Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06849
• Subject: XM_011538642.3
• Aligned Length: 1436
• Identities: 841
• Gaps: 595

Alignment

Query    1  ATGCTGCTATCCGTGACTTCCAGGCCCGGGATTTCGACTTTTGGCTACAATAGAAACAACAAGAAGCCATATGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCACTGGCTCAGCAGATGGCACCACCTAGCCCAAGCAACAGTACACCTAACAGCAGTAGTGGAAGCAATGGAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGACCAGCTGAGCAAAACCAACCTATACATCCGAGGATTGCAACCAGGCACTACTGACCAAGATCTTGTCAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTGTGTCAGCCATATGGCAAGATTGTTTCCACTAAGGCCATACTGGACAAGACCACAAACAAATGTAAAGGCTA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGGCTTTGTAGATTTTGACAGCCCTTCAGCAGCACAGAAAGCTGTAACAGCACTGAAGGCCAGCGGTGTACAGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CACAGATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGATGAG  444
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----ATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGATGAG  69

Query  445  CAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGGGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  CAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGGGAC  143

Query  519  CAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATGGAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  CAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATGGAA  217

Query  593  AATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGGCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  AATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGGCCA  291

Query  667  AAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGTCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  AAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGTCAT  365

Query  741  GGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCAACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  GGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCAACA  439

Query  815  GGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAGACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  GGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAGACA  513

Query  889  TCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGTTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  TCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGTTCT  587

Query  963  GACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGGGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  GACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGGGCC  661

Query 1037  ATCTCTCCCTCAGCAGCACAGGCACGTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAGTAC  1110
            ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  ATCTCTCCCTCAGCAGCACA-----GTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAGTAC  730

Query 1111  ACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGAGAGCAGCGGCCAACAGAACCAAGTGGCAGTGGACGCACC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  ACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGAGAGCAGCGGCCAACAGAACCAAGTGGCAGTGGACGCACC  804

Query 1185  CTCAGAGCATGGGGTCTATTCTTTCCAGTTCAACAAG-------------------------------------  1221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  805  CTCAGAGCATGGGGTCTATTCTTTCCAGTTCAACAAGTAACAGTGGGCCTGGGCCTGGAAAAAGAAATCTCTAC  878

Query 1222  --------------------------------------------------------------------------  1221
                                                                                      
Sbjct  879  GTTCCTGCCCTTTACTATTGCTGATGGAGCCTGGGGGAACCATCACTTTTTTTGTGTGCTACATTCAAGGAGAT  952

Query 1222  --------------------------------------------------------------------------  1221
                                                                                      
Sbjct  953  CAAAAAAACTTTTCTTCTTTTGCAAAGAAAGCTTTTTGTTTTTAACTGCAACGTACTTTTCCCCTACCTTGAAG  1026

Query 1222  ------------------------------  1221
                                          
Sbjct 1027  AGACATGGTGGTCGCAGCTTCTCATCTATA  1056