Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03473
• Subject: XM_017001534.1
• Aligned Length: 1728
• Identities: 1559
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGGCGGACCGTGGCGGCGTGGGTGAAGCCGCAGCTGTTGGAGCGTCTCCTGCATCTGTCCCTGGCCTAAACCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGACCGTGGCGGCGTGGGTGAAGCCGCAGCTGTTGGAGCGTCTCCTGCATCTGTCCCTGGCCTAAACCC  74

Query   75  GACGCTAGGCTGGAGGGAGCGACTGCGGGCCGGGCTGGCGGGGACTGGGGCCTCGTTGTGGTTCGTGGCGGGGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACGCTAGGCTGGAGGGAGCGACTGCGGGCCGGGCTGGCGGGGACTGGGGCCTCGTTGTGGTTCGTGGCGGGGC  148

Query  149  TGGGGCTGCTTTACGCCCTGAGGATCCCTTTGAGGCTGTGTGAGAATTTGGCAGCGGTGACTGTATTTTTAAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGGGCTGCTTTACGCCCTGAGGATCCCTTTGAGGCTGTGTGAGAATTTGGCAGCGGTGACTGTATTTTTAAAT  222

Query  223  TCATTGACACCCAAATTCTATGTGGCACTTACAGGGACCTCTTCATTGATATCAGGACTAATATTTATATTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCATTGACACCCAAATTCTATGTGGCACTTACAGGGACCTCTTCATTGATATCAGGACTAATATTTATATTTGA  296

Query  297  ATGGTGGTACTTCCATAAGCATGGCACATCTTTTATTGAGCAAGTATCTGTAAGCCATTTGCAACCACTGATGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATGGTGGTACTTCCATAAGCATGGCACATCTTTTATTGAGCAAGTATCTGTAAGCCATTTGCAACCACTGATGG  370

Query  371  GAGGAACAGAGAGCAGCATTTCAGAACCAGGTTCTCCTTCGAGGAACAGAGAAAATGAAACCAGCAGACAGAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGGAACAGAGAGCAGCATTTCAGAACCAGGTTCTCCTTCGAGGAACAGAGAAAATGAAACCAGCAGACAGAAT  444

Query  445  TTGTCAGAATGTAAGGTATGGAGAAACCCTCTAAATCTTTTCAGAGGAGCAGAATATAGGAGATACACTTGGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGTCAGAATGTAAGGTATGGAGAAACCCTCTAAATCTTTTCAGAGGAGCAGAATATAGGAGATACACTTGGGT  518

Query  519  GACTGGTAAAGAGCCACTTACATACTATGACATGAACCTGTCAGCTCAGGACCATCAGACCTTTTTCACCTGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACTGGTAAAGAGCCACTTACATACTATGACATGAACCTGTCAGCTCAGGACCATCAGACCTTTTTCACCTGTG  592

Query  593  ACACAGATTTTTTACGTCCTTCAGACACAGTTATGCAGAAGGCTTGGAGGGAAAGAAATCCTCCAGCTCGAATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACACAGATTTTTTACGTCCTTCAGACACAGTTATGCAGAAGGCTTGGAGGGAAAGAAATCCTCCAGCTCGAATC  666

Query  667  AAAGCAGCCTATCAAGCTTTAGAATTAAACAATGACTGTGCCACTGCATATGTTCTACTGGCTGAGGAAGAAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGCAGCCTATCAAGCTTTAGAATTAAACAATGACTGTGCCACTGCATATGTTCTACTGGCTGAGGAAGAAGC  740

Query  741  AACAACTATTGTAGATGCTGAAAGGTTATTTAAACAGGCACTCAAGGCAGGAGAAACAATTTATAGGCAGTCAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AACAACTATTGTAGATGCTGAAAGGTTATTTAAACAGGCACTCAAGGCAGGAGAAACAATTTATAGGCAGTCAC  814

Query  815  AGCAGTGCCAGCACCAAAGTCCTCAGCATGAAGCTCAACTGAGGAGAGATACCAATGTACTGGTATATATTAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCAGTGCCAGCACCAAAGTCCTCAGCATGAAGCTCAACTGAGGAGAGATACCAATGTACTGGTATATATTAAA  888

Query  889  AGAAGATTGGCAATGTGTGCAAGAAAATTAGGAAGAATAAGAGAAGCAGTAAAAATAATGAGAGATTTGATGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGAAGATTGGCAATGTGTGCAAGAAAATTAGGAAGAATAAGAGAAGCAGTAAAAATAATGAGAGATTTGATGAA  962

Query  963  AGAATTTCCTCCTCTTACCATGTTGAACATCCATGAAAATCTCTTAGAATCACTTTTAGAATTACAGGCCTATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAATTTCCTCCTCTTACCATGTTGAACATCCATGAAAATCTCTTAGAATCACTTTTAGAATTACAGGCCTATC  1036

Query 1037  CAGATGTTCAGGCAGTCCTAGCAAAATATGATGATATAAGCCTTCCAAAGTCAGCAGCAATCTGTTACACAGCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGATGTTCAGGCAGTCCTAGCAAAATATGATGATATAAGCCTTCCAAAGTCAGCAGCAATCTGTTACACAGCA  1110

Query 1111  GCACTGTTGAAGACAAGGACTGTTTCAGAAAAATTCTCTCCAGAAACAGCCTCCAGAAGAGGATTAAGCACAGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCACTGTTGAAGACAAGGACTGTTTCAGAAAAATTCTCTCCAGAAACAGCCTCCAGAAGAGGATTAAGCACAGC  1184

Query 1185  AGAAATTAATGCCGTGGAAGCAATTCATAGAGCTGTGGAATTTAATCCTCATGTTCCAAAATATTTATTAGAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAAATTAATGCCGTGGAAGCAATTCATAGAGCTGTGGAATTTAATCCTCATGTTCCAAAATATTTATTAGAGA  1258

Query 1259  TGAAAAGTTTAATTTTACCTCCAGAACACATTCTGAAACGGGGTGATAGTGAAGCAATTGCCTATGCTTTCTTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGAAAAGTTTAATTTTACCTCCAGAACACATTCTGAAACGGGGTGATAGTGAAGCAATTGCCTATGCTTTCTTT  1332

Query 1333  CATCTTCAGCACTGGAAACGAATAGAAGGTGCTCTTAATCTGTTACAGTGTACATGGGAAGGCACTTTTAGAAT  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 1333  CATCTTCAGCACTGGAAACGAATAGAAGGTGCTCTTAATCTGTTACAGTGTACATGGGAAGGC-----------  1395

Query 1407  GATTCCATACCCGTTAGAGAAAGGACATCTATTTTACCCTTATCCCAGCTGCACAGAGACGGCTGATAGAGAGC  1480
                                                                                      
Sbjct 1396  --------------------------------------------------------------------------  1395

Query 1481  TATTACCTACCTTTCATCATGTTTCTGTTTACCCAAAAAAGGAGCTTCCTTTGTTCATCCATTTCACAGCAGGA  1554
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  --------ACCTTTCATCATGTTTCTGTTTACCCAAAAAAGGAGCTTCCTTTGTTCATCCATTTCACAGCAGGA  1461

Query 1555  TTTTGCTCTTCTACAGCAATGATAGCCATTCTCACTCACCAGTTTCCTGAAATCATGGGTATTTTTGCTAAAGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1462  TTTTGCTCTTCTACAGCAATGATAGCCATTCTCACTCACCAGTTTCCTGAAATCATGGGTATTTTTGCTAAAGC  1535

Query 1629  TGTGCTGGGACTCTGGT---GCCCCCAACCCTGGGCATCCTCAGGCTTTGAGGAGAATACACAGGATTTGAAGT  1699
            |||..|.|||     ||   ..|||.||                      |.||.|||.|   .|||       
Sbjct 1536  TGTAGTAGGA-----GTTAAAACCCAAA----------------------AAGAAAATGC---TGAT-------  1572

Query 1700  CAGAAGACCTAGGTTTGAGTTCTGGC  1725
                                      
Sbjct 1573  --------------------------  1572