Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07469
• Subject: NM_001159606.1
• Aligned Length: 1186
• Identities: 932
• Gaps: 242

Alignment

Query    1  MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGR  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGR  74

Query   75  SQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLP  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct   75  SQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNTSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGE----  144

Query  149  GKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMV  222
                                                                                      
Sbjct  145  --------------------------------------------------------------------------  144

Query  223  EYVLSSSPGDSCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFS  296
                                                                                      
Sbjct  145  --------------------------------------------------------------------------  144

Query  297  RTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVD  370
                                                                                      
Sbjct  145  --------------------------------------------------------------------------  144

Query  371  SAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAG  444
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  ----------------LFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAG  202

Query  445  LAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQN  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  LAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSATQQSAPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQN  276

Query  519  QQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSS  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  QQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSS  350

Query  593  AAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSSLFSQGSA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  351  AAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPSNNLASSSFYGNNSLSSNSQSSSLFSQGSA  424

Query  667  QPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLTPIGHSFYNGLSFSSS  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.|||
Sbjct  425  QPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLAPIGHSFYSSLSYSSS  498

Query  741  PGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSSTLFSS  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  PGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSSTLFSS  572

Query  815  SRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  573  SRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATAAERQLVFNEILQA  646

Query  889  AYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQNEMVRELDGHVL  962
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  AYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSHEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQNEMVRELDGHVL  720

Query  963  KCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQL  1036
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Sbjct  721  KCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQL  794

Query 1037  VQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGPHS  1110
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Sbjct  795  VQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGPHS  868

Query 1111  ALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNG  1184
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Sbjct  869  ALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNG  942

Query 1185  II  1186
            ||
Sbjct  943  II  944