Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07469
- Subject:
- XM_006539309.3
- Aligned Length:
- 3567
- Identities:
- 2622
- Gaps:
- 735
Alignment
Query 1 ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA 74
Query 75 CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAGC 148
Query 149 CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGGACTCACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCTATAGGAGTTGCAGGCCGT 222
||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGAACACACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCCATAGGAGTTGCAGGCCGT 222
Query 223 TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG 296
Query 297 AGGAGGCGGCTATAATAATAGCAAACATCGATGGCCTACTGGGGATAACATTCATGCAGAACATCAGGTGCGTT 370
.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 297 TGGAGGCGGCTATAATACTAGCAAACATCGATGGCCTACAGGGGATAACATTCATGCAGAACACCAGGTACGCT 370
Query 371 CCATGGATGAACTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAGGGAAGAGCGATGGGAGAGCAGCTCTTGCCA 444
|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 371 CTATGGATGAATTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAAGGGAGAGCTATGGGCG-------------- 430
Query 445 GGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCG 518
Sbjct 431 -------------------------------------------------------------------------- 430
Query 519 AGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTT 592
Sbjct 431 -------------------------------------------------------------------------- 430
Query 593 TCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGATCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTG 666
Sbjct 431 -------------------------------------------------------------------------- 430
Query 667 GAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGATTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGATGCAGACAG 740
Sbjct 431 -------------------------------------------------------------------------- 430
Query 741 TGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG 814
Sbjct 431 -------------------------------------------------------------------------- 430
Query 815 AGGGTGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTACCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTTAGC 888
Sbjct 431 -------------------------------------------------------------------------- 430
Query 889 CGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTTCTGAGGG 962
Sbjct 431 -------------------------------------------------------------------------- 430
Query 963 CTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTGTCC 1036
Sbjct 431 -------------------------------------------------------------------------- 430
Query 1037 CCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTTCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTGTGGAC 1110
Sbjct 431 -------------------------------------------------------------------------- 430
Query 1111 TCAGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTGTTCCAAAGACCTAATGCGCTTGC 1184
||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 431 ----------------------------------------------AGCTATTCCAAAGACCCAATGCACTTGC 458
Query 1185 TGTCCAGCAGTTGACAGCTGCTCAGCAGCAGCAGTATGCACTGGCAGCTGCTCATCAGCCGCACATC---GGTT 1255
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||| ||||
Sbjct 459 TGTTCAGCAGTTGACAGCTGCCCAGCAGCAGCAGTATGCACTTGCAGCAGCCCACCAGCCTCACATCGCAGGTT 532
Query 1256 TAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAATCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGACCCCTACACAGCT 1329
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 TAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAACCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGACCCCTACACAGCT 606
Query 1330 GGATTGGCTGCAGCAGCGACACTAGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAGTATTATGGAGTTACTCCCTGGGGAGT 1403
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 607 GGATTGGCTGCAGCAGCGACACTCGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAATATTATGGAGTCACGCCATGGGGTGT 680
Query 1404 CTACCCTGCCAGTCTTTTCCAGCAGCAAGCTGCCGCTGCCGCTGCAGCAACTAATTCAGCTAATCAACAGACCA 1477
|||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.||.||.||||.|||.||||.|.
Sbjct 681 CTACCCTGCCAGTCTCTTCCAGCAGCAGGCAGCTGCAGCTGCAGCAGCTACAAACTCTGCTACTCAGCAGAGCG 754
Query 1478 CCCCACAGGCTCAGCAAGGACAGCAGCAGGTTCTCCGTGGAGGAGCCAGCCAACGTCCTTTGACCCCAAACCAG 1551
|.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 755 CTCCGCAGGCCCAGCAGGGACAGCAGCAGGTTCTTCGTGGAGGAGCTAGCCAACGTCCTTTGACCCCAAATCAG 828
Query 1552 AACCAGCAGGGACAGCAAACGGATCCCCTTGTGGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCCCTTGCATTTGGACAAGG 1625
||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 829 AACCAGCAGGGACAACAAACAGATCCCCTTGTAGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCTCTTGCCTTTGGACAAGG 902
Query 1626 TCTGGCAGCAGGCATGCCAGGTTATCCGGTGTTGGCTCCTGCTGCTTACTATGACCAAACTGGTGCCCTTGTAG 1699
..||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 903 ATTGGCTGCAGGTATGCCAGGTTATCCAGTCTTGGCACCTGCTGCTTACTATGACCAAACTGGTGCCCTTGTGG 976
Query 1700 TGAATGCAGGCGCGAGAAATGGTCTTGGAGCTCCTGTTCGACTTGTAGCTCCTGCCCCAGTCATCATTAGTTCC 1773
||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 977 TGAATGCAGGGGCAAGAAATGGCCTCGGAGCTCCAGTCCGGCTTGTTGCTCCAGCCCCAGTCATCATTAGCTCC 1050
Query 1774 TCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCAGCCGCAGCTTCAGCAAATGGAGCAGCTGGTGGTCTTGCTGGAACAAC 1847
||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1051 TCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCGGCTGCAGCGTCAGCAAACGGAGCAGCTGGTGGTCTTGCCGGAACTAC 1124
Query 1848 AAATGGACCATTTCGCCCTTTAGGAACACAGCAGCCTCAGCCCCAGCCCCAGCAGCAGCCCAATAACAACCTGG 1921
|||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 1125 AAATGGACCATTTCGACCTTTAGGCACCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCCTCAGCAGCAGCCCAGTAACAATCTGG 1198
Query 1922 CATCCAGTTCTTTCTACGGCAACAACTCTCTGAACAGCAATTCACAGAGCAGCTCCCTCTTCTCCCAGGGCTCT 1995
|.|||||.||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1199 CTTCCAGCTCTTTCTATGGCAACAACTCTCTGAGCAGTAACTCCCAGAGCAGCTCCCTCTTCTCTCAGGGCTCT 1272
Query 1996 GCCCAGCCTGCCAACACATCCTTGGGATTCGGAAGTAGCAGTTCTCTCGGCGCCACCCTGGGATCCGCCCTTGG 2069
||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1273 GCACAGCCTGCCAACACGTCCTTGGGATTCGGAAGCAGCAGTTCCCTTGGTGCCACCCTGGGATCGGCCCTTGG 1346
Query 2070 AGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGACTCCCTGACTGGCAGCAGTG 2143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1347 AGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGACTCCCTGACTGGCAGCAGTG 1420
Query 2144 ACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGACCCCCATTGGACACAGTTTTTATAACGGCCTTAGCTTTTCCTCC 2217
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||
Sbjct 1421 ACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGGCCCCCATTGGACACAGTTTTTATAGCAGCCTTAGCTATTCCTCC 1494
Query 2218 TCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAGACACCACCTCCTTCCCTCTC 2291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 TCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAGACACCACCTCCTTCCCTCTC 1568
Query 2292 TTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACGAACGGCAGTGGAAGATACATCTCTGCTGCTC 2365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1569 TTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACAAACGGCAGTGGAAGATACATCTCTGCTGCTC 1642
Query 2366 CAGGCGCTGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGCGCCTCCAGCCTCTTCAGCCCGAGCAGCACTCTTTTCTCT 2439
|.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1643 CCGGTGCCGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGTGCCTCCAGCCTTTTCAGCCCCAGCAGCACCCTTTTTTCT 1716
Query 2440 TCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTCATGCCTTCTGGCAGGAGCAGGCTTTTGGAAGATTTTCGAAA 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct 1717 TCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTTATGCCCTCTGGCAGGAGCAGACTTCTGGAAGATTTTCGAAA 1790
Query 2514 CAACCGGTACCCCAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGACATATAATGGAATTTTCCCAAGACCAGCATGGGT 2587
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1791 CAACCGGTACCCTAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGGCATATAATGGAATTTTCTCAAGACCAGCATGGCT 1864
Query 2588 CCAGATTCATTCAGCTGAAACTGGAGCGTGCCACACCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAATGAAATCCTCCAG 2661
|.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1865 CTAGATTCATTCAGCTGAAACTAGAGCGTGCCACAGCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAATGAAATCCTCCAG 1938
Query 2662 GCTGCCTACCAACTCATGGTGGATGTGTTTGGTAATTACGTCATTCAGAAGTTCTTTGAATTTGGCAGTCTTGA 2735
|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 1939 GCTGCGTACCAACTTATGGTGGATGTGTTTGGAAATTACGTCATTCAGAAGTTTTTTGAATTTGGCAGTCATGA 2012
Query 2736 ACAGAAGCTGGCTTTGGCAGAACGGATTCGAGGCCACGTCCTGTCATTGGCACTACAGATGTATGGCTGCCGTG 2809
|||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 2013 ACAGAAGCTGGCTCTGGCTGAACGGATTCGAGGCCATGTCCTATCATTGGCACTGCAGATGTACGGCTGCCGAG 2086
Query 2810 TTATCCAGAAAGCTCTTGAGTTTATTCCTTCAGACCAGCAG------AATGAGATGGTTCGGGAACTAGATGGC 2877
|.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||| ||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 2087 TCATCCAGAAAGCTTTGGAGTTTATTCCCTCAGACCAGCAGGTAATTAACGAGATGGTGCGGGAGCTAGATGGC 2160
Query 2878 CATGTCTTGAAGTGTGTGAAAGATCAGAATGGCAATCACGTGGTTCAGAAATGCATTGAATGTGTACAGCCCCA 2951
||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2161 CATGTCCTGAAGTGTGTGAAAGACCAGAACGGCAACCATGTGGTTCAGAAGTGCATTGAGTGTGTACAGCCCCA 2234
Query 2952 GTCTTTGCAATTTATCATCGATGCGTTTAAGGGACAGGTATTTGCCTTATCCACACATCCTTATGGCTGCCGAG 3025
|||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.||.|||||..|.|
Sbjct 2235 GTCTTTGCAGTTTATCATCGATGCATTCAAGGGGCAGGTGTTTGCTTTGTCTACGCACCCGTACGGCTGTAGGG 2308
Query 3026 TGATTCAGAGAATCCTGGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACACTCCCTATTTTAGAGGAGCTTCACCAGCACACA 3099
||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2309 TGATCCAGAGGATCCTAGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACCCTCCCCATCCTGGAGGAGCTTCACCAGCACACA 2382
Query 3100 GAGCAGCTTGTACAGGATCAATATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCACGGTCGTCCTGAGGATAA 3173
|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2383 GAGCAGCTTGTGCAGGATCAGTATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCATGGTCGTCCTGAGGATAA 2456
Query 3174 AAGCAAAATTGTAGCAGAAATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAATTTGCAAGCAATGTTGTGG 3247
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2457 AAGCAAAATTGTAGCAGAGATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAGTTTGCAAGCAATGTTGTGG 2530
Query 3248 AGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACGGAGCGCGCTGTGCTCATCGATGAGGTGTGCACCATGAACGACGGT 3321
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2531 AGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACAGAGCGTGCTGTGCTCATTGATGAGGTGTGCACCATGAACGACGGT 2604
Query 3322 CCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGACCAGTATGCCAACTACGTGGTCCAGAAGATGATTGACGTGGC 3395
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 2605 CCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGATCAGTATGCTAACTATGTGGTCCAGAAGATGATCGATGTGGC 2678
Query 3396 GGAGCCAGGCCAGCGGAAGATCGTCATGCATAAGATCCGGCCCCACATCGCAACTCTTCGTAAGTACACCTATG 3469
.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 2679 TGAGCCGGGTCAGCGGAAGATTGTCATGCACAAGATCCGGCCACACATTGCGACGCTTCGAAAGTACACCTATG 2752
Query 3470 GCAAGCACATTCTGGCCAAGCTGGAGAAGTACTACATGAAGAACGGTGTTGACTTAGGGCCCATCTGTGGCCCC 3543
||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2753 GCAAGCACATCCTGGCCAAGCTCGAGAAGTACTACATGAAGAATGGCGTGGACTTGGGGCCCATTTGTGGTCCC 2826
Query 3544 CCTAATGGTATCATC 3558
|||||||||||||||
Sbjct 2827 CCTAATGGTATCATC 2841
