Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07245
• Subject: XM_006507456.3
• Aligned Length: 2647
• Identities: 1877
• Gaps: 503

Alignment

Query    1  ATGGCTTCTGATGCTAGTCATGCGCTGGAAGCTGCCCTGGAGCAAATGGACGGGATCATTGCAGGCACTAAAAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGGTGCAGATCTTAGTGATGGTACTTGTGAGCCTGGACTGGCTTCCCCGGCCTCCTACATGAACCCCTTCCCGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCTCCATCTCATCGAGGACTTGAGGCTGGCCTTGGAGATGCTGGAGCTTCCTCAGGAGAGAGCAGCCCTCCTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGCCAGATCCCTGGCCCAACAGCTGCCTACATAAAGGAATGGTTTGAAGAGAGCTTGTCCCAGGTAAACCACCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAGTGCTGCTAGTAATGAAACCTACCAGGAACGCTTGGCACGTCTAGAAGGGGATAAGGAGTCCCTCATATTGC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AGGTGAGTGTCATCACAGACCAAGTAGAAGCCCAGGGAGAAAAGATTCGAGACCTGGAAGTGTGTCTGGAAGGA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  CACCAGGTGAAACTCAATGCTG------CTGAAGAGATGC---TT---CAACAGGAGCTGCTAAGCCGCACATC  506
                            ||||||      ||||.||||.||   ||   ||  |.|||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ----------------ATGCTGAAGCTCCTGAGGAGACGCAGATTGCCCA--ATGAGCTGCTAAGTCGCACATC  56

Query  507  TCTTGAGACCCAGAAGCTCGATCTGATGACTGAAGTGTCTGAGCTGAAGCTCAAGCTGGTTGGCATGGAGAAGG  580
            |||.||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct   57  TCTGGAGACCCAGAAGTTGGATCTGATGACTGAGGTGTCTGAGCTGAAGCTCAAGCTGGTTGGTATGGAAAAAG  130

Query  581  AGCAGAGAGAGCAGGAGGAGAAGCAGAGAAAAGCAGAGGAGTTACTGCAAGAGCTCAGGCACCTCAAAATCAAA  654
            |.||||.|||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.
Sbjct  131  AACAGAAAGAACAAGAAGAAAAACAGAGAAAAGCAGAGGAGTTACTGCAAGAGCTTAAGCACCTCAAAATCAAG  204

Query  655  GTGGAAGAGTTGGAAAATGAAAGGAATCAGTATGAATGGAAGCTAAAGGCCACTAAGGCTGAAGTCGCCCAGCT  728
            |||||.|||.||||.||.||..||||.||||||||.|||.||||.||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  205  GTGGAGGAGCTGGAGAACGAGCGGAACCAGTATGAGTGGGAGCTGAAGGCCACCAAGGCTGAGGTAGCCCAGCT  278

Query  729  GCAAGAACAGGTGGCCCTGAAAGATGCAGAAATTGAGCGTCTGCACAGCCAGCTCTCCCGGACAGCAGCTCTCC  802
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct  279  GCAAGAACAGGTGGCCCTAAAAGATGCAGAAATTGAGCGTCTCCACAGCCAGCTCTCCCGGAGTGCAGCTCTCC  352

Query  803  ACAGTGAGAGTCACACAGAGAGAGACCAAGAAATTCAACGTCTGAAAATGGGGATGGAAACTTTGCTGCTTGCC  876
            ||||.||   .||..|||||.||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||.|||||
Sbjct  353  ACAGCGA---CCATGCAGAGCGAGATCAAGAAATCCACCGTCTGAAAATGGGGATGGAAACACTGCTGGTTGCC  423

Query  877  AATGAAGATAAGGACCGTCGGATAGAGGAGCTTACGGGGCTGTTAAACCAGTACCGGAAGGTAAAGGAGATTGT  950
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||||..|.|||||||||||||||
Sbjct  424  AATGAGGATAAGGACCGTCGGATAGAGGAGCTGACAGGGCTGTTGAACAAGTACCTAAGGGTAAAGGAGATTGT  497

Query  951  GATGGTCACTCAAGGGCCTTCGGAGAGAACTCTCTCAATCAATGAAGAAGAACCGGAGGGAGGTTTCAGCAAGT  1024
            |||||..|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||...||||||.|.|||.|.||.|
Sbjct  498  GATGGCAACTCAGGGGCCTTCAGAAAGAACCCTCTCCATCAATGAAGATGAAATAGAGGGAAGCTTCCGAAAAT  571

Query 1025  GGAACGCTACAAATAAGGACCCTGAAGAATTATTTAAACAAGAGATGCCTCCAAGATGTAGCTCTCCTACAGTG  1098
            ||||..|.||||||||...|||.||.|||.|....||.||||||||..|.|||.||||.||||||||.||....
Sbjct  572  GGAATACCACAAATAAAAGCCCAGAGGAAGTCCCGAAGCAAGAGATATCACCACGATGCAGCTCTCCCACCCCA  645

Query 1099  GGGCCACCTCCATTGCCACAGAAATCACTGGAAACCAGGGCTCAGAAAAAGCTCTCTTGTAGTCTAGAAGACTT  1172
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  646  GGACCACCTCCTTTGCCACAGAAATCACTGGAGAGCAGGGCTCAGAAGAAACTCTCCTGCAGTCTAGAAGACTT  719

Query 1173  GAGAAGTGAATCTGTGGATAAGTGTATGGATGGGAACCAGCCCTTCCCGGTGTTAGAACCCAAGGACAGCCCTT  1246
            ||||.|||||||||.||||||||||.|.|||||||||||||..|.|||.|||..|||.||||||||||||.|||
Sbjct  720  GAGACGTGAATCTGGGGATAAGTGTGTCGATGGGAACCAGCTGTCCCCAGTGGGAGAGCCCAAGGACAGCTCTT  793

Query 1247  TCTTGGCGGAGCACAAATATCCCACTTTACCTGGGAAGCTTTCAGGAGCCACGCCCAATGGAGAGGCTGCCAAA  1320
            ||.|.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  794  TCCTAGCGGAGCAGAAATACCCCACATTACCTGGGAAGCTTTCAGGAGCCACACCCAATGGAGAAGCTGCCAAA  867

Query 1321  TCTCCTCCCACCATCTG-------CCAGCCTGACGCCACGGGGAGCAGCCTGCTGAGGCTGAGAGACACAGAAA  1387
            ||||||||||    |||       ||||||||||.|..|.||||||||||.||..|.||||||||||||||||.
Sbjct  868  TCTCCTCCCA----CTGCCTCCCTCCAGCCTGACTCTTCAGGGAGCAGCCAGCCAAAGCTGAGAGACACAGAAG  937

Query 1388  GTGGCTGGGATGACACTGCTGTGGTCAATGACCTCTCATCCACATCATCGGGCACTGAATCAGGTCCTCAGTCT  1461
            |.||||||||.||.|..|               |||||||..|.||.||.||.|||||.|||.|.|||||||||
Sbjct  938  GAGGCTGGGAAGATATAG---------------TCTCATCTGCTTCGTCTGGGACTGAGTCAAGCCCTCAGTCT  996

Query 1462  CCTCTGACACCAGATGGTAAACGGAATCCCAAAGGCATTAAGAAGTTCTGGGGAAAAATCCGAAGAACTCAGTC  1535
            ||..|||||||||||||.|||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  997  CCCGTGACACCAGATGGCAAACGGAGCCCCAAAGGCATTAAGAAGTTCTGGGGAAAGATCCGAAGAACTCAGTC  1070

Query 1536  AGGAAATTTCTACACTGACACGCTGGGGATGGCAGAGTTTCGACGAGGTGGGCTCCGGGCAACCGCAGGGCCAA  1609
            .|||||.|||.|.|||||..|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 1071  TGGAAACTTCAATACTGATGCACCGGGGATGGCAGAGTTTCGACGAGGTGGGCTCCGAGCAACTGCGGGACCAA  1144

Query 1610  GACTCTCTAGGACCAGGGACTCCAAGGGACAGAAAAGTGACGCCAATGCCCCCTTTGCCCAGTGGAGCACAGAG  1683
            |.||.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1145  GGCTTTCTAGGACCAGGGACACCAAGGGACAGAAATGTGATGCCAATGCCCCCTTTGCCCAGTGGAGCACAGAA  1218

Query 1684  CGTGTGTGTGCATGGCTGGAGGACTTTGGCCTGGCTCAGTATGTGATCTTTGCCAGGCAGTGGGTATCTTCTGG  1757
            ||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||..|.|||||
Sbjct 1219  CGCGTATGTACATGGATGGAGGATTTCGGCCTGGGTCAGTATGTGATCTTTGCCAGACAGTGGGTGACATCTGG  1292

Query 1758  CCACACCTTATTGACAGCCACCCCTCAGGACATGGAAAAGGAGCTAGGAATTAAGCACCCACTCCACAGGAAGA  1831
            .||.||..||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1293  ACATACACTACTGACAGCTACCCCTCAGGACATGGAAAAGGAGCTAGGGATTAAACACCCCCTCCACAGGAAGA  1366

Query 1832  AGCTTGTTTTAGCAGTGAAAGCCATCAACACCAAACAGGAGGAGAAGTCTGCACTGCTAGACCACATTTGGGTG  1905
            ||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.||.|.||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1367  AGCTGGTTTTAGCAGTGAAAGCTATCAACGCCAAGCAAGAAGAAACGTCTGCGCTGCTGGACCACATTTGGGTG  1440

Query 1906  ACAAGGTGGCTTGATGATATTGGCTTACCCCAGTACAAAGACCAGTTTCATGAATCTAGAGTTGACGGACGAAT  1979
            |||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1441  ACACGGTGGCTTGATGATATTGGCTTACCCCAATACAAAGACCAGTTTCATGAATCAAGAGTTGATGGGCGAAT  1514

Query 1980  GCTGCAATACCTAACTGTGAACGATTTACTCTTCTTAAAAGTCACCAGCCAACTACATCATCTCAGCATCAAAT  2053
            |||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1515  GCTGCAATACCTAACTGTGAATGATCTACTCTTCTTAAAAGTCACCAGCCAACTACATCATCTCAGCATCAAAT  1588

Query 2054  GTGCCATTCACGTGCTGCATGTCAACAAGTTCAACCCCCACTGCCTGCACCGGCGGCCAGCTGATGAGAGTAAC  2127
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 1589  GTGCTATTCACGTGCTACATGTCAACAAGTTCAACCCCAACTGCCTGCACAGGAGGCCTGCTGATGAGAGTAAC  1662

Query 2128  CTTTCTCCTTCAGAAGTTGTACAGTGGTCCAACCACAGGGTGATGGAGTGGTTACGATCTGTGGACCTGGCAGA  2201
            |||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1663  CTTTCCCCTTCCGAAGTTGTGCAGTGGTCCAACCACAGGGTAATGGAGTGGCTGCGATCCGTGGACCTGGCAGA  1736

Query 2202  GTATGCACCCAATCTTCGAGGGAGTGGAGTCCATGGAGGCCTCATTATCCTGGAGCCACGCTTCACTGGGGACA  2275
            ||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1737  GTATGCACCCAACCTTCGAGGGAGTGGCGTCCATGGCGGCCTCATTATCCTGGAGCCTCGCTTTACTGGGGACA  1810

Query 2276  CCCTGGCTATGCTTCTCAACATCCCCCCACAAAAGACGCTCCTCAGGCGCCACCTGACCACCAAGTTCAATGCC  2349
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1811  CCCTGGCTATGCTTCTTAACATCCCCCCACAGAAGACGCTCCTCAGGCGCCATCTGACCACCAAGTTCAACGCC  1884

Query 2350  TTGATTGGTCCGGAGGCTGAACAGGAAAAGCGAGAGAAAATGGCCTCACCAGCTTACACACCACTGACCACCAC  2423
            .||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1885  CTGATTGGTCCTGAGGCTGAACAGGAAAAGCGAGACAAAATGGCCTCACCCGCCTACACACCTCTGACCACCAC  1958

Query 2424  AGCCAAAGTCCGGCCAAGGAAACTAGGATTTTCACACTTCGGAAACATAAGAAAAAAGAAGTTCGATGAATCGA  2497
            .||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1959  CGCCAAAGTTCGGCCTAGGAAACTTGGATTTTCACATTTTGGAAACATGAGAAAAAAGAAGTTTGATGAATCTA  2032

Query 2498  CGGACTACATTTGCCCAATGGAGCCCAGTGACGGTGTCAGTGATAGTCACAGGGTCTACAGTGGCTACCGGGGC  2571
            |.||.|||||||||||.||||||||..|.||.|.|||||||||.||.||||||||||||.|.|.||||||||||
Sbjct 2033  CAGATTACATTTGCCCCATGGAGCCTGGAGATGCTGTCAGTGACAGCCACAGGGTCTACGGAGTCTACCGGGGC  2106

Query 2572  CTCAGCCCCCTTGATGCCCCTGAACTGGATGGGCTGGACCAGGTGGGACAGATCAGC  2628
            |||||.||||||||...||.||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2107  CTCAGTCCCCTTGACAACCATGAACTAGATGGTTTGGACCAGGTGGGACAGATAAGC  2163