Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02510
Subject:
NM_001318845.1
Aligned Length:
834
Identities:
564
Gaps:
267

Alignment

Query   1  ATGGATTCAATGCCTGAGCCCGCGTCCCGCTGTCTTCTGCTTCTTCCCTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GCCGGCCCCGGAGCTGGGCCCGAGCCAGGCCGGAGCTGAGGAGAACGACTGGGTTCGCCTGCCCAGCAAATGCG  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  AAGTGTGTAAATATGTTGCTGTGGAGCTGAAGTCAGCCTTTGAGGAAACCGGCAAGACCAAGGAGGTGATTGGC  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  ACGGGCTATGGCATCCTGGACCAGAAGGCCTCTGGAGTCAAATACACCAAGTCGGACTTGCGGTTAATCGAAGT  296
                                                      |..|.|||  |||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -------------------------------------------ATGCGAAG--GGACTTGCGGTTAATCGAAGT  29

Query 297  CACTGAGACCATTTGCAAGAGGCTCCTGGATTATAGCCTGCACAAGGAGAGGACCGGCAGCAATCGATTTGCCA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  30  CACTGAGACCATTTGCAAGAGGCTCCTGGATTATAGCCTGCACAAGGAGAGGACCGGCAGCAATCGATTTGCCA  103

Query 371  AGGGCATGTCAGAGACCTTTGAGACATTACACAACCTGGTACACAAAGGGGTCAAGGTGGTGATGGACATCCCC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104  AGGGCATGTCAGAGACCTTTGAGACATTACACAACCTGGTACACAAAGGGGTCAAGGTGGTGATGGACATCCCC  177

Query 445  TATGAGCTGTGGAACGAGACTTCTGCAGAGGTGGCTGACCTCAAGAAGCAGTGTGATGTGCTGGTGGAAGAGTT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178  TATGAGCTGTGGAACGAGACTTCTGCAGAGGTGGCTGACCTCAAGAAGCAGTGTGATGTGCTGGTGGAAGAGTT  251

Query 519  TGAGGAGGTGATCGAGGACTGGTACAGGAACCACCAGGAGGAAGACCTGACTGAATTCCTCTGCGCCAACCACG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252  TGAGGAGGTGATCGAGGACTGGTACAGGAACCACCAGGAGGAAGACCTGACTGAATTCCTCTGCGCCAACCACG  325

Query 593  TGCTGAAGGGAAAAGACACCAGTTGCCTGGCAGAGCAGTGGTCCGGCAAGAAGGGAGACACAGCTGCCCTGGGA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326  TGCTGAAGGGAAAAGACACCAGTTGCCTGGCAGAGCAGTGGTCCGGCAAGAAGGGAGACACAGCTGCCCTGGGA  399

Query 667  GGGAAGAAGTCCAAGAAGAAGAGCAGCAGGGCCAAGGCAGCAGGCGGCAGGAGTAGCAGCAGCAAACAAAGGAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400  GGGAAGAAGTCCAAGAAGAAGAGCAGCAGGGCCAAGGCAGCAGGCGGCAGGAGTAGCAGCAGCAAACAAAGGAA  473

Query 741  GGAGCTGGGTGGCCTTGAGGGAGACCCCAGCCCCGAGGAGGATGAGGGCATCCAGAAGGCATCCCCTCTCACAC  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474  GGAGCTGGGTGGCCTTGAGGGAGACCCCAGCCCCGAGGAGGATGAGGGCATCCAGAAGGCATCCCCTCTCACAC  547

Query 815  ACAGCCCCCCTGATGAGCTC  834
           ||||||||||||||||||||
Sbjct 548  ACAGCCCCCCTGATGAGCTC  567