Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05873
• Subject: NM_001693.4
• Aligned Length: 1533
• Identities: 1529
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGCTGCGGGCGATGCGGGGGATTGTCAACGGGGCCGCACCCGAGCTACCCGTGCCCACCGGTGGGCCGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCTGCGGGCGATGCGGGGGATTGTCAACGGGGCCGCACCCGAGCTACCCGTGCCCACCGGTGGGCCGGC  74

Query   75  GGNGGGAGCTCAGGAGCAGGCGCTGGCAGTCAGTCGGAACTACCTCTCCCAGCCTCGCCTCACATACAAGACAG  148
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTGGGAGCTCGGGAGCAGGCGCTGGCAGTCAGTCGGAACTACCTCTCCCAGCCTCGCCTCACATACAAGACAG  148

Query  149  TATCTGGAGTCAATGGTCCACTAGTGATCTTAGATCATGTTAAGTTTCCCAGGTATGCTGAAATTGTCCATTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TATCTGGAGTCAATGGTCCACTAGTGATCTTAGATCATGTTAAGTTTCCCAGGTATGCTGAAATTGTCCATTTG  222

Query  223  ACCTTACCGGATGGCACAAAGAGAAGTGGGCAAGTTCTGGAAGTTAGTGGTTCCAAGGCAGTAGTTCAGGTATT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCTTACCGGATGGCACAAAGAGAAGTGGGCAAGTTCTGGAAGTTAGTGGTTCCAAGGCAGTAGTTCAGGTATT  296

Query  297  TGAAGGGACTTCAGGTATAGATGCTAAGAAAACGTCCTGTGAGTTTACTGGGGATATTCTCCGAACACCGGTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGGGACTTCAGGTATAGATGCTAAGAAAACGTCCTGTGAGTTTACTGGGGATATTCTCCGAACACCGGTGT  370

Query  371  CTGAGGATATGCTTGGTCGGGTATTCAATGGATCGGGAAAACCCATTGACAGAGGTCCTGTTGTACTGGCCGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGAGGATATGCTTGGTCGGGTATTCAATGGATCGGGAAAACCCATTGACAGAGGTCCTGTTGTACTGGCCGAA  444

Query  445  GACTTCCTTGATATCATGGGTCAGCCAATCAACCCTCAATGTCGAATCTACCCAGAGGAAATGATTCGGACTGG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  445  GACTTCCTTGATATCATGGGTCAGCCAATCAACCCTCAATGTCGAATCTACCCAGAGGAAATGATTCAGACTGG  518

Query  519  CATTTCGGCCATCGATGGGATGAACAGTATTGCTAGGGGGCAGAAAATTCCTATCTTCTCTGCTGCTGGGCTAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATTTCGGCCATCGATGGGATGAACAGTATTGCTAGGGGGCAGAAAATTCCTATCTTCTCTGCTGCTGGGCTAC  592

Query  593  CACACAATGAGATTGCAGCTCAGATCTGTCGCCAGGCTGGTTTGGTAAAGAAATCCAAAGATGTAGTAGACTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACACAATGAGATTGCAGCTCAGATCTGTCGCCAGGCTGGTTTGGTAAAGAAATCCAAAGATGTAGTAGACTAC  666

Query  667  AGTGAGGAAAATTTTGCAATTGTATTTGCTGCTATGGGTGTAAACATGGAAACTGCCCGGTTCTTCAAATCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTGAGGAAAATTTTGCAATTGTATTTGCTGCTATGGGTGTAAACATGGAAACTGCCCGGTTCTTCAAATCTGA  740

Query  741  CTTTGAAGAAAATGGCTCAATGGACAATGTCTGCCTCTTTTTGAACTTGGCTAATGACCCAACCATTGAGCGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTTGAAGAAAATGGCTCAATGGACAATGTCTGCCTCTTTTTGAACTTGGCTAATGACCCAACCATTGAGCGAA  814

Query  815  TTATCACTCCTCGCCTGGCTCTAACCACAGCTGAATTTCTGGCGTACCAATGTGAGAAACATGTATTGGTTATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTATCACTCCTCGCCTGGCTCTAACCACAGCTGAATTTCTGGCGTACCAATGTGAGAAACATGTATTGGTTATT  888

Query  889  CTAACAGACATGAGTTCTTATGCTGAAGCACTTCGAGAGGTTTCAGCAGCCAGGGAAGAGGTACCTGGTCGACG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTAACAGACATGAGTTCTTATGCTGAAGCACTTCGAGAGGTTTCAGCAGCCAGGGAAGAGGTACCTGGTCGACG  962

Query  963  AGGTTTTCCAGGTTACATGTATACAGATTTAGCCACGATATATGAACGCGCTGGGCGAGTGGGAGGGAGAAACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  963  AGGTTTTCCAGGTTACATGTATACAGATTTAGCCACGATATATGAACGCGCTGGGCGAGTGGAAGGGAGAAACG  1036

Query 1037  GCTCGATTACTCAAATCCCTATTCTAACCATGCCTAATGATGATATCACTCACCCCATCCCAGACTTGACTGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTCGATTACTCAAATCCCTATTCTAACCATGCCTAATGATGATATCACTCACCCCATCCCAGACTTGACTGGC  1110

Query 1111  TACATTACAGAGGGGCAGATCTATGTGGACAGACAGCTGCACAACAGACAGATTTATCCACCTATCAATGTGCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACATTACAGAGGGGCAGATCTATGTGGACAGACAGCTGCACAACAGACAGATTTATCCACCTATCAATGTGCT  1184

Query 1185  GCCCTCACTATCACGGTTAATGAAGTCTGCTATTGGAGAAGGGATGACCAGGAAGGATCATGCCGATGTATCTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCCTCACTATCACGGTTAATGAAGTCTGCTATTGGAGAAGGGATGACCAGGAAGGATCATGCCGATGTATCTA  1258

Query 1259  ACCAGCTATATGCGTGCTATGCTATTGGAAAGGATGTGCAAGCCATGAAAGCTGTCGTTGGAGAAGAAGCCCTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCAGCTATATGCGTGCTATGCTATTGGAAAGGATGTGCAAGCCATGAAAGCTGTCGTTGGAGAAGAAGCCCTT  1332

Query 1333  ACCTCAGATGATCTTCTCTACTTGGAATTTCTGCAGAAGTTTGAGAGGAACTTCATTGCTCAGGGTCCTTACGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCTCAGATGATCTTCTCTACTTGGAATTTCTGCAGAAGTTTGAGAGGAACTTCATTGCTCAGGGTCCTTACGA  1406

Query 1407  AAATCGCACTGTCTTTGAGACTTTGGACATTGGCTGGCAGCTACTCCGAATCTTCCCCAAAGAAATGCTGAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAATCGCACTGTCTTTGAGACTTTGGACATTGGCTGGCAGCTACTCCGAATCTTCCCCAAAGAAATGCTGAAGA  1480

Query 1481  GAATCCCTCAGAGCACCCTCAGCGAATTTTACCCTCGAGACTCTGCAAAGCAT  1533
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAATCCCTCAGAGCACCCTCAGCGAATTTTACCCTCGAGACTCTGCAAAGCAT  1533