Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03473
• Subject: XR_946675.2
• Aligned Length: 1766
• Identities: 1430
• Gaps: 318

Alignment

Query    1  --------------ATGGCGGACCGTGGCGGCGTGGGTGAAGCCGCAGCTGTTGGAGCGTCTCCTGCATCTGTC  60
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GCGATAGCGGCAAGATGGCGGACCGTGGCGGCGTGGGTGAAGCCGCAGCTGTTGGAGCGTCTCCTGCATCTGTC  74

Query   61  CCTGGCCTAAACCCGACGCTAGGCTGGAGGGAGCGACTGCGGGCCGGGCTGGCGGGGACTGGGGCCTCGTTGTG  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGCCTAAACCCGACGCTAGGCTGGAGGGAGCGACTGCGGGCCGGGCTGGCGGGGACTGGGGCCTCGTTGTG  148

Query  135  GTTCGTGGCGGGGCTGGGGCTGCTTTACGCCCTGAGGATCCCTTTGAGGCTGTGTGAGAATTTGGCAGCGGTGA  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTTCGTGGCGGGGCTGGGGCTGCTTTACGCCCTGAGGATCCCTTTGAGGCTGTGTGAGAATTTGGCAGCGGTGA  222

Query  209  CTGTATTTTTAAATTCATTGACACCCAAATTCTATGTGGCACTTACAGGGACCTCTTCATTGATATCAGGACTA  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGTATTTTTAAATTCATTGACACCCAAATTCTATGTGGCACTTACAGGGACCTCTTCATTGATATCAGGACTA  296

Query  283  ATATTTATATTTGAATGGTGGTACTTCCATAAGCATGGCACATCTTTTATTGAGCAAGTATCTGTAAGCCATTT  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATATTTATATTTGAATGGTGGTACTTCCATAAGCATGGCACATCTTTTATTGAGCAAGTATCTGTAAGCCATTT  370

Query  357  GCAACCACTGATGGGAGGAACAGAGAGCAGCATTTCAGAACCAGGTTCTCCTTCGAGGAACAGAGAAAATGAAA  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAACCACTGATGGGAGGAACAGAGAGCAGCATTTCAGAACCAGGTTCTCCTTCGAGGAACAGAGAAAATGAAA  444

Query  431  CCAGCAGACAGAATTTGTCAGAATGTAAGGTATGGAGAAACCCTCTAAATCTTTTCAGAGGAGCAGAATATAGG  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAGCAGACAGAATTTGTCAGAATGTAAGGTATGGAGAAACCCTCTAAATCTTTTCAGAGGAGCAGAATATAGG  518

Query  505  AGATACACTTGGGTGACTGGTAAAGAGCCACTTACATACTATGACATGAACCTGTCAGCTCAGGACCATCAGAC  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATACACTTGGGTGACTGGTAAAGAGCCACTTACATACTATGACATGAACCTGTCAGCTCAGGACCATCAGAC  592

Query  579  CTTTTTCACCTGTGACACAGATTTTTTACGTCCTTCAGACACAGTTATGCAGAAGGCTTGGAGGGAAAGAAATC  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTTTTCACCTGTGACACAGATTTTTTACGTCCTTCAGACACAGTTATGCAGAAGGCTTGGAGGGAAAGAAATC  666

Query  653  CTCCAGCTCGAATCAAAGCAGCCTATCAAGCTTTAGAATTAAACAATGACTGTGCCACTGCATATGTTCTACTG  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCCAGCTCGAATCAAAGCAGCCTATCAAGCTTTAGAATTAAACAATGACTGTGCCACTGCATATGTTCTACTG  740

Query  727  GCTGAGGAAGAAGCAACAACTATTGTAGATGCTGAAAGGTTATTTAAACAGGCACTCAAGGCAGGAGAAACAAT  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGAGGAAGAAGCAACAACTATTGTAGATGCTGAAAGGTTATTTAAACAGGCACTCAAGGCAGGAGAAACAAT  814

Query  801  TTATAGGCAGTCACAGCAGTGCCAGCACCAAAGTCCTCAGCATGAAGCTCAACTGAGGAGAGATACCAATGTAC  874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTATAGGCAGTCACAGCAGTGCCAGCACCAAAGTCCTCAGCATGAAGCTCAACTGAGGAGAGATACCAATGTAC  888

Query  875  TGGTATATATTAAAAGAAGATTGGCAATGTGTGCAAGAAAATTAGGAAGAATAAGAGAAGCAGTAAAAATAATG  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGTATATATTAAAAGAAGATTGGCAATGTGTGCAAGAAAATTAGGAAGAATAAGAGAAGCAGTAAAAATAATG  962

Query  949  AGAGATTTGATGAAAGAATTTCCTCCTCTTACCATGTTGAACATCCATGAAAATCTCTTAGAATCACTTTTAGA  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAGATTTGATGAAAGAATTTCCTCCTCTTACCATGTTGAACATCCATGAAAATCTCTTAGAATCACTTTTAGA  1036

Query 1023  ATTACAGGCCTATCCAGATGTTCAGGCAGTCCTAGCAAAATATGATGATATAAGCCTTCCAAAGTCAGCAGCAA  1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTACAGGCCTATCCAGATGTTCAGGCAGTCCTAGCAAAATATGATGATATAAGCCTTCCAAAGTCAGCAGCAA  1110

Query 1097  TCTGTTACACAGCAGCACTGTTGAAGACAAGGACTGTTTCAGAAAAATTCTCTCCAGAAACAGCCTCCAGAAGA  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTGTTACACAGCAGCACTGTTGAAGACAAGGACTGTTTCAGAAAAATTCTCTCCAGAAACAGCCTCCAGAAGA  1184

Query 1171  GGATTAAGCACAGCAGAAATTAATGCCGTGGAAGCAATTCATAGAGCTGTGGAATTTAATCCTCATGTTCCAAA  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGATTAAGCACAGCAGAAATTAATGCCGTGGAAGCAATTCATAGAGCTGTGGAATTTAATCCTCATGTTCCAAA  1258

Query 1245  ATATTTATTAGAGATGAAAAGTTTAATTTTACCTCCAGAACACATTCTGAAACGGGGTGATAGTGAAGCAATTG  1318
                                                                                      
Sbjct 1259  --------------------------------------------------------------------------  1258

Query 1319  CCTATGCTTTCTTTCATCTTCAGCACTGGAAACGAATAGAAGGTGCTCTTAATCTGTTACAGTGTACATGGGAA  1392
                                                                                      
Sbjct 1259  --------------------------------------------------------------------------  1258

Query 1393  GGCACTTTTAGAATGATTCCATACCCGTTAGAGAAAGGACATCTATTTTACCCTTATCCCAGCTGCACAGAGAC  1466
                                                                                      
Sbjct 1259  --------------------------------------------------------------------------  1258

Query 1467  GGCTGATAGAGAGCTATTACCTACCTTTCATCATGTTTCTGTTTACCCAAAAAAGGAGCTTCCTTTGTTCATCC  1540
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ----------------------ACCTTTCATCATGTTTCTGTTTACCCAAAAAAGGAGCTTCCTTTGTTCATCC  1310

Query 1541  ATTTCACAGCAGGATTTTGCTCTTCTACAGCAATGATAGCCATTCTCACTCACCAGTTTCCTGAAATCATGGGT  1614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  ATTTCACAGCAGGATTTTGCTCTTCTACAGCAATGATAGCCATTCTCACTCACCAGTTTCCTGAAATCATGGGT  1384

Query 1615  ATTTTTGCTAAAGCTGTGCTGGGACTCTGGT----GCCCCCAACCCTGGGCATCCTCAG-----GCT--TTGAG  1677
            |||||||||||||||||..|.|||     ||    .|||..||              ||     |||  ||.|.
Sbjct 1385  ATTTTTGCTAAAGCTGTAGTAGGA-----GTTAAAACCCAAAA--------------AGAAAATGCTGATTAAT  1439

Query 1678  GA-------------GAATACACAGGATTTGA-AGTCA--GAAGACCTAGGTTTGAGTTCTGGC  1725
            .|             |||.||||      ||| |..||  |||.|.||||...|.|        
Sbjct 1440  TATATTCCCAAAAATGAAAACAC------TGAGAACCATGGAAAAACTAGTCCTTA--------  1489