Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02510
• Subject: NM_001318842.1
• Aligned Length: 933
• Identities: 834
• Gaps: 99

Alignment

Query   1  ATGGATTCAATGCCTGAGCCCGCGTCCCGCTGTCTTCTGCTTCTTCCCTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGATTCAATGCCTGAGCCCGCGTCCCGCTGTCTTCTGCTTCTTCCCTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT  74

Query  75  GCCGGCCCCGGAGCTGGGCCCGAGCCAGGCCGGAGCTGAGGAGAACGACTGGGTTCGCCTGCCCAGCAAATGCG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GCCGGCCCCGGAGCTGGGCCCGAGCCAGGCCGGAGCTGAGGAGAACGACTGGGTTCGCCTGCCCAGCAAATGCG  148

Query 149  AAGTGTGTAAATATGTTGCTGTGGAGCTGAAGTCAGCCTTTGAGGAAACCGGCAAGACCAAGGAGGTGATTGGC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AAGTGTGTAAATATGTTGCTGTGGAGCTGAAGTCAGCCTTTGAGGAAACCGGCAAGACCAAGGAGGTGATTGGC  222

Query 223  ACGGGCTATGGCATCCTGGACCAGAAGGCCTCTGGAGTCAAATACACCAAGTC---------------------  275
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct 223  ACGGGCTATGGCATCCTGGACCAGAAGGCCTCTGGAGTCAAATACACCAAGTCCATTTCAGATCCCCCAGACCA  296

Query 276  --------------------------------------------------------------------------  275
                                                                                     
Sbjct 297  GATGACCTATCTTCCTTCCAGCTCTGAGTCACTTCCCATTGGAGGGGAACTCAGTTCCTCATCCTCCTGTCTTG  370

Query 276  ----GGACTTGCGGTTAATCGAAGTCACTGAGACCATTTGCAAGAGGCTCCTGGATTATAGCCTGCACAAGGAG  345
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GCAGGGACTTGCGGTTAATCGAAGTCACTGAGACCATTTGCAAGAGGCTCCTGGATTATAGCCTGCACAAGGAG  444

Query 346  AGGACCGGCAGCAATCGATTTGCCAAGGGCATGTCAGAGACCTTTGAGACATTACACAACCTGGTACACAAAGG  419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  AGGACCGGCAGCAATCGATTTGCCAAGGGCATGTCAGAGACCTTTGAGACATTACACAACCTGGTACACAAAGG  518

Query 420  GGTCAAGGTGGTGATGGACATCCCCTATGAGCTGTGGAACGAGACTTCTGCAGAGGTGGCTGACCTCAAGAAGC  493
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GGTCAAGGTGGTGATGGACATCCCCTATGAGCTGTGGAACGAGACTTCTGCAGAGGTGGCTGACCTCAAGAAGC  592

Query 494  AGTGTGATGTGCTGGTGGAAGAGTTTGAGGAGGTGATCGAGGACTGGTACAGGAACCACCAGGAGGAAGACCTG  567
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AGTGTGATGTGCTGGTGGAAGAGTTTGAGGAGGTGATCGAGGACTGGTACAGGAACCACCAGGAGGAAGACCTG  666

Query 568  ACTGAATTCCTCTGCGCCAACCACGTGCTGAAGGGAAAAGACACCAGTTGCCTGGCAGAGCAGTGGTCCGGCAA  641
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  ACTGAATTCCTCTGCGCCAACCACGTGCTGAAGGGAAAAGACACCAGTTGCCTGGCAGAGCAGTGGTCCGGCAA  740

Query 642  GAAGGGAGACACAGCTGCCCTGGGAGGGAAGAAGTCCAAGAAGAAGAGCAGCAGGGCCAAGGCAGCAGGCGGCA  715
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  GAAGGGAGACACAGCTGCCCTGGGAGGGAAGAAGTCCAAGAAGAAGAGCAGCAGGGCCAAGGCAGCAGGCGGCA  814

Query 716  GGAGTAGCAGCAGCAAACAAAGGAAGGAGCTGGGTGGCCTTGAGGGAGACCCCAGCCCCGAGGAGGATGAGGGC  789
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  GGAGTAGCAGCAGCAAACAAAGGAAGGAGCTGGGTGGCCTTGAGGGAGACCCCAGCCCCGAGGAGGATGAGGGC  888

Query 790  ATCCAGAAGGCATCCCCTCTCACACACAGCCCCCCTGATGAGCTC  834
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  ATCCAGAAGGCATCCCCTCTCACACACAGCCCCCCTGATGAGCTC  933