Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03844
• Subject: NM_001352968.2
• Aligned Length: 1680
• Identities: 1395
• Gaps: 285

Alignment

Query    1  ATGGGCTCCAGGATCAAGCAGAATCCAGAGACCACATTTGAAGTATATGTTGAAGTGGCCTATCCCAGGACAGG  74
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGTTGAAGTGGCCTATCCCAGGACAGG  28

Query   75  TGGCACTCTTTCAGATCCTGAGGTGCAGAGGCAATTCCCGGAGGACTACAGTGACCAGGAAGTTCTACAGACTT  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct   29  TGGCACTCTTTCAGATCCTGAGGTGCAGAGGCAATTCCCGGAGGACTACAGTGAC-------------------  83

Query  149  TGACCAAGTTTTGTTTCCCCTTCTATGTGGACAGCCTCACAGTTAGCCAAGTTGGCCAGAACTTCACATTCGTG  222
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   84  -------------------------------CAGCCTCACAGTTAGCCAAGTTGGCCAGAACTTCACATTCGTG  126

Query  223  CTCACTGACATTGACAGCAAACAGAGATTCGGGTTCTGCCGCTTATCTTCAGGAGCGAAGAGCTGCTTCTGTAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127  CTCACTGACATTGACAGCAAACAGAGATTCGGGTTCTGCCGCTTATCTTCAGGAGCGAAGAGCTGCTTCTGTAT  200

Query  297  CTTAAGCTATCTCCCCTGGTTCGAGGTATTTTATAAGCTGCTTAACATCCTGGCAGATTACACGACAAAAAGAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  CTTAAGCTATCTCCCCTGGTTCGAGGTATTTTATAAGCTGCTTAACATCCTGGCAGATTACACGACAAAAAGAC  274

Query  371  AGGAAAATCAGTGGAATGAGCTTCTTGAAACTCTGCACAAACTTCCCATCCCTGACCCAGGAGTGTCTGTCCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  AGGAAAATCAGTGGAATGAGCTTCTTGAAACTCTGCACAAACTTCCCATCCCTGACCCAGGAGTGTCTGTCCAT  348

Query  445  CTCAGCGTGCATTCTTATTTTACTGTGCCTGATACCAGAGAACTTCCCAGCATACCTGAGAATAGAAATCTGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  CTCAGCGTGCATTCTTATTTTACTGTGCCTGATACCAGAGAACTTCCCAGCATACCTGAGAATAGAAATCTGAC  422

Query  519  AGAATATTTTGTGGCTGTGGATGTTAACAACATGTTGCATCTGTACGCCAGTATGCTGTACGAACGCCGGATAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  AGAATATTTTGTGGCTGTGGATGTTAACAACATGTTGCATCTGTACGCCAGTATGCTGTACGAACGCCGGATAC  496

Query  593  TCATCATTTGCAGCAAACTCAGCACTCTGACTGCCTGCATCCACGGGTCTGCGGCGATGCTCTACCCCATGTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  TCATCATTTGCAGCAAACTCAGCACTCTGACTGCCTGCATCCACGGGTCTGCGGCGATGCTCTACCCCATGTAC  570

Query  667  TGGCAGCACGTGTACATCCCCGTGCTGCCGCCGCATCTGCTGGACTACTGCTGTGCTCCCATGCCCTACCTCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  TGGCAGCACGTGTACATCCCCGTGCTGCCGCCGCATCTGCTGGACTACTGCTGTGCTCCCATGCCCTACCTCAT  644

Query  741  AGGAATCCATTTAAGTTTAATGGAGAAAGTCAGAAACATGGCCCTGGATGATGTCGTGATCCTGAATGTGGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  AGGAATCCATTTAAGTTTAATGGAGAAAGTCAGAAACATGGCCCTGGATGATGTCGTGATCCTGAATGTGGACA  718

Query  815  CCAACACCCTGGAAACCCCCTTCGATGACCTCCAGAGCCTCCCAAACGACGTGATCTCTTCCCTGAAGAACAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  CCAACACCCTGGAAACCCCCTTCGATGACCTCCAGAGCCTCCCAAACGACGTGATCTCTTCCCTGAAGAACAGG  792

Query  889  CTGAAAAAGGTCTCCACAACCACTGGGGATGGTGTGGCCAGAGCGTTCCTCAAGGCCCAGGCTGCTTTCTTCGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  CTGAAAAAGGTCTCCACAACCACTGGGGATGGTGTGGCCAGAGCGTTCCTCAAGGCCCAGGCTGCTTTCTTCGG  866

Query  963  TAGCTACCGAAACGCTCTGAAAATCGAGCCGGAGGAGCCGATCACTTTCTGTGAGGAAGCCTTCGTGTCCCACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  TAGCTACCGAAACGCTCTGAAAATCGAGCCGGAGGAGCCGATCACTTTCTGTGAGGAAGCCTTCGTGTCCCACT  940

Query 1037  ACCGCTCCGGAGCCATGAGGCAGTTCCTGCAGAACGCCACACAGCTGCAGCTCTTCAAGCAGTTTATTGATGGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  ACCGCTCCGGAGCCATGAGGCAGTTCCTGCAGAACGCCACACAGCTGCAGCTCTTCAAGCAGTTTATTGATGGT  1014

Query 1111  CGATTAGATCTTCTCAATTCCGGCGAAGGTTTCAGTGATGTTTTTGAAGAGGAAATCAACATGGGCGAGTACGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  CGATTAGATCTTCTCAATTCCGGCGAAGGTTTCAGTGATGTTTTTGAAGAGGAAATCAACATGGGCGAGTACGC  1088

Query 1185  TGGCAGTGACAAACTGTACCATCAGTGGCTCTCCACTGTCCGGAAAGGAAGTGGAGCAATTCTGAATACTGTAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  TGGCAGTGACAAACTGTACCATCAGTGGCTCTCCACTGTCCGGAAAGGAAGTGGAGCAATTCTGAATACTGTAA  1162

Query 1259  AGACCAAAGCAAATCCGGCCATGAAGACTGTCTACAAGTTCGCAAAAGATCATGCAAAAATGGGAATAAAAGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  AGACCAAAGCAAATCCGGCCATGAAGACTGTCTACAAGTTCGCAAAAGATCATGCAAAAATGGGAATAAAAGAG  1236

Query 1333  GTGAAAAACCGCTTGAAGCAAAAGGACATTGCCGAGAATGGCTGCGCCCCCACCCCAGAAGAGCAGCTGCCAAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  GTGAAAAACCGCTTGAAGCAAAAGGACATTGCCGAGAATGGCTGCGCCCCCACCCCAGAAGAGCAGCTGCCAAA  1310

Query 1407  GACTGCACCGTCCCCACTGGTGGAGGCCAAGGACCCCAAGCTCCGAGAAGACCGGCGGCCAATCACAGTCCACT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  GACTGCACCGTCCCCACTGGTGGAGGCCAAGGACCCCAAGCTCCGAGAAGACCGGCGGCCAATCACAGTCCACT  1384

Query 1481  TTGGACAGG---TGCGCCCACCTCGTCCACATGTTGTTAAGAGACCAAAGAGCAACATCGCAGTGGAAGGCCGG  1551
            |||||||||   ||                                                            
Sbjct 1385  TTGGACAGGCGTTG------------------------------------------------------------  1398

Query 1552  AGGACGTCTGTGCCGAGCCCTGAGCAAAACACCATTGCAACACCAGCTACACTCCACATCCTACAGAAAAGCAT  1625
                                                                                      
Sbjct 1399  --------------------------------------------------------------------------  1398

Query 1626  TACCCATTTTGCGGCCAAGTTCCCGACGAGAGGCTGGACCTCTTCATCACAT  1677
                                                                
Sbjct 1399  ----------------------------------------------------  1398