Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07469
• Subject: XM_006539301.3
• Aligned Length: 1193
• Identities: 1053
• Gaps: 128

Alignment

Query    1  MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGR  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  SQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLP  148
                                                          .||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct    1  ----------------------------------------------MVRSMDELNHDFQALALEGRAMGE-LLP  27

Query  149  GKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMV  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   28  GKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMV  101

Query  223  EYVLSSSPGDSCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFS  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  102  EYVLSSSPGDSCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFS  175

Query  297  RTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVD  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  176  RTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVD  249

Query  371  SAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHI-----GLAPAAFVPNPYIISAAPPGTD  439
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||
Sbjct  250  SAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIGMFPAGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTD  323

Query  440  PYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGASQRPL  513
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||||||
Sbjct  324  PYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSATQQSAPQAQQGQQQVLRGGASQRPL  397

Query  514  TPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPV  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  398  TPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPV  471

Query  588  IISSSAAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSSLF  661
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  472  IISSSAAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPSNNLASSSFYGNNSLSSNSQSSSLF  545

Query  662  SQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLTPIGHSFYNGL  735
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|
Sbjct  546  SQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLAPIGHSFYSSL  619

Query  736  SFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSS  809
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  620  SYSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSS  693

Query  810  TLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFN  883
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  694  TLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATAAERQLVFN  767

Query  884  EILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQ--NEMVR  955
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
Sbjct  768  EILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSHEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVINEMVR  841

Query  956  ELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEEL  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  ELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEEL  915

Query 1030  HQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCT  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  916  HQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCT  989

Query 1104  MNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGP  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  990  MNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGP  1063

Query 1178  ICGPPNGII  1186
            |||||||||
Sbjct 1064  ICGPPNGII  1072