Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07469
Subject:
XM_006539305.3
Aligned Length:
1198
Identities:
947
Gaps:
207

Alignment

Query    1  MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGR  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  SQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLP  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVS-----QPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGL  217
                            .||....|....|..|....|     .|....... .|...|.|              
Sbjct    1  ----------------MIFKHLLWKGELWASSCQVKSFGKQMNPAKMDQKE-YSWVINGE--------------  43

Query  218  GVSMVEYVLSSSPGDSCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDAD  291
                      ..||..      .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   44  ----------TVPGEH------QGPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDAD  101

Query  292  VKDFSRTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGT  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  102  VKDFSRTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGT  175

Query  366  QVPVDSAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHI-----GLAPAAFVPNPYIISAA  434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||
Sbjct  176  QVPVDSAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIGMFPAGLAPAAFVPNPYIISAA  249

Query  435  PPGTDPYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGA  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||||
Sbjct  250  PPGTDPYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSATQQSAPQAQQGQQQVLRGGA  323

Query  509  SQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLV  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  324  SQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLV  397

Query  583  APAPVIISSSAAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQ  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  398  APAPVIISSSAAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPSNNLASSSFYGNNSLSSNSQ  471

Query  657  SSSLFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLTPIGHS  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  472  SSSLFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLAPIGHS  545

Query  731  FYNGLSFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSL  804
            ||..||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  546  FYSSLSYSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSL  619

Query  805  FSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAER  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  620  FSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATAAER  693

Query  879  QLVFNEILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQ--  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  694  QLVFNEILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSHEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVI  767

Query  951  NEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLP  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  768  NEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLP  841

Query 1025  ILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLI  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  ILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLI  915

Query 1099  DEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNG  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  916  DEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNG  989

Query 1173  VDLGPICGPPNGII  1186
            ||||||||||||||
Sbjct  990  VDLGPICGPPNGII  1003