Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06849
• Subject: XM_024449115.1
• Aligned Length: 1436
• Identities: 1126
• Gaps: 310

Alignment

Query    1  ATGCTGCTATCCGTGACTTCCAGGCCCGGGATTTCGACTTTTGGCTACAATAGAAACAACAAGAAGCCATATGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCACTGGCTCAGCAGATGGCACCACCTAGCCCAAGCAACAGTACACCTAACAGCAGTAGTGGAAGCAATGGAA  148
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------ATGGCACCACCTAGCCCAAGCAACAGTACACCTAACAGCAGTAGTGGAAGCAATGGAA  58

Query  149  ATGACCAGCTGAGCAAAACCAACCTATACATCCGAGGATTGCAACCAGGCACTACTGACCAAGATCTTGTCAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   59  ATGACCAGCTGAGCAAAACCAACCTATACATCCGAGGATTGCAACCAGGCACTACTGACCAAGATCTTGTCAAG  132

Query  223  CTGTGTCAGCCATATGGCAAGATTGTTTCCACTAAGGCCATACTGGACAAGACCACAAACAAATGTAAAGGCTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  133  CTGTGTCAGCCATATGGCAAGATTGTTTCCACTAAGGCCATACTGGACAAGACCACAAACAAATGTAAAGGCTA  206

Query  297  TGGCTTTGTAGATTTTGACAGCCCTTCAGCAGCACAGAAAGCTGTAACAGCACTGAAGGCCAGCGGTGTACAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  207  TGGCTTTGTAGATTTTGACAGCCCTTCAGCAGCACAGAAAGCTGTAACAGCACTGAAGGCCAGCGGTGTACAGG  280

Query  371  CACAGATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGATGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  CACAGATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGATGAG  354

Query  445  CAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGGGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  355  CAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGGGAC  428

Query  519  CAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATGGAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  CAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATGGAA  502

Query  593  AATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGGCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  503  AATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGGCCA  576

Query  667  AAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGTCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  AAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGTCAT  650

Query  741  GGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCAACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  GGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCAACA  724

Query  815  GGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAGACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  GGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAGACA  798

Query  889  TCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGTTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  TCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGTTCT  872

Query  963  GACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGGGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  GACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGGGCC  946

Query 1037  ATCTCTCCCTCAGCAGCACAGGCACGTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAGTAC  1110
            ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  ATCTCTCCCTCAGCAGCACA-----GTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAGTAC  1015

Query 1111  ACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGAGAGCAGCGGCCAACAGAACCAAGTGGCAGTGGACGCACC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  ACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGAGAGCAGCGGCCAACAGAACCAAGTGGCAGTGGACGCACC  1089

Query 1185  CTCAGAGCATGGGGTCTATTCTTTCCAGTTCAACAAG-------------------------------------  1221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct 1090  CTCAGAGCATGGGGTCTATTCTTTCCAGTTCAACAAGTAACAGTGGGCCTGGGCCTGGAAAAAGAAATCTCTAC  1163

Query 1222  --------------------------------------------------------------------------  1221
                                                                                      
Sbjct 1164  GTTCCTGCCCTTTACTATTGCTGATGGAGCCTGGGGGAACCATCACTTTTTTTGTGTGCTACATTCAAGGAGAT  1237

Query 1222  --------------------------------------------------------------------------  1221
                                                                                      
Sbjct 1238  CAAAAAAACTTTTCTTCTTTTGCAAAGAAAGCTTTTTGTTTTTAACTGCAACGTACTTTTCCCCTACCTTGAAG  1311

Query 1222  ------------------------------  1221
                                          
Sbjct 1312  AGACATGGTGGTCGCAGCTTCTCATCTATA  1341