGGCAAGAAATACAAGGGCCAGAAGGACCTGGTCATCGCCAAGATGGATGCTACTGCCAACGACATCACC  1230

Query 1774  AGCGACCGCTATAAGGTGGAGGGCTTCCCCACCATCTACTTCGCCCCCAGTGGGGACAAAAAGAACCCAGTTAA  1847
            |.|||||..||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1231  AACGACCAATATAAGGTGGAGGGCTTCCCTACCATCTATTTTGCTCCCAGTGGGGACAAAAAGAACCCAATTAA  1304

Query 1848  ATTTGAGGGTGGAGACAGAGATCTGGAGCATTTGAGCAAGTTTATAGAAGAACATGCCACAAAACTGAGCAGGA  1921
            ||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||...||||||||
Sbjct 1305  ATTTGAGGGTGGCAACAGAGATCTGGAGCATTTGAGCAAGTTTATAGATGAACATGCCACAAAGAGGAGCAGGA  1378

Query 1922  CCAAGGAAGAGCTT  1935
            ||||||||||||||
Sbjct 1379  CCAAGGAAGAGCTT  1392