Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07469
• Subject: NM_030722.2
• Aligned Length: 3567
• Identities: 3342
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA  74

Query   75  CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAGC  148

Query  149  CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGGACTCACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCTATAGGAGTTGCAGGCCGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGAACACACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCCATAGGAGTTGCAGGCCGT  222

Query  223  TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG  296

Query  297  AGGAGGCGGCTATAATAATAGCAAACATCGATGGCCTACTGGGGATAACATTCATGCAGAACATCAGGTGCGTT  370
            .||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  297  TGGAGGCGGCTATAATACTAGCAAACATCGATGGCCTACAGGGGATAACATTCATGCAGAACACCAGGTACGCT  370

Query  371  CCATGGATGAACTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAGGGAAGAGCGATGGGAGAGCAGCTCTTGCCA  444
            |.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CTATGGATGAATTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAAGGGAGAGCTATGGGCGAGCAGCTCTTGCCA  444

Query  445  GGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCG  518

Query  519  AGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTT  592

Query  593  TCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGATCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGGTCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTG  666

Query  667  GAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGATTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGATGCAGACAG  740
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGACTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGATGCAGACAG  740

Query  741  TGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG  814

Query  815  AGGGTGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTACCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTTAGC  888
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGGAGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTGCCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTTAGC  888

Query  889  CGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTTCTGAGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTTCTGAGGG  962

Query  963  CTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTGTCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTGTCC  1036

Query 1037  CCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTTCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTGTGGAC  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTGCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTGTGGAC  1110

Query 1111  TCAGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTGTTCCAAAGACCTAATGCGCTTGC  1184
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  TCTGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTATTCCAAAGACCCAATGCACTTGC  1184

Query 1185  TGTCCAGCAGTTGACAGCTGCTCAGCAGCAGCAGTATGCACTGGCAGCTGCTCATCAGCCGCACATC---GGTT  1255
            |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||   ||||
Sbjct 1185  TGTTCAGCAGTTGACAGCTGCCCAGCAGCAGCAGTATGCACTTGCAGCAGCCCACCAGCCTCACATCGCAGGTT  1258

Query 1256  TAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAATCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGACCCCTACACAGCT  1329
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAACCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGACCCCTACACAGCT  1332

Query 1330  GGATTGGCTGCAGCAGCGACACTAGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAGTATTATGGAGTTACTCCCTGGGGAGT  1403
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 1333  GGATTGGCTGCAGCAGCGACACTCGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAATATTATGGAGTCACGCCATGGGGTGT  1406

Query 1404  CTACCCTGCCAGTCTTTTCCAGCAGCAAGCTGCCGCTGCCGCTGCAGCAACTAATTCAGCTAATCAACAGACCA  1477
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.||.||.||||.|||.||||.|.
Sbjct 1407  CTACCCTGCCAGTCTCTTCCAGCAGCAGGCAGCTGCAGCTGCAGCAGCTACAAACTCTGCTACTCAGCAGAGCG  1480

Query 1478  CCCCACAGGCTCAGCAAGGACAGCAGCAGGTTCTCCGTGGAGGAGCCAGCCAACGTCCTTTGACCCCAAACCAG  1551
            |.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1481  CTCCGCAGGCCCAGCAGGGACAGCAGCAGGTTCTTCGTGGAGGAGCTAGCCAACGTCCTTTGACCCCAAATCAG  1554

Query 1552  AACCAGCAGGGACAGCAAACGGATCCCCTTGTGGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCCCTTGCATTTGGACAAGG  1625
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1555  AACCAGCAGGGACAACAAACAGATCCCCTTGTAGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCTCTTGCCTTTGGACAAGG  1628

Query 1626  TCTGGCAGCAGGCATGCCAGGTTATCCGGTGTTGGCTCCTGCTGCTTACTATGACCAAACTGGTGCCCTTGTAG  1699
            ..||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1629  ATTGGCTGCAGGTATGCCAGGTTATCCAGTCTTGGCACCTGCTGCTTACTATGACCAAACTGGTGCCCTTGTGG  1702

Query 1700  TGAATGCAGGCGCGAGAAATGGTCTTGGAGCTCCTGTTCGACTTGTAGCTCCTGCCCCAGTCATCATTAGTTCC  1773
            ||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  TGAATGCAGGGGCAAGAAATGGCCTCGGAGCTCCAGTCCGGCTTGTTGCTCCAGCCCCAGTCATCATTAGCTCC  1776

Query 1774  TCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCAGCCGCAGCTTCAGCAAATGGAGCAGCTGGTGGTCTTGCTGGAACAAC  1847
            ||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1777  TCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCGGCTGCAGCGTCAGCAAACGGAGCAGCTGGTGGTCTTGCCGGAACTAC  1850

Query 1848  AAATGGACCATTTCGCCCTTTAGGAACACAGCAGCCTCAGCCCCAGCCCCAGCAGCAGCCCAATAACAACCTGG  1921
            |||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 1851  AAATGGACCATTTCGACCTTTAGGCACCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCCTCAGCAGCAGCCCAGTAACAATCTGG  1924

Query 1922  CATCCAGTTCTTTCTACGGCAACAACTCTCTGAACAGCAATTCACAGAGCAGCTCCCTCTTCTCCCAGGGCTCT  1995
            |.|||||.||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1925  CTTCCAGCTCTTTCTATGGCAACAACTCTCTGAGCAGTAACTCCCAGAGCAGCTCCCTCTTCTCTCAGGGCTCT  1998

Query 1996  GCCCAGCCTGCCAACACATCCTTGGGATTCGGAAGTAGCAGTTCTCTCGGCGCCACCCTGGGATCCGCCCTTGG  2069
            ||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1999  GCACAGCCTGCCAACACGTCCTTGGGATTCGGAAGCAGCAGTTCCCTTGGTGCCACCCTGGGATCGGCCCTTGG  2072

Query 2070  AGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGACTCCCTGACTGGCAGCAGTG  2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGACTCCCTGACTGGCAGCAGTG  2146

Query 2144  ACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGACCCCCATTGGACACAGTTTTTATAACGGCCTTAGCTTTTCCTCC  2217
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||
Sbjct 2147  ACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGGCCCCCATTGGACACAGTTTTTATAGCAGCCTTAGCTATTCCTCC  2220

Query 2218  TCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAGACACCACCTCCTTCCCTCTC  2291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAGACACCACCTCCTTCCCTCTC  2294

Query 2292  TTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACGAACGGCAGTGGAAGATACATCTCTGCTGCTC  2365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACAAACGGCAGTGGAAGATACATCTCTGCTGCTC  2368

Query 2366  CAGGCGCTGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGCGCCTCCAGCCTCTTCAGCCCGAGCAGCACTCTTTTCTCT  2439
            |.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2369  CCGGTGCCGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGTGCCTCCAGCCTTTTCAGCCCCAGCAGCACCCTTTTTTCT  2442

Query 2440  TCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTCATGCCTTCTGGCAGGAGCAGGCTTTTGGAAGATTTTCGAAA  2513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct 2443  TCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTTATGCCCTCTGGCAGGAGCAGACTTCTGGAAGATTTTCGAAA  2516

Query 2514  CAACCGGTACCCCAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGACATATAATGGAATTTTCCCAAGACCAGCATGGGT  2587
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2517  CAACCGGTACCCTAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGGCATATAATGGAATTTTCTCAAGACCAGCATGGCT  2590

Query 2588  CCAGATTCATTCAGCTGAAACTGGAGCGTGCCACACCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAATGAAATCCTCCAG  2661
            |.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CTAGATTCATTCAGCTGAAACTAGAGCGTGCCACAGCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAATGAAATCCTCCAG  2664

Query 2662  GCTGCCTACCAACTCATGGTGGATGTGTTTGGTAATTACGTCATTCAGAAGTTCTTTGAATTTGGCAGTCTTGA  2735
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 2665  GCTGCGTACCAACTTATGGTGGATGTGTTTGGAAATTACGTCATTCAGAAGTTTTTTGAATTTGGCAGTCATGA  2738

Query 2736  ACAGAAGCTGGCTTTGGCAGAACGGATTCGAGGCCACGTCCTGTCATTGGCACTACAGATGTATGGCTGCCGTG  2809
            |||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 2739  ACAGAAGCTGGCTCTGGCTGAACGGATTCGAGGCCATGTCCTATCATTGGCACTGCAGATGTACGGCTGCCGAG  2812

Query 2810  TTATCCAGAAAGCTCTTGAGTTTATTCCTTCAGACCAGCAG------AATGAGATGGTTCGGGAACTAGATGGC  2877
            |.||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||      ||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 2813  TCATCCAGAAAGCTTTGGAGTTTATTCCCTCAGACCAGCAGGTAATTAACGAGATGGTGCGGGAGCTAGATGGC  2886

Query 2878  CATGTCTTGAAGTGTGTGAAAGATCAGAATGGCAATCACGTGGTTCAGAAATGCATTGAATGTGTACAGCCCCA  2951
            ||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2887  CATGTCCTGAAGTGTGTGAAAGACCAGAACGGCAACCATGTGGTTCAGAAGTGCATTGAGTGTGTACAGCCCCA  2960

Query 2952  GTCTTTGCAATTTATCATCGATGCGTTTAAGGGACAGGTATTTGCCTTATCCACACATCCTTATGGCTGCCGAG  3025
            |||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.||.|||||..|.|
Sbjct 2961  GTCTTTGCAGTTTATCATCGATGCATTCAAGGGGCAGGTGTTTGCTTTGTCTACGCACCCGTACGGCTGTAGGG  3034

Query 3026  TGATTCAGAGAATCCTGGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACACTCCCTATTTTAGAGGAGCTTCACCAGCACACA  3099
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TGATCCAGAGGATCCTAGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACCCTCCCCATCCTGGAGGAGCTTCACCAGCACACA  3108

Query 3100  GAGCAGCTTGTACAGGATCAATATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCACGGTCGTCCTGAGGATAA  3173
            |||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 3109  GAGCAGCTTGTGCAGGATCAGTATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCATGGTCGTCCTGAGGATAA  3182

Query 3174  AAGCAAAATTGTAGCAGAAATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAATTTGCAAGCAATGTTGTGG  3247
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 3183  AAGCAAAATTGTAGCAGAGATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAGTTTGCAAGCAATGTTGTGG  3256

Query 3248  AGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACGGAGCGCGCTGTGCTCATCGATGAGGTGTGCACCATGAACGACGGT  3321
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  AGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACAGAGCGTGCTGTGCTCATTGATGAGGTGTGCACCATGAACGACGGT  3330

Query 3322  CCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGACCAGTATGCCAACTACGTGGTCCAGAAGATGATTGACGTGGC  3395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 3331  CCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGATCAGTATGCTAACTATGTGGTCCAGAAGATGATCGATGTGGC  3404

Query 3396  GGAGCCAGGCCAGCGGAAGATCGTCATGCATAAGATCCGGCCCCACATCGCAACTCTTCGTAAGTACACCTATG  3469
            .|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 3405  TGAGCCGGGTCAGCGGAAGATTGTCATGCACAAGATCCGGCCACACATTGCGACGCTTCGAAAGTACACCTATG  3478

Query 3470  GCAAGCACATTCTGGCCAAGCTGGAGAAGTACTACATGAAGAACGGTGTTGACTTAGGGCCCATCTGTGGCCCC  3543
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 3479  GCAAGCACATCCTGGCCAAGCTCGAGAAGTACTACATGAAGAATGGCGTGGACTTGGGGCCCATTTGTGGTCCC  3552

Query 3544  CCTAATGGTATCATC  3558
            |||||||||||||||
Sbjct 3553  CCTAATGGTATCATC  3567