Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07469
- Subject:
- XM_006539302.3
- Aligned Length:
- 3579
- Identities:
- 2908
- Gaps:
- 459
Alignment
Query 1 ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA 74
Query 75 CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAGC 148
Query 149 CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGGACTCACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCTATAGGAGTTGCAGGCCGT 222
||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGAACACACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCCATAGGAGTTGCAGGCCGT 222
Query 223 TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG 296
Query 297 AGGAGGCGGCTATAATAATAGCAAACATCGATGGCCTACTGGGGATAACATTCATGCAGAACATCAGGTGCGTT 370
.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 297 TGGAGGCGGCTATAATACTAGCAAACATCGATGGCCTACAGGGGATAACATTCATGCAGAACACCAGGTACGCT 370
Query 371 CCATGGATGAACTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAGGGAAGAGCGATGGGAGAGCAGCTCTTGCCA 444
|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CTATGGATGAATTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAAGGGAGAGCTATGGGCGAGCAGCTCTTGCCA 444
Query 445 GGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCG 518
Query 519 AGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTT 592
Query 593 TCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGATCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGGTCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTG 666
Query 667 GAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGATTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGATGCAGACAG 740
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGACTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTT-------------------- 720
Query 741 TGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG 814
Sbjct 721 -------------------------------------------------------------------------- 720
Query 815 AGGGTGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTACCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTTAGC 888
Sbjct 721 -------------------------------------------------------------------------- 720
Query 889 CGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTTCTGAGGG 962
Sbjct 721 -------------------------------------------------------------------------- 720
Query 963 CTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTGTCC 1036
Sbjct 721 -------------------------------------------------------------------------- 720
Query 1037 CCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTTCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTGTGGAC 1110
Sbjct 721 -------------------------------------------------------------------------- 720
Query 1111 TCAGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTGTTCCAAAGACCTAATGCGCTTGC 1184
||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 721 ------------------------------------------------CTATTCCAAAGACCCAATGCACTTGC 746
Query 1185 TGTCCAGCAGTTGACAGCTGCTCAGCAGCAGCAGTATGCACTGGCAGCTGCTCATCAGCCGCACATC------- 1251
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 747 TGTTCAGCAGTTGACAGCTGCCCAGCAGCAGCAGTATGCACTTGCAGCAGCCCACCAGCCTCACATCGGTATGT 820
Query 1252 --------GGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAATCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGAC 1317
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 TTCCAGCAGGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAACCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGAC 894
Query 1318 CCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTAGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAGTATTATGGAGTTAC 1391
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 895 CCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTCGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAATATTATGGAGTCAC 968
Query 1392 TCCCTGGGGAGTCTACCCTGCCAGTCTTTTCCAGCAGCAAGCTGCCGCTGCCGCTGCAGCAACTAATTCAGCTA 1465
.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.||.||.||||
Sbjct 969 GCCATGGGGTGTCTACCCTGCCAGTCTCTTCCAGCAGCAGGCAGCTGCAGCTGCAGCAGCTACAAACTCTGCTA 1042
Query 1466 ATCAACAGACCACCCCACAGGCTCAGCAAGGACAGCAGCAGGTTCTCCGTGGAGGAGCCAGCCAACGTCCTTTG 1539
.|||.||||.|.|.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1043 CTCAGCAGAGCGCTCCGCAGGCCCAGCAGGGACAGCAGCAGGTTCTTCGTGGAGGAGCTAGCCAACGTCCTTTG 1116
Query 1540 ACCCCAAACCAGAACCAGCAGGGACAGCAAACGGATCCCCTTGTGGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCCCTTGC 1613
||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1117 ACCCCAAATCAGAACCAGCAGGGACAACAAACAGATCCCCTTGTAGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCTCTTGC 1190
Query 1614 ATTTGGACAAGGTCTGGCAGCAGGCATGCCAGGTTATCCGGTGTTGGCTCCTGCTGCTTACTATGACCAAACTG 1687
.|||||||||||..||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 CTTTGGACAAGGATTGGCTGCAGGTATGCCAGGTTATCCAGTCTTGGCACCTGCTGCTTACTATGACCAAACTG 1264
Query 1688 GTGCCCTTGTAGTGAATGCAGGCGCGAGAAATGGTCTTGGAGCTCCTGTTCGACTTGTAGCTCCTGCCCCAGTC 1761
||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1265 GTGCCCTTGTGGTGAATGCAGGGGCAAGAAATGGCCTCGGAGCTCCAGTCCGGCTTGTTGCTCCAGCCCCAGTC 1338
Query 1762 ATCATTAGTTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCAGCCGCAGCTTCAGCAAATGGAGCAGCTGGTGGTCT 1835
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1339 ATCATTAGCTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCGGCTGCAGCGTCAGCAAACGGAGCAGCTGGTGGTCT 1412
Query 1836 TGCTGGAACAACAAATGGACCATTTCGCCCTTTAGGAACACAGCAGCCTCAGCCCCAGCCCCAGCAGCAGCCCA 1909
|||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1413 TGCCGGAACTACAAATGGACCATTTCGACCTTTAGGCACCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCCTCAGCAGCAGCCCA 1486
Query 1910 ATAACAACCTGGCATCCAGTTCTTTCTACGGCAACAACTCTCTGAACAGCAATTCACAGAGCAGCTCCCTCTTC 1983
.||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1487 GTAACAATCTGGCTTCCAGCTCTTTCTATGGCAACAACTCTCTGAGCAGTAACTCCCAGAGCAGCTCCCTCTTC 1560
Query 1984 TCCCAGGGCTCTGCCCAGCCTGCCAACACATCCTTGGGATTCGGAAGTAGCAGTTCTCTCGGCGCCACCCTGGG 2057
||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1561 TCTCAGGGCTCTGCACAGCCTGCCAACACGTCCTTGGGATTCGGAAGCAGCAGTTCCCTTGGTGCCACCCTGGG 1634
Query 2058 ATCCGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGACTCCCTGA 2131
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1635 ATCGGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGACTCCCTGA 1708
Query 2132 CTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGACCCCCATTGGACACAGTTTTTATAACGGCCTT 2205
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 1709 CTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGGCCCCCATTGGACACAGTTTTTATAGCAGCCTT 1782
Query 2206 AGCTTTTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAGACACCACC 2279
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 AGCTATTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAGACACCACC 1856
Query 2280 TCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACGAACGGCAGTGGAAGATACA 2353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1857 TCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACAAACGGCAGTGGAAGATACA 1930
Query 2354 TCTCTGCTGCTCCAGGCGCTGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGCGCCTCCAGCCTCTTCAGCCCGAGCAGC 2427
|||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1931 TCTCTGCTGCTCCCGGTGCCGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGTGCCTCCAGCCTTTTCAGCCCCAGCAGC 2004
Query 2428 ACTCTTTTCTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTCATGCCTTCTGGCAGGAGCAGGCTTTTGGA 2501
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 2005 ACCCTTTTTTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTTATGCCCTCTGGCAGGAGCAGACTTCTGGA 2078
Query 2502 AGATTTTCGAAACAACCGGTACCCCAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGACATATAATGGAATTTTCCCAAG 2575
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2079 AGATTTTCGAAACAACCGGTACCCTAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGGCATATAATGGAATTTTCTCAAG 2152
Query 2576 ACCAGCATGGGTCCAGATTCATTCAGCTGAAACTGGAGCGTGCCACACCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAAT 2649
||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2153 ACCAGCATGGCTCTAGATTCATTCAGCTGAAACTAGAGCGTGCCACAGCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAAT 2226
Query 2650 GAAATCCTCCAGGCTGCCTACCAACTCATGGTGGATGTGTTTGGTAATTACGTCATTCAGAAGTTCTTTGAATT 2723
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2227 GAAATCCTCCAGGCTGCGTACCAACTTATGGTGGATGTGTTTGGAAATTACGTCATTCAGAAGTTTTTTGAATT 2300
Query 2724 TGGCAGTCTTGAACAGAAGCTGGCTTTGGCAGAACGGATTCGAGGCCACGTCCTGTCATTGGCACTACAGATGT 2797
||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2301 TGGCAGTCATGAACAGAAGCTGGCTCTGGCTGAACGGATTCGAGGCCATGTCCTATCATTGGCACTGCAGATGT 2374
Query 2798 ATGGCTGCCGTGTTATCCAGAAAGCTCTTGAGTTTATTCCTTCAGACCAGCAG------AATGAGATGGTTCGG 2865
|.||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||| ||.||||||||.|||
Sbjct 2375 ACGGCTGCCGAGTCATCCAGAAAGCTTTGGAGTTTATTCCCTCAGACCAGCAGGTAATTAACGAGATGGTGCGG 2448
Query 2866 GAACTAGATGGCCATGTCTTGAAGTGTGTGAAAGATCAGAATGGCAATCACGTGGTTCAGAAATGCATTGAATG 2939
||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 2449 GAGCTAGATGGCCATGTCCTGAAGTGTGTGAAAGACCAGAACGGCAACCATGTGGTTCAGAAGTGCATTGAGTG 2522
Query 2940 TGTACAGCCCCAGTCTTTGCAATTTATCATCGATGCGTTTAAGGGACAGGTATTTGCCTTATCCACACATCCTT 3013
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.|
Sbjct 2523 TGTACAGCCCCAGTCTTTGCAGTTTATCATCGATGCATTCAAGGGGCAGGTGTTTGCTTTGTCTACGCACCCGT 2596
Query 3014 ATGGCTGCCGAGTGATTCAGAGAATCCTGGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACACTCCCTATTTTAGAGGAGCTT 3087
|.|||||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.|||||||||
Sbjct 2597 ACGGCTGTAGGGTGATCCAGAGGATCCTAGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACCCTCCCCATCCTGGAGGAGCTT 2670
Query 3088 CACCAGCACACAGAGCAGCTTGTACAGGATCAATATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCACGGTCG 3161
|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2671 CACCAGCACACAGAGCAGCTTGTGCAGGATCAGTATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCATGGTCG 2744
Query 3162 TCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAAATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAATTTGCAA 3235
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2745 TCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAGATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAGTTTGCAA 2818
Query 3236 GCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACGGAGCGCGCTGTGCTCATCGATGAGGTGTGCACC 3309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2819 GCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACAGAGCGTGCTGTGCTCATTGATGAGGTGTGCACC 2892
Query 3310 ATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGACCAGTATGCCAACTACGTGGTCCAGAAGAT 3383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 2893 ATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGATCAGTATGCTAACTATGTGGTCCAGAAGAT 2966
Query 3384 GATTGACGTGGCGGAGCCAGGCCAGCGGAAGATCGTCATGCATAAGATCCGGCCCCACATCGCAACTCTTCGTA 3457
|||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 2967 GATCGATGTGGCTGAGCCGGGTCAGCGGAAGATTGTCATGCACAAGATCCGGCCACACATTGCGACGCTTCGAA 3040
Query 3458 AGTACACCTATGGCAAGCACATTCTGGCCAAGCTGGAGAAGTACTACATGAAGAACGGTGTTGACTTAGGGCCC 3531
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 3041 AGTACACCTATGGCAAGCACATCCTGGCCAAGCTCGAGAAGTACTACATGAAGAATGGCGTGGACTTGGGGCCC 3114
Query 3532 ATCTGTGGCCCCCCTAATGGTATCATC 3558
||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 3115 ATTTGTGGTCCCCCTAATGGTATCATC 3141
